223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10996 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10996  PE-PGRS family protein  100 
 
 
313 aa  583  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.7191000000000003e-35  normal  0.547752 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10998  PE-PGRS family protein  87.4 
 
 
457 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104383  normal  0.995085 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12634  PE-PGRS family protein  88.19 
 
 
461 aa  172  7.999999999999999e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000268791  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11480  PE-PGRS family protein  57.38 
 
 
737 aa  125  1e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.94455e-50  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13378  PE-PGRS family protein  55.69 
 
 
1570 aa  124  3e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.793451  normal  0.887646 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12868  PE-PGRS family protein  54.55 
 
 
663 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00218222  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10995  PE-PGRS family protein  52.31 
 
 
923 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  5.02084e-24  normal  0.770391 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11478  PE-PGRS family protein  58.2 
 
 
1407 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000217058  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11796  PE-PGRS family protein  57.69 
 
 
618 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000152846 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12014  PE-PGRS family protein  55.47 
 
 
558 aa  113  5e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10889  PE-PGRS family protein  53.08 
 
 
609 aa  112  8.000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.275087  normal  0.540095 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10588  PE-PGRS family protein  55.81 
 
 
1306 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00297042  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10849  PE-PGRS family protein  61.36 
 
 
879 aa  110  3e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.4370299999999996e-27  hitchhiker  0.00000147431 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11469  PE-PGRS family protein  56.49 
 
 
491 aa  108  1e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0503304  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13542  PE-PGRS family protein  61.42 
 
 
2332 aa  107  3e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000034434  hitchhiker  0.00332748 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11086  PE-PGRS family protein  51.56 
 
 
463 aa  106  4e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.21582e-33  normal  0.255 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13545  PE-PGRS family protein  54.69 
 
 
1888 aa  106  5e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000435663  hitchhiker  0.000141751 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13547  PE-PGRS family protein  61.42 
 
 
1086 aa  105  7e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.98986e-36  hitchhiker  0.0000786536 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12540  PE family protein  49.02 
 
 
492 aa  103  6e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000611241  hitchhiker  0.0026092 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12513  PE-PGRS family protein  50.41 
 
 
272 aa  102  7e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.7912e-70  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13623  PE-PGRS family protein  58.73 
 
 
584 aa  101  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  3.91824e-18  normal  0.0516609 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13628  PE-PGRS family protein  55.3 
 
 
439 aa  100  3e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000236295  normal  0.0644121 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12424  PE-PGRS family protein  54.4 
 
 
382 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.712465  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10110  PE-PGRS family protein  53.76 
 
 
533 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12611  PE-PGRS family protein  51.66 
 
 
543 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0987331  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13422  PE-PGRS family protein  48.44 
 
 
731 aa  96.7  5e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000255336  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  55.75 
 
 
1094 aa  95.9  7e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11105  PE-PGRS family protein  55.91 
 
 
779 aa  95.9  8e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  5.19894e-57  normal  0.745031 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1435  hypothetical protein  55.75 
 
 
335 aa  95.1  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.61404 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12754  PE-PGRS family protein  53.85 
 
 
565 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000417196  normal  0.0386161 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11834  PE-PGRS family protein  50.41 
 
 
650 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00239965  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13114  hypothetical protein  56.57 
 
 
437 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.773081 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11357  PE-PGRS family protein  51.97 
 
 
603 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0271727  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12653  PE-PGRS family protein  56.59 
 
 
788 aa  92  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000028408  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12192  PE-PGRS family protein  54.95 
 
 
532 aa  92  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.9578499999999997e-20  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  53.1 
 
 
1667 aa  90.5  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10125  PE-PGRS family protein  56.35 
 
 
561 aa  89.7  5e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000000011228  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11848  PE-PGRS family protein  56.92 
 
 
518 aa  89  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.114393  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5104  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  51.33 
 
 
366 aa  87.8  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  53.51 
 
 
810 aa  88.2  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12509  PE-PGRS family protein  56.82 
 
 
431 aa  86.7  5e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  9.90533e-20  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11085  PE-PGRS family protein  54.69 
 
 
667 aa  86.7  5e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  3.21525e-28  normal  0.25323 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11496  PE-PGRS family protein  55.47 
 
 
375 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000634061  normal  0.0755488 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10847  PE-PGRS family protein  53.17 
 
 
137 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.4239e-69  hitchhiker  0.000000132499 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  48.31 
 
 
819 aa  82.8  0.000000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6378  hypothetical protein  46.72 
 
 
556 aa  82.8  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.355816 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  50 
 
 
752 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000481443  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0107  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  55.65 
 
 
272 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0108  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  56.64 
 
 
354 aa  81.3  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11112  PE-PGRS family protein  55.91 
 
 
853 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000336586  normal  0.286221 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  49.09 
 
 
971 aa  80.1  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3263  hypothetical protein  53.33 
 
 
487 aa  79  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000325549  normal  0.271166 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0101  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  53.04 
 
 
354 aa  79  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1111  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  46.02 
 
 
415 aa  77.4  0.0000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0109  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  54.87 
 
 
354 aa  77.4  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11269  PE-PGRS family protein  54.03 
 
 
414 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000119088  hitchhiker  0.00152162 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11669  PE-PGRS family protein  46.88 
 
 
549 aa  76.6  0.0000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  8.43838e-17  normal  0.300456 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10284  PE-PGRS family protein  55.21 
 
 
372 aa  76.6  0.0000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.00543e-83  normal  0.307797 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11425  PE-PGRS family protein  53.97 
 
 
576 aa  75.9  0.0000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000000100458  normal  0.0951709 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11783  PE-PGRS family protein  55.71 
 
 
911 aa  75.9  0.0000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.68379e-22  hitchhiker  0.0000000263323 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  54.21 
 
 
689 aa  75.9  0.0000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2353  triple helix repeat-containing collagen  50.43 
 
 
580 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0162  hypothetical protein  47.11 
 
 
387 aa  74.7  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10760  PE-PGRS family protein  50 
 
 
783 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.45953e-26  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10304  PE-PGRS family protein  52.31 
 
 
622 aa  72.8  0.000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0360601  normal  0.165119 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0104  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  48.67 
 
 
353 aa  72.4  0.000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0874  cell surface protein  40.51 
 
 
332 aa  72  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.560524  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2393  hypothetical protein  50.43 
 
 
391 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0136177  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1651  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  42.48 
 
 
366 aa  71.6  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0495995  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5389  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  50.88 
 
 
365 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.187033  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11663  PE family protein  43.09 
 
 
310 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10285  PE-PGRS family protein  55.38 
 
 
906 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.9295399999999998e-51  normal  0.572415 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1813  hypothetical protein  43.28 
 
 
306 aa  70.1  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13403  PE-PGRS family protein  43.75 
 
 
591 aa  69.7  0.00000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000216419  normal  0.654566 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0102  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  51.3 
 
 
154 aa  70.1  0.00000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11868  PE-PGRS family protein  53.54 
 
 
515 aa  69.3  0.00000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000473061  normal  0.517398 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11459  PE family protein  56.84 
 
 
528 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.114453 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12351  PE family protein  40.34 
 
 
382 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3583  hypothetical protein  44.95 
 
 
1189 aa  67.4  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.970923  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10152  PE family protein  57.89 
 
 
588 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12364  PE-PGRS family protein  51.96 
 
 
413 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4855  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  44.54 
 
 
2114 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.656621  normal  0.707732 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10286  PE-PGRS family protein  54.65 
 
 
837 aa  66.2  0.0000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.18338e-28  normal  0.53963 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0103  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  51 
 
 
192 aa  65.9  0.0000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10161  PE family protein  41.45 
 
 
502 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00736493  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2189  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  38.69 
 
 
348 aa  65.9  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2380  hypothetical protein  37.17 
 
 
250 aa  65.1  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.110668  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3832  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  42.02 
 
 
607 aa  64.3  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000619199  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4384  hypothetical protein  38.94 
 
 
314 aa  65.1  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.491749  normal  0.153461 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2474  serine/threonine protein kinase  40 
 
 
776 aa  63.5  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000122678  hitchhiker  0.00951365 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2584  surface antigen gene  40.71 
 
 
479 aa  63.5  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.223545  normal  0.185762 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1750  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  45 
 
 
451 aa  62.8  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000566962  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2124  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  36.28 
 
 
320 aa  62  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0490929  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11197  PE family protein  47.97 
 
 
308 aa  62  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1180  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  36.44 
 
 
348 aa  61.2  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4419  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  41.18 
 
 
1170 aa  61.2  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.834695  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2907  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  35.71 
 
 
601 aa  61.6  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5020  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  36.45 
 
 
311 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0163627 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13541  PE-PGRS family protein  48.03 
 
 
1403 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.3382500000000002e-18  hitchhiker  0.000118269 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0895  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  41.24 
 
 
239 aa  60.5  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>