More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4488 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_001597  putative extracellular serine protease  73.31 
 
 
592 aa  918    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0874118  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05576  serine proteinase  75.17 
 
 
592 aa  930    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4488  proprotein convertase P  100 
 
 
592 aa  1204    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3045  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  48.56 
 
 
703 aa  498  1e-139  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.267521  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2968  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  48.31 
 
 
704 aa  487  1e-136  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.877299  normal  0.682144 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1678  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  47.97 
 
 
705 aa  485  1e-136  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1685  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  47.97 
 
 
705 aa  484  1e-135  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1610  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  47.97 
 
 
707 aa  481  1e-134  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2217  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  48.48 
 
 
705 aa  479  1e-134  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3789  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.5 
 
 
588 aa  262  2e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.553704  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4466  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.18 
 
 
631 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4102  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.5 
 
 
646 aa  152  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.246313 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3989  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.5 
 
 
646 aa  152  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46350  serine peptidase  29.96 
 
 
659 aa  142  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.614048  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3847  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.04 
 
 
862 aa  134  6.999999999999999e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0267301  normal  0.766221 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03583  Kexin like processing proteasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q874F7]  27.67 
 
 
819 aa  117  6e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2140  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.16 
 
 
703 aa  114  7.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01120  Kex protein, putative  26.07 
 
 
917 aa  100  6e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0397465  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4009  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.19 
 
 
662 aa  95.9  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.594531 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00661  hypothetical protein  27.9 
 
 
1083 aa  95.5  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.464249 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_14973  predicted protein  24.56 
 
 
871 aa  92  3e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.251561  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3131  peptidase C1A, papain  29.36 
 
 
1096 aa  89  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.34084  hitchhiker  0.000341484 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3130  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.83 
 
 
1085 aa  87.4  6e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.446766  hitchhiker  0.000357529 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2404  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.54 
 
 
925 aa  80.1  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0146269  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0486  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.05 
 
 
742 aa  79.3  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.690821  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0787  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.75 
 
 
612 aa  76.6  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4924  serine protease  24.26 
 
 
1805 aa  75.1  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  25.04 
 
 
2911 aa  74.3  0.000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1052  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.61 
 
 
423 aa  73.6  0.000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.223191  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.96 
 
 
1383 aa  73.2  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4224  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.43 
 
 
571 aa  72  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.576442  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0749  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.63 
 
 
587 aa  71.6  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05170  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.31 
 
 
653 aa  72  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2027  aerolysin  28.17 
 
 
399 aa  72  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0018  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.36 
 
 
625 aa  72  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.470845  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0648  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.49 
 
 
547 aa  71.6  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.201749  normal  0.0862091 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06400  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.96 
 
 
797 aa  71.2  0.00000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0223  FHA domain-containing protein  29.85 
 
 
513 aa  70.5  0.00000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.443938 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4661  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.59 
 
 
562 aa  70.5  0.00000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2496  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  26.26 
 
 
575 aa  70.1  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.212596  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2037  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.59 
 
 
1372 aa  70.1  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.884942  normal  0.0586303 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2410  alkaline serine protease  29.18 
 
 
397 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.329944  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3055  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  46.07 
 
 
483 aa  69.7  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.154731  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0307  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.17 
 
 
1272 aa  69.3  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3542  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.46 
 
 
638 aa  68.6  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0100576  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0931  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.91 
 
 
500 aa  68.6  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.143808  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1039  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.33 
 
 
575 aa  68.2  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0647  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.96 
 
 
836 aa  68.2  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000368401 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0373  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  28.99 
 
 
479 aa  68.6  0.0000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.443347 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2919  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.24 
 
 
1876 aa  67.8  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.830797  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2345  alkaline serine protease, subtilase family  45.12 
 
 
397 aa  66.6  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02320  subtilisin-like serine protease  27.51 
 
 
591 aa  66.6  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2480  alkaline serine protease, subtilase family  45.12 
 
 
397 aa  66.6  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2980  alkaline serine protease, subtilase family  45.12 
 
 
397 aa  66.6  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.503855 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2053  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.1 
 
 
777 aa  67  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.120624 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2796  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.18 
 
 
856 aa  66.2  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1928  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.82 
 
 
452 aa  67  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2695  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.13 
 
 
438 aa  67  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1050  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.66 
 
 
413 aa  66.6  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.141106  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1195  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.52 
 
 
482 aa  65.9  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0783  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.61 
 
 
597 aa  65.5  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3359  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.28 
 
 
1154 aa  65.5  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.324183  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2220  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.55 
 
 
397 aa  64.7  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000312805  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2318  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  27.59 
 
 
771 aa  64.3  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.848662  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0751  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.09 
 
 
587 aa  64.3  0.000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2216  alkaline serine protease  43.21 
 
 
397 aa  63.9  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00115327  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2155  alkaline serine protease  43.21 
 
 
397 aa  63.9  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.130046  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2139  alkaline serine protease  43.21 
 
 
397 aa  63.9  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.478532  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2380  alkaline serine protease  43.21 
 
 
397 aa  63.9  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2398  alkaline serine protease, subtilase family  43.21 
 
 
397 aa  63.9  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2222  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.26 
 
 
891 aa  63.9  0.000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1555  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.84 
 
 
1078 aa  63.5  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.11414  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1827  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.19 
 
 
1054 aa  63.5  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.426628  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4226  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.89 
 
 
1454 aa  63.2  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.542738  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1888  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.11 
 
 
626 aa  63.5  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.67203  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1188  FHA domain-containing protein  27.41 
 
 
541 aa  63.5  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00110568  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0861  intracellular serine protease  45.45 
 
 
307 aa  62.4  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000163196  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0678  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.16 
 
 
510 aa  62.8  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0623565  normal  0.0400211 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1456  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.66 
 
 
594 aa  62.4  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.661246  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2102  outer membrane autotransporter  34.87 
 
 
1006 aa  62.8  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.93 
 
 
1029 aa  62.4  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2479  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.05 
 
 
769 aa  61.6  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2108  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.25 
 
 
995 aa  61.6  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.557195  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1874  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  29.33 
 
 
474 aa  61.6  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1707  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  30.63 
 
 
737 aa  61.2  0.00000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4203  Subtilisin-like protein serine protease-like protein  29.37 
 
 
1333 aa  61.2  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5318  hitchhiker  0.00171277 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0788  thermostable serine protease  28.5 
 
 
606 aa  60.8  0.00000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.282797  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1379  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.61 
 
 
641 aa  60.8  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.863708  normal  0.0771449 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4754  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  42.11 
 
 
445 aa  60.8  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00404816  hitchhiker  0.000540965 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2075  subtilisin  28.57 
 
 
485 aa  60.5  0.00000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.734666  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0274  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.43 
 
 
440 aa  60.5  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65736  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0393  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.51 
 
 
660 aa  59.7  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.13824 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0357  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.62 
 
 
577 aa  60.1  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2875  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.29 
 
 
651 aa  59.7  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.311143  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2354  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.36 
 
 
453 aa  58.9  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0507  serine protease  30.22 
 
 
606 aa  59.7  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.233077 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5496  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.09 
 
 
635 aa  59.3  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.252703 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0083  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  36.2 
 
 
1361 aa  59.7  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1295  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.75 
 
 
639 aa  58.9  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4436  minor extracellular protease VpR  42.17 
 
 
917 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>