24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2341 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2341  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 135 aa  269  1e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1438  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.9 
 
 		 450 aa  93.6  7e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.892104 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.79 
 
 		 439 aa  81.3  0.000000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5409  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.19 
 
 		 440 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4817  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.19 
 
 		 440 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.896318 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5452  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.19 
 
 		 440 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.529147 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0199  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.51 
 
 		 435 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.506284 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5337  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.63 
 
 		 417 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.306348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4795  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.63 
 
 		 417 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.682348 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1933  hypothetical protein  30.84 
 
 		 423 aa  59.7  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.497125  normal  0.363936 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1265  hypothetical protein  35.24 
 
 		 432 aa  58.9  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1264  hypothetical protein  34.29 
 
 		 432 aa  57  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3852  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.19 
 
 		 430 aa  55.1  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.332822  normal  0.575046 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3711  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.11 
 
 		 429 aa  50.4  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.712619  normal  0.892725 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4633  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.1 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.765233  hitchhiker  0.000000449148 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04340  hypothetical protein  32.14 
 
 		 423 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0425  hypothetical protein  31.25 
 
 		 423 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.592751  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1880  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.12 
 
 		 431 aa  45.1  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1885  hypothetical protein  24.39 
 
 		 302 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0070787  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3423  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.19 
 
 		 430 aa  43.5  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3507  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.79 
 
 		 429 aa  42.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0265  hypothetical protein  31.86 
 
 		 440 aa  41.6  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.673288  normal  0.803831 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1677  hypothetical protein  25.2 
 
 		 302 aa  42  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.366521  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1934  hypothetical protein  27.2 
 
 		 302 aa  40  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>