23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2294 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2294  hypothetical protein  100 
 
 		 278 aa  573  1.0000000000000001e-163  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.650616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2287  hypothetical protein  35.02 
 
 		 324 aa  160  2e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4197  glycosyl transferase family 8  31.76 
 
 		 302 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.772667 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4206  glycosyl transferase family 8  31.05 
 
 		 306 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1271  hypothetical protein  26.69 
 
 		 245 aa  101  1e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.926997  normal  0.593282 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4210  glycosyl transferase family 8  31.22 
 
 		 241 aa  95.5  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.499791 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3078  hypothetical protein  36.43 
 
 		 294 aa  85.5  9e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.772743  normal  0.632907 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44420  hypothetical protein  31.84 
 
 		 779 aa  80.9  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0208  hypothetical protein  29.03 
 
 		 236 aa  70.1  0.00000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0140  hypothetical protein  27.89 
 
 		 236 aa  68.6  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  hitchhiker  0.0050523  normal  0.0139125 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0179  hypothetical protein  27.89 
 
 		 236 aa  68.6  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.229321  normal  0.0559452 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25541  hypothetical protein  33.55 
 
 		 237 aa  68.2  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1513  hypothetical protein  27.91 
 
 		 232 aa  61.6  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0297183  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0058  lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  29.73 
 
 		 316 aa  51.2  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0031105  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0700  glycosyl transferase family 8  25.64 
 
 		 336 aa  48.1  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000278509  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0972  hypothetical protein  24.3 
 
 		 223 aa  47.8  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0416  hypothetical protein  25.94 
 
 		 233 aa  47.4  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1814  hypothetical protein  22.36 
 
 		 229 aa  47.4  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2733  glycosyl transferase family 8  28.65 
 
 		 301 aa  46.2  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.265669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0617  glycosyl transferase family 8  32.94 
 
 		 358 aa  45.1  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.170905  normal  0.336264 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5018  hypothetical protein  24.18 
 
 		 229 aa  44.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.595113 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2994  glycosyl transferase family 8  27.12 
 
 		 300 aa  43.9  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.162818  normal  0.206335 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2115  hypothetical protein  25.73 
 
 		 455 aa  42.4  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.641329  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>