38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1886 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1886  hypothetical protein  100 
 
 		 178 aa  367  1e-101  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.049709  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0441  hypothetical protein  68.1 
 
 		 164 aa  227  8e-59  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0546909  normal  0.625077 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22301  phycoerythrin linker protein CpeS  61.49 
 
 		 161 aa  208  4e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03381  phycoerythrin linker protein CpeS-like protein  52.3 
 
 		 178 aa  177  4.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4106  putative phycoerythrin-associated linker protein  47.16 
 
 		 173 aa  163  1.0000000000000001e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.954275  normal  0.539772 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4527  putative phycoerythrin-associated linker protein, CpeS  42.61 
 
 		 179 aa  152  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.447395  normal  0.851635 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5723  putative phycoerythrin-associated linker protein, CpeS  43.18 
 
 		 177 aa  151  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1677  CpeS-like protein  40.68 
 
 		 177 aa  147  7e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0252305  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0308  phycoerythrin linker protein CpeS-like  39.43 
 
 		 183 aa  132  3e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.244781  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03911  phycoerythrin linker protein CpeS  39.75 
 
 		 161 aa  128  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.142306  normal  0.0710975 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03401  phycoerythrin linker protein CpeS  36.93 
 
 		 183 aa  124  6e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  decreased coverage  0.000238694  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03311  phycoerythrin linker protein CpeS-like protein  41.81 
 
 		 182 aa  123  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.449065  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03301  phycoerythrin linker protein CpeS  39.55 
 
 		 183 aa  115  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.21635  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4549  hypothetical protein  35.23 
 
 		 188 aa  107  7.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1709  hypothetical protein  34.09 
 
 		 191 aa  102  3e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.853338  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2083  hypothetical protein  31.82 
 
 		 188 aa  95.1  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3908  hypothetical protein  33.33 
 
 		 196 aa  93.2  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2031  hypothetical protein  30.56 
 
 		 193 aa  89.4  2e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.495722  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3509  hypothetical protein  31.03 
 
 		 197 aa  90.1  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1382  hypothetical protein  32.04 
 
 		 200 aa  87  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.850718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1352  hypothetical protein  32.04 
 
 		 200 aa  87  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1416  hypothetical protein  30.11 
 
 		 176 aa  85.5  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1382  hypothetical protein  30.11 
 
 		 176 aa  85.1  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0424  hypothetical protein  30.29 
 
 		 203 aa  82.4  0.000000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.582381  normal  0.0559452 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4111  hypothetical protein  29.78 
 
 		 193 aa  82  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4521  hypothetical protein  27.22 
 
 		 194 aa  78.6  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1905  hypothetical protein  30.51 
 
 		 205 aa  76.3  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.876668  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5736  hypothetical protein  28.25 
 
 		 197 aa  76.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0571  hypothetical protein  28.65 
 
 		 172 aa  73.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3198  hypothetical protein  28.25 
 
 		 174 aa  73.6  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0243175  normal  0.0513618 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0400  hypothetical protein  28.49 
 
 		 198 aa  70.5  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2286  hypothetical protein  29.48 
 
 		 197 aa  70.5  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.122253 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2542  hypothetical protein  25.48 
 
 		 178 aa  49.3  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.831139  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1048  hypothetical protein  23.87 
 
 		 186 aa  48.5  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.48035  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0543  hypothetical protein  23.23 
 
 		 179 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0182  hypothetical protein  24.18 
 
 		 180 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0177  hypothetical protein  24.18 
 
 		 180 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00664238  normal  0.338946 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0889  hypothetical protein  32.79 
 
 		 153 aa  42  0.005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.438854  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>