45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4372 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_4465  hypothetical protein  91.31 
 
 		 978 bp  656    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4372    100 
 
 		 808 bp  1602    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4464    93.39 
 
 		 753 bp  375  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3773  hypothetical protein  91.28 
 
 		 978 bp  281  2e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.149988  hitchhiker  0.00126811 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2958  hypothetical protein  89.45 
 
 		 978 bp  250  4.9999999999999997e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1378  hypothetical protein  93.9 
 
 		 978 bp  246  7.999999999999999e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000599998 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3627  hypothetical protein  80.95 
 
 		 978 bp  129  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.92162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4749  hypothetical protein  83.51 
 
 		 978 bp  127  5e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.291957  hitchhiker  0.000564584 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0356    90.1 
 
 		 357 bp  121  3e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4299  hypothetical protein  80.59 
 
 		 978 bp  121  3e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3676    85.58 
 
 		 1107 bp  87.7  0.000000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3677    85.58 
 
 		 902 bp  87.7  0.000000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0324    86.17 
 
 		 1072 bp  83.8  0.00000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3681  hypothetical protein  86.05 
 
 		 972 bp  75.8  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2822    93.88 
 
 		 526 bp  73.8  0.00000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.348547  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2002    91.23 
 
 		 756 bp  73.8  0.00000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.923889 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1693    89.47 
 
 		 1055 bp  65.9  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.514185  normal  0.247616 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4530  hypothetical protein  85.92 
 
 		 978 bp  61.9  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0670  hypothetical protein  94.87 
 
 		 978 bp  61.9  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1695    90.2 
 
 		 1086 bp  61.9  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.165602  normal  0.365956 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2502    81.58 
 
 		 1090 bp  60  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.674339  normal  0.0724762 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3682  hypothetical protein  83.72 
 
 		 597 bp  60  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1891  hypothetical protein  91.3 
 
 		 282 bp  60  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0968577  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1903    91.3 
 
 		 294 bp  60  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.475323  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2922  hypothetical protein  80.62 
 
 		 978 bp  58  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0606  hypothetical protein  85.29 
 
 		 978 bp  56  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3473  hypothetical protein  92.31 
 
 		 978 bp  54  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1546  hypothetical protein  92.31 
 
 		 981 bp  54  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1547  hypothetical protein  84.51 
 
 		 978 bp  54  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3040  hypothetical protein  92.31 
 
 		 978 bp  54  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3447  hypothetical protein  92.31 
 
 		 978 bp  54  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1861  hypothetical protein  92.31 
 
 		 991 bp  54  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.633128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1571  hypothetical protein  100 
 
 		 201 bp  54  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0641007  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1812  hypothetical protein  92.31 
 
 		 951 bp  54  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2814  hypothetical protein  92.31 
 
 		 978 bp  54  0.00006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1241  hypothetical protein  92.31 
 
 		 978 bp  54  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4547  hypothetical protein  92.11 
 
 		 978 bp  52  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2533  hypothetical protein  87.76 
 
 		 981 bp  50.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0991372  normal  0.0595118 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0991    86.79 
 
 		 334 bp  50.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0196  hypothetical protein  83.82 
 
 		 981 bp  48.1  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.157282 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2299  hypothetical protein  83.82 
 
 		 978 bp  48.1  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.187044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2394  hypothetical protein  93.75 
 
 		 315 bp  48.1  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.176236  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2393  hypothetical protein  96.43 
 
 		 717 bp  48.1  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0597783  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2392  hypothetical protein  82.5 
 
 		 978 bp  48.1  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.134929  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0200  hypothetical protein  96.43 
 
 		 882 bp  48.1  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>