40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1746 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1746  pfkB family carbohydrate kinase  100 
 
 
288 aa  565  1e-160  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.233467 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1813  pfkB family carbohydrate kinase  66.79 
 
 
309 aa  357  9.999999999999999e-98  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12381  putative pfkB family carbohydrate kinase  64.18 
 
 
283 aa  336  2.9999999999999997e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1055  PfkB family carbohydrate kinase  47.17 
 
 
289 aa  290  2e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.18758  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11481  putative pfkB family carbohydrate kinase  51.49 
 
 
280 aa  289  3e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.036183  normal  0.108302 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11491  putative pfkB family carbohydrate kinase  47.92 
 
 
289 aa  288  8e-77  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0717159  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11501  putative pfkB family carbohydrate kinase  47.55 
 
 
289 aa  287  2e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.605527  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11351  putative pfkB family carbohydrate kinase  46.79 
 
 
289 aa  286  2.9999999999999996e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0709  putative pfkB family carbohydrate kinase  52.96 
 
 
280 aa  280  2e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.19808  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15431  putative pfkB family carbohydrate kinase  52.59 
 
 
280 aa  279  3e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.345352  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0498  carbohydrate kinase, PfkB  41.2 
 
 
285 aa  129  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.130991  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0526  PfkB domain protein  39.63 
 
 
285 aa  129  6e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.387077  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0531  PfkB domain protein  39.63 
 
 
285 aa  129  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.239382  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1085  PfkB domain protein  43.56 
 
 
295 aa  124  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2912  ribokinase-like domain-containing protein  41.38 
 
 
290 aa  98.2  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.140234 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2764  PfkB domain protein  28.82 
 
 
289 aa  48.9  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.11778  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0077  PfkB  25.76 
 
 
299 aa  47.4  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.273667  normal  0.451983 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04580  Ribokinase  22.49 
 
 
306 aa  47.8  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3352  ribokinase family sugar kinase  45.33 
 
 
303 aa  47.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.38232  decreased coverage  0.00309735 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0924  ribokinase-like domain-containing protein  28.04 
 
 
305 aa  47  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.108155  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2117  PfkB domain protein  30 
 
 
338 aa  45.4  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.496872  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2296  PfkB domain-containing protein  28.97 
 
 
306 aa  45.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230241  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1789  ribokinase  23.49 
 
 
297 aa  45.4  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000225274  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4740  ribokinase-like domain-containing protein  26.69 
 
 
317 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2845  ribokinase-like domain-containing protein  26.07 
 
 
270 aa  44.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.50461  normal  0.552522 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3167  ribokinase  26.8 
 
 
295 aa  44.7  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0735  PfkB domain-containing protein  26.69 
 
 
317 aa  44.3  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.263465  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0147  ribokinase-like domain-containing protein  26.34 
 
 
318 aa  43.9  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.719935  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2877  ribokinase-like domain-containing protein  27.43 
 
 
300 aa  43.9  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.98714  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0109  ribokinase-like domain-containing protein  26.58 
 
 
335 aa  43.9  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0259  ribokinase  27.93 
 
 
304 aa  43.5  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0253  ribokinase  27.93 
 
 
304 aa  43.5  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  30.77 
 
 
305 aa  43.5  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0752  ribokinase-like domain-containing protein  24.66 
 
 
310 aa  43.5  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1802  ribokinase family sugar kinase  21.71 
 
 
306 aa  43.5  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00331295  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06142  ribokinase  25.17 
 
 
305 aa  43.1  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  33.9 
 
 
308 aa  42.7  0.007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3631  ribokinase  25.17 
 
 
304 aa  42.7  0.007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1142  PfkB  25.66 
 
 
310 aa  42.4  0.008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0676537  normal  0.093061 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2113  PfkB domain protein  28.22 
 
 
304 aa  42  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>