54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0329 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0329  ferredoxin  100 
 
 		 91 aa  181  3e-45  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.378645  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3190  2Fe-2S ferredoxin  41.03 
 
 		 95 aa  54.3  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.279692  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3929  ferredoxin  41.03 
 
 		 95 aa  54.3  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.23952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3190  hypothetical protein  37.18 
 
 		 95 aa  51.2  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.840017 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1528  ferredoxin  42.17 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4504  ferredoxin  38.46 
 
 		 102 aa  48.5  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.162196  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0760  ferredoxin, 2Fe-2S  36.36 
 
 		 95 aa  46.2  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3236  ferredoxin  53.19 
 
 		 97 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0839485 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2860  ferredoxin  53.19 
 
 		 97 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0269  ferredoxin  39.71 
 
 		 94 aa  46.2  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0503  ferredoxin  40 
 
 		 98 aa  45.1  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0530  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  38.16 
 
 		 352 aa  45.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0991  putative ring-hydroxylation complex protein 4  41.51 
 
 		 361 aa  45.1  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.153237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1662  ferredoxin (2Fe-2S)  47.83 
 
 		 128 aa  45.1  0.0003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0698  ferredoxin  47.17 
 
 		 144 aa  45.1  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000117119  normal  0.26661 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1231  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  41.51 
 
 		 364 aa  45.1  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4487  ferredoxin  36.05 
 
 		 98 aa  44.7  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2280  phenol hydrolase reductase  43.48 
 
 		 352 aa  44.7  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0696  ferredoxin (2Fe-2S)  47.83 
 
 		 132 aa  43.9  0.0008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2371  MOSC domain protein  31.4 
 
 		 369 aa  43.5  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159544  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1172  chlorosome envelope protein I  44.44 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.14427  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1546  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  31.52 
 
 		 354 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.729888  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3949  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  33.33 
 
 		 361 aa  43.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.413475 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0860  ferredoxin  31.4 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0001801  hitchhiker  0.0000609894 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1384  ferredoxin  32.53 
 
 		 618 aa  42.7  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.809303  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1733  ferredoxin  42.59 
 
 		 355 aa  43.5  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0101582  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3638  ferredoxin  36.21 
 
 		 119 aa  43.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2173  MOSC domain-containing protein  29.89 
 
 		 369 aa  43.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000104481  normal  0.521589 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3497  ferredoxin  47.83 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0543  ferredoxin  36.36 
 
 		 339 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00032188 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3215  ferredoxin  33.33 
 
 		 110 aa  42.7  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0952448 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2107  flavodoxin reductase (ferredoxin-NADPH reductase) family protein 1-like protein  32.91 
 
 		 336 aa  42.4  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.823248 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3155  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  40.74 
 
 		 353 aa  42.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1879  chlorosome envelope protein X  39.62 
 
 		 162 aa  42  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1782  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  33.8 
 
 		 356 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.241657  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00958  hypothetical protein  29.07 
 
 		 369 aa  41.2  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000157024  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2696  MOSC domain containing protein  29.07 
 
 		 369 aa  41.2  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000191244  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0289  putative iron-sulfur oxidoreductase, beta subunit  32.91 
 
 		 316 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.600768  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00951  predicted 2Fe-2S cluster-containing protein  29.07 
 
 		 369 aa  41.2  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000186571  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1154  ferredoxin  44.44 
 
 		 356 aa  41.6  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.548936 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2649  MOSC domain-containing protein  29.07 
 
 		 369 aa  41.2  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0311514  hitchhiker  0.00149416 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0814  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  39.62 
 
 		 365 aa  41.6  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.382172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1056  MOSC domain-containing protein  29.07 
 
 		 369 aa  41.2  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000706044  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4285  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  41.51 
 
 		 362 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.481656  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1110  MOSC domain protein  29.07 
 
 		 369 aa  41.2  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000289378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6022  ferredoxin  33.33 
 
 		 321 aa  41.2  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1061  MOSC domain-containing protein  29.07 
 
 		 369 aa  41.2  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000142563  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3846  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  34.21 
 
 		 346 aa  41.2  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.111631  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2678  ferredoxin  30.12 
 
 		 104 aa  41.2  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0350247  normal  0.431777 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1502  adenylate/guanylate cyclase  36.11 
 
 		 561 aa  40.8  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000770351  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2869  putative phenylacetic acid degradation NADH oxidoreductase paaE  41.51 
 
 		 337 aa  40.8  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.423535  normal  0.236927 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1374  ferredoxin  39.62 
 
 		 355 aa  40.4  0.008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000222813  normal  0.259595 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0471  benzoate 1,2-dioxygenase, ferredoxin reductase component  30.86 
 
 		 338 aa  40  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5549  phenoxybenzoate dioxygenase subunit beta  30 
 
 		 321 aa  40  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>