231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1635 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1635  rhodanese-like protein  100 
 
 
327 aa  680    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1395  rhodanese-like protein  75.42 
 
 
305 aa  487  1e-136  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10921  sulfurtransferase  57.81 
 
 
320 aa  374  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.261279 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09971  sulfurtransferase  56.31 
 
 
310 aa  368  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0654  rhodanese-like  55.22 
 
 
319 aa  364  1e-100  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.597958  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14861  sulfurtransferase  54.88 
 
 
319 aa  361  7.0000000000000005e-99  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.612505 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3401  Rhodanese domain protein  51.49 
 
 
309 aa  317  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0500445 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3823  hypothetical protein  49.84 
 
 
314 aa  312  3.9999999999999997e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.455102  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2319  rhodanese-like protein  49.52 
 
 
323 aa  312  4.999999999999999e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129535  hitchhiker  0.00245583 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3699  Rhodanese domain protein  51.51 
 
 
309 aa  312  4.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2825  rhodanese-like protein  51.52 
 
 
305 aa  309  2.9999999999999997e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257252  normal  0.124761 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0394  hypothetical protein  47.85 
 
 
337 aa  308  5.9999999999999995e-83  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.845819  hitchhiker  0.00000114431 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1312  hypothetical protein  47.65 
 
 
309 aa  308  6.999999999999999e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.406056 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0411  hypothetical protein  45.98 
 
 
352 aa  307  1.0000000000000001e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2130  hypothetical protein  46.33 
 
 
334 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0370  hypothetical protein  46.3 
 
 
352 aa  306  3e-82  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2524  rhodanese domain-containing protein  48.49 
 
 
327 aa  306  3e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2261  hypothetical protein  46.33 
 
 
330 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000101343  normal  0.473461 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2535  rhodanese domain-containing protein  46.15 
 
 
331 aa  305  1.0000000000000001e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.848457  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1760  hypothetical protein  46.33 
 
 
330 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0425355  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2290  hypothetical protein  46.33 
 
 
333 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1693  hypothetical protein  50.17 
 
 
312 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.782277  normal  0.169861 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2481  hypothetical protein  45 
 
 
334 aa  302  4.0000000000000003e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000192331  hitchhiker  0.000621581 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4090  hypothetical protein  49.33 
 
 
313 aa  302  5.000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3956  hypothetical protein  49.67 
 
 
310 aa  302  5.000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.765325  normal  0.0181852 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4661  hypothetical protein  50.79 
 
 
312 aa  302  6.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0559413  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2366  hypothetical protein  45 
 
 
334 aa  302  6.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000582492  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2378  hypothetical protein  45 
 
 
334 aa  302  6.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000317317  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53180  hypothetical protein  50.79 
 
 
312 aa  301  7.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0850  rhodanese domain-containing protein  52.51 
 
 
322 aa  301  7.000000000000001e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1758  hypothetical protein  49.67 
 
 
310 aa  301  8.000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.172624  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3658  hypothetical protein  49.04 
 
 
317 aa  301  9e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.451808  normal  0.392635 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1981  hypothetical protein  45 
 
 
334 aa  301  1e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000899017  hitchhiker  0.0000000957074 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1349  hypothetical protein  49.67 
 
 
310 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1734  rhodanese-like domain protein  48.73 
 
 
317 aa  300  2e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.668839  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3012  rhodanese domain-containing protein  45.82 
 
 
339 aa  300  3e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0115  rhodanese domain-containing protein  46.04 
 
 
306 aa  300  3e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4798  hypothetical protein  47.16 
 
 
341 aa  299  4e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1781  hypothetical protein  46.18 
 
 
326 aa  299  4e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2100  hypothetical protein  46.15 
 
 
326 aa  299  4e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1677  rhodanese domain-containing protein  50.84 
 
 
311 aa  299  4e-80  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0239386 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1365  hypothetical protein  49.67 
 
 
310 aa  298  6e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.137534  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1838  hypothetical protein  45.33 
 
 
333 aa  298  7e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.287908  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3407  rhodanese domain-containing protein  44.15 
 
 
328 aa  298  9e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3429  rhodanese-like protein  49.83 
 
 
299 aa  297  2e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.59768  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2362  Rhodanese domain protein  46.62 
 
 
304 aa  296  3e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1535  hypothetical protein  44.74 
 
 
350 aa  296  4e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.242379  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3659  rhodanese domain-containing protein  50.17 
 
 
322 aa  295  5e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.245407  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0682  Rhodanese domain protein  48.99 
 
 
294 aa  295  9e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0088  hypothetical protein  48.56 
 
 
314 aa  294  1e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000143801  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12011  sulfurtransferase  43.18 
 
 
310 aa  294  2e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.303044  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2412  Rhodanese domain protein  47.97 
 
 
302 aa  293  3e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.579673  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0216  hypothetical protein  45.48 
 
 
326 aa  292  6e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.32074  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12001  sulfurtransferase  43.32 
 
 
310 aa  291  8e-78  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.982527  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0011  rhodanese-like protein  51.35 
 
 
301 aa  291  9e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.921465 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0964  hypothetical protein  45.97 
 
 
336 aa  291  1e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1105  rhodanese-like protein  44.26 
 
 
310 aa  289  4e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11851  sulfurtransferase  41.31 
 
 
310 aa  289  4e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.403922  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1973  rhodanese domain-containing protein  44.82 
 
 
332 aa  288  1e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000137009  normal  0.0153994 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2660  rhodanese domain-containing protein  46.85 
 
 
326 aa  287  2e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.918905  normal  0.0411957 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2782  rhodanese domain-containing protein  48.78 
 
 
315 aa  285  5.999999999999999e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01937  hypothetical protein  46.6 
 
 
323 aa  285  9e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00833582  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001128  rhodanese domain protein  44.69 
 
 
326 aa  284  1.0000000000000001e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000331641  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3348  rhodanese domain protein  50.16 
 
 
313 aa  284  2.0000000000000002e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.305803  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1091  rhodanese-like domain-containing protein  46 
 
 
305 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.96607  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4255  rhodanese domain-containing protein  47.12 
 
 
305 aa  281  1e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06657  hypothetical protein  44.05 
 
 
326 aa  280  2e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1939  rhodanese domain-containing protein  45.94 
 
 
316 aa  280  2e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0878  hypothetical protein  44.15 
 
 
332 aa  279  5e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000330025  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0081  rhodanese family protein  45.48 
 
 
305 aa  278  9e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.919299  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1235  rhodanese domain-containing protein  47.96 
 
 
312 aa  278  1e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0119154 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0086  rhodanese family protein  45.48 
 
 
308 aa  277  1e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3418  rhodanese domain-containing protein  47.83 
 
 
317 aa  277  2e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0529326  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2937  rhodanese-like protein  46.39 
 
 
316 aa  276  3e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.751975  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1961  rhodanese-like protein  46.28 
 
 
319 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2550  rhodanese domain-containing protein  48.4 
 
 
555 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0160345 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3915  rhodanese domain-containing protein  47.76 
 
 
257 aa  261  1e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2998  rhodanese-like sulfurtransferase  51.02 
 
 
255 aa  246  4.9999999999999997e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.317205  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1078  rhodanese-like protein  52.46 
 
 
255 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0473759  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2196  hypothetical protein  49.8 
 
 
255 aa  239  4e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.771085  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2897  hypothetical protein  44.49 
 
 
254 aa  236  3e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0147  rhodanese-like protein  49 
 
 
242 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.744417  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2750  hypothetical protein  44.08 
 
 
254 aa  231  2e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1135  rhodanese domain-containing protein  41.58 
 
 
275 aa  228  1e-58  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26565  predicted protein  39.16 
 
 
346 aa  220  3e-56  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.460392  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1892  rhodanese-like protein  40.21 
 
 
269 aa  213  2.9999999999999995e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0917169  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0896  rhodanese domain-containing protein  35.84 
 
 
275 aa  189  5e-47  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.259251  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0206  rhodanese-like protein  34.89 
 
 
274 aa  188  1e-46  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0255  rhodanese domain-containing protein  38.2 
 
 
302 aa  188  1e-46  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.297273  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2969  pseudouridine synthase, RluA family  36.67 
 
 
623 aa  178  9e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2353  rhodanese superfamily protein  37.65 
 
 
284 aa  176  7e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0478331  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2233  rhodanese superfamily protein  37.65 
 
 
284 aa  176  7e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1702  rhodanese superfamily protein  37.2 
 
 
334 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2314  rhodanese superfamily protein  36.8 
 
 
284 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2337  rhodanese superfamily protein  36.84 
 
 
284 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.933613  normal  0.0128371 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1859  Rhodanese domain protein  39.46 
 
 
314 aa  171  2e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.52383  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2535  rhodanese superfamily protein  34.39 
 
 
282 aa  170  4e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.574303  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2206  rhodanese superfamily protein  35.34 
 
 
282 aa  168  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.506962 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1196  rhodanese superfamily protein  36.17 
 
 
299 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.760929  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1204  rhodanese superfamily protein  36.17 
 
 
299 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.521116  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>