276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13280 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_13280  rubredoxin rubA  100 
 
 
55 aa  114  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.789329  normal  0.716019 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1743  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  74.07 
 
 
57 aa  92.8  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.884753  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4720  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  74.07 
 
 
57 aa  90.9  6e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.378789 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4212  Alkane 1-monooxygenase  75 
 
 
470 aa  90.1  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1370  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  81.13 
 
 
53 aa  89  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1334  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  77.36 
 
 
53 aa  86.3  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1351  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  77.36 
 
 
53 aa  86.3  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.359999  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2749  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  67.92 
 
 
53 aa  82  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0439  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  72 
 
 
172 aa  81.3  0.000000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.281329  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0441  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  64.15 
 
 
177 aa  80.1  0.000000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0132862  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5738  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  70.59 
 
 
54 aa  80.1  0.000000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0608  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  70 
 
 
172 aa  80.1  0.000000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.128184  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5440  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  64.81 
 
 
72 aa  80.1  0.000000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0366792  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0122  alkane 1-monooxygenase  62.5 
 
 
481 aa  75.5  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.174684  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0442  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  60 
 
 
132 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.059171  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0603  hypothetical protein  68.09 
 
 
63 aa  74.3  0.0000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000402214 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6127  rubredoxin  56.6 
 
 
55 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001294  rubredoxin-NAD(+) reductase  49.06 
 
 
477 aa  62  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.956005  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70630  rubredoxin 2  56.6 
 
 
55 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2626  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  52 
 
 
65 aa  59.3  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6128  rubredoxin 1  52.83 
 
 
55 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70640  rubredoxin 1  52.83 
 
 
55 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1190  putative rubredoxin protein  54.72 
 
 
54 aa  58.5  0.00000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.489682 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1200  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  54.72 
 
 
54 aa  58.5  0.00000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.196829  normal  0.959645 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1377  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  52.83 
 
 
55 aa  58.2  0.00000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.320132  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0559  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  52.94 
 
 
62 aa  58.2  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5371  rubredoxin/rubredoxin reductase  45.28 
 
 
461 aa  57  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.205307 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4403  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50.94 
 
 
55 aa  57  0.00000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.162271 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0972  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  56.25 
 
 
476 aa  56.2  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.425779 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0757  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  52 
 
 
469 aa  56.6  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0137  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  52.38 
 
 
589 aa  56.6  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.114513 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2316  rubredoxin  47.17 
 
 
56 aa  55.8  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1582  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  54.72 
 
 
54 aa  55.8  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1253  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  52.94 
 
 
54 aa  55.8  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000698268  hitchhiker  0.00824609 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2173  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  52.08 
 
 
415 aa  55.8  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.953962  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3355  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  45.1 
 
 
57 aa  55.5  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.862516  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5474  rubredoxin  49.06 
 
 
55 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1308  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50 
 
 
444 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0091  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  49.06 
 
 
54 aa  54.7  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.94635  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4855  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  49.06 
 
 
54 aa  55.1  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.802626  normal  0.0694189 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3022  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  45.1 
 
 
57 aa  54.7  0.0000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.133358  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2713  flavin reductase domain protein FMN-binding  46 
 
 
227 aa  54.3  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.120734 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1971  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  44.44 
 
 
127 aa  54.7  0.0000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.275422 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0680  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  47.17 
 
 
56 aa  53.9  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.807996  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3592  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  49.06 
 
 
55 aa  54.3  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2418  RubB protein  45.28 
 
 
55 aa  54.3  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0973  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  45.28 
 
 
52 aa  53.9  0.0000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000000469593  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1149  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50 
 
 
444 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.751699 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1288  flavin reductase-like, FMN-binding  42 
 
 
229 aa  53.9  0.0000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000609223 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2048  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  49.06 
 
 
52 aa  53.9  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.59994e-22 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1125  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  56.82 
 
 
53 aa  53.9  0.0000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.228048  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0197  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  47.17 
 
 
55 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.492346 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5315  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  49.06 
 
 
55 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0447169 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0158  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  49.06 
 
 
55 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.676785 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0014  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  54.55 
 
 
52 aa  53.1  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.25088  normal  0.171003 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5029  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  49.06 
 
 
55 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.651986  normal  0.30239 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28841  rubredoxin:rubrerythrin:rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  48.78 
 
 
235 aa  53.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3191  rubredoxin  47.92 
 
 
50 aa  53.1  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.423634  normal  0.232473 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5602  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  47.17 
 
 
55 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.681813  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0788  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  49.02 
 
 
56 aa  53.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.901493 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5224  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  49.06 
 
 
55 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.573132 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5363  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  49.06 
 
 
55 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.223368 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3286  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  45.28 
 
 
63 aa  53.1  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.552771  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13279  rubredoxin rubB  54 
 
 
60 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.610704  normal  0.724934 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48490  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  49.06 
 
 
55 aa  53.1  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.552989  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1538  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50 
 
 
237 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.029752 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1511  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50 
 
 
237 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3687  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  45.1 
 
 
59 aa  52.4  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.484857  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2186  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  49.06 
 
 
52 aa  52.8  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0152029  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0602  rubredoxin  44 
 
 
58 aa  52.8  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000399652 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2175  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  47.17 
 
 
52 aa  52.4  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.81123  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4666  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  47.92 
 
 
444 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00796628  normal  0.983667 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1780  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  43.14 
 
 
63 aa  52  0.000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.322429  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1851  rubredoxin  43.14 
 
 
63 aa  51.6  0.000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1135  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  43.14 
 
 
57 aa  52  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.74035  normal  0.399177 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4853  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50 
 
 
445 aa  52  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0852064 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1321  rubredoxin  44.44 
 
 
490 aa  51.6  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.920008  normal  0.0714632 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0238  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  46.15 
 
 
56 aa  52  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.24657  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1245  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  48.89 
 
 
284 aa  52  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0468502  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3672  rubredoxin  48 
 
 
57 aa  52  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0459184  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0270  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  45.28 
 
 
53 aa  51.2  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0460906  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02387  hypothetical protein  47.06 
 
 
70 aa  51.6  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.501645  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0272  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  45.28 
 
 
53 aa  51.2  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000689971  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0875  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  46 
 
 
52 aa  51.2  0.000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000124351  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2748  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50 
 
 
62 aa  51.2  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2210  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  46.67 
 
 
480 aa  51.2  0.000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0260  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  46.15 
 
 
56 aa  51.2  0.000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4627  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  43.14 
 
 
56 aa  50.8  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.529245  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0037  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  46.81 
 
 
455 aa  50.4  0.000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0146  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  43.75 
 
 
52 aa  50.4  0.000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.497635  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0979  beta-lactamase domain protein  36 
 
 
479 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00228257  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2624  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  40.38 
 
 
56 aa  50.4  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0605  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  43.4 
 
 
54 aa  50.4  0.000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0064851  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1444  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  54.76 
 
 
74 aa  50.4  0.000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1002  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  36 
 
 
479 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0118173  hitchhiker  0.000199326 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3173  rubredoxin  41.18 
 
 
91 aa  50.1  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.665694  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001301  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  41.3 
 
 
500 aa  50.4  0.000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.410803  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0668  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  40.38 
 
 
64 aa  50.1  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00929106  normal  0.799564 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3167  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  36 
 
 
479 aa  50.1  0.000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2994  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  36 
 
 
479 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>