152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4890 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_0810  serine transporter  86.26 
 
 		 442 aa  711    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4890  serine transporter  100 
 
 		 433 aa  868    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4424  serine transporter family protein  64.73 
 
 		 443 aa  581  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0207469 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0592  serine transporter  64.5 
 
 		 443 aa  579  1e-164  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3501  inner membrane transport protein YhaO  64.97 
 
 		 479 aa  579  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3427  inner membrane transport protein YhaO  64.97 
 
 		 479 aa  579  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3585  serine transporter family protein  64.5 
 
 		 443 aa  578  1e-164  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3430  inner membrane transport protein YhaO  64.97 
 
 		 479 aa  579  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.763252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3407  serine transporter family protein  64.5 
 
 		 443 aa  579  1e-164  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3248  serine transporter family protein  64.27 
 
 		 443 aa  578  1e-164  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.40747  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3534  inner membrane transport protein YhaO  64.97 
 
 		 479 aa  579  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.846791 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02978  predicted transporter  65.56 
 
 		 422 aa  576  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02929  hypothetical protein  65.56 
 
 		 422 aa  576  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3597  inner membrane transport protein YhaO  64.73 
 
 		 443 aa  576  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.752822  normal  0.938975 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3299  serine transporter family protein  64.27 
 
 		 443 aa  577  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0587  serine transporter  64.27 
 
 		 443 aa  577  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2791  HAAAP family transport protein  67.38 
 
 		 423 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002891  serine transporter  61.05 
 
 		 441 aa  560  1e-158  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2874  HAAAP family transport protein  67.14 
 
 		 423 aa  558  1e-158  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.547071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2970  HAAAP family transport protein  67.22 
 
 		 423 aa  560  1e-158  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1298  HAAAP family transport protein  66.9 
 
 		 423 aa  555  1e-157  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0139419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3068  HAAAP family transport protein  66.9 
 
 		 423 aa  555  1e-157  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0327744  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3078  HAAAP family transport protein  66.9 
 
 		 423 aa  554  1e-157  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.283138  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3221  HAAAP family transport protein  66.9 
 
 		 423 aa  554  1e-157  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0441851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3807  putative serine transporter  50.24 
 
 		 428 aa  418  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0644  putative serine transporter  50.24 
 
 		 428 aa  418  9.999999999999999e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0912478 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3895  putative transmembrane transport protein  50.24 
 
 		 428 aa  418  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4907  serine transporter family protein  42.65 
 
 		 423 aa  347  2e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4031  serine transporter family protein  42.2 
 
 		 423 aa  347  3e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3992  serine transporter family protein  42.2 
 
 		 423 aa  347  3e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03390  predicted transporter  42.2 
 
 		 423 aa  346  4e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0173  serine transporter  42.2 
 
 		 423 aa  346  4e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3738  serine transporter family protein  42.2 
 
 		 423 aa  346  4e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0176  serine transporter  42.2 
 
 		 423 aa  346  4e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3858  serine transporter family protein  42.4 
 
 		 423 aa  345  7e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3837  inner membrane transport protein YhaO  42.31 
 
 		 432 aa  334  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3901  inner membrane transport protein YhaO  42.31 
 
 		 432 aa  333  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3823  inner membrane transport protein YhaO  42.07 
 
 		 432 aa  333  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3945  inner membrane transport protein YhaO  42.07 
 
 		 432 aa  333  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0500028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4005  inner membrane transport protein YhaO  42.07 
 
 		 432 aa  332  8e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05580  hypothetical protein  29.15 
 
 		 418 aa  164  4.0000000000000004e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001600  serine transporter  26.74 
 
 		 418 aa  158  2e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0863  aromatic amino acid permease  28.5 
 
 		 423 aa  155  1e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0739  aromatic amino acid permease  28.4 
 
 		 423 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0858  aromatic amino acid permease  28 
 
 		 423 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2772  amino acid transporter, transmembrane  27.23 
 
 		 438 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3262  amino acid transporter, transmembrane  27.53 
 
 		 430 aa  147  5e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0919  serine transporter, putative  27.25 
 
 		 430 aa  146  8.000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0761  amino acid transporter, transmembrane  27.29 
 
 		 430 aa  146  9e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3365  serine transporter, putative  27.25 
 
 		 430 aa  146  9e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0861  aromatic amino acid permease  27.23 
 
 		 431 aa  145  1e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3633  threonine/serine transporter  26.09 
 
 		 425 aa  144  3e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.04757 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1630  serine transporter  27.82 
 
 		 431 aa  143  7e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.80045  hitchhiker  0.00253041 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0765  aromatic amino acid permease  27.66 
 
 		 431 aa  142  8e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3483  aromatic amino acid permease  27.66 
 
 		 431 aa  142  8e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3552  aromatic amino acid permease  27.66 
 
 		 431 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3674  aromatic amino acid permease  27.66 
 
 		 431 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.13608 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3396  aromatic amino acid permease  25.91 
 
 		 426 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.252294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1550  serine transporter  25.87 
 
 		 440 aa  139  7e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0771  aromatic amino acid permease  28.21 
 
 		 428 aa  139  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.630004  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2327  aromatic amino acid permease  26.12 
 
 		 426 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.904494  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1242  serine transporter  26.25 
 
 		 427 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0363509  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2183  aromatic amino acid permease  25.88 
 
 		 426 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1760  threonine/serine transporter  26.27 
 
 		 425 aa  137  4e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2397  putative serine transporter  25.71 
 
 		 430 aa  137  4e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2656  serine transporter  25.53 
 
 		 433 aa  136  8e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2739  serine transporter  25.53 
 
 		 433 aa  136  8e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3589  aromatic amino acid ABC transporter permease  25.65 
 
 		 426 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3249  serine transporter  26.84 
 
 		 429 aa  134  3e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.416009  normal  0.367748 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3101  serine transporter family protein  27.17 
 
 		 429 aa  134  3e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.41481  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2936  serine transporter family protein  26.93 
 
 		 429 aa  134  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0834253  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02641  predicted serine transporter  26.93 
 
 		 429 aa  133  6e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.581837  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0892  serine transporter  26.93 
 
 		 429 aa  133  6e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0202457  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02603  hypothetical protein  26.93 
 
 		 429 aa  133  6e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.649204  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4060  serine transporter family protein  26.93 
 
 		 429 aa  133  6e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0533017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2940  serine transporter family protein  26.93 
 
 		 429 aa  133  6e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.271081  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3416  serine transporter  26.68 
 
 		 439 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.365375  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2939  serine transporter  25.41 
 
 		 429 aa  132  9e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.557142  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0919  serine transporter  25.87 
 
 		 433 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0916  serine transporter  26.93 
 
 		 429 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3177  serine transporter  26.47 
 
 		 439 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00205118  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2666  serine transporter  25.18 
 
 		 427 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.973532  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3415  serine/threonine transporter family protein  26.47 
 
 		 439 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3146  aromatic amino acid permease  25.28 
 
 		 439 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0568777  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3076  serine transporter family protein  26.93 
 
 		 429 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.119779  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3130  serine transporter family protein  26.3 
 
 		 429 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.805755  normal  0.595643 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3066  serine/threonine transporter family protein  25.92 
 
 		 439 aa  130  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.619234  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3306  serine/threonine transporter family protein  25.92 
 
 		 439 aa  130  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.243696  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3178  serine transporter family protein  26.3 
 
 		 429 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.509174 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3293  serine transporter family protein  26.3 
 
 		 429 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.412902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3113  serine transporter family protein  26.3 
 
 		 429 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.109135  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3207  serine/threonine transporter family protein  25.68 
 
 		 439 aa  131  3e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3193  serine transporter family protein  26.3 
 
 		 429 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.472945  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3106  serine transporter  26.2 
 
 		 439 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2484  serine/threonine transporter family protein  25.93 
 
 		 439 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3286  serine/threonine transporter family protein  25.92 
 
 		 439 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1840  serine/threonine transporter family protein  25.74 
 
 		 439 aa  130  6e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.781271 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1339  serine transporter  25.59 
 
 		 429 aa  130  6e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3407  serine/threonine transporter family protein  25.51 
 
 		 439 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.368535  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2804  amino acid transporter transmembrane  24.64 
 
 		 425 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.733608  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>