83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1996 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1996  hypothetical protein  100 
 
 		 548 aa  1149    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0665457 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14021  hypothetical protein  41.98 
 
 		 529 aa  448  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2750  hypothetical protein  41.43 
 
 		 258 aa  199  9e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2751  hypothetical protein  33.2 
 
 		 267 aa  158  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1604  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative  28.08 
 
 		 493 aa  150  7e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.610155  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2464  nucleotidyl transferase  24.9 
 
 		 504 aa  138  3.0000000000000003e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2595  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  24.47 
 
 		 494 aa  134  3.9999999999999996e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.334164  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0347  nucleotidyl transferase  29.55 
 
 		 245 aa  103  9e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0798326  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0308  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative nucleotidyltransferase  27.94 
 
 		 245 aa  99  2e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.684825  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0349  nucleotidyl transferase  27.56 
 
 		 240 aa  96.7  9e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.309599  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0612  nucleotidyl transferase  28.8 
 
 		 253 aa  92  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.639702 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1803  dTDP-glucose pyrophosphorylase  29.08 
 
 		 241 aa  89.7  1e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0706  lipopolysaccharide biosynthesis protein, putative  29.15 
 
 		 253 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4084  nucleotidyl transferase  24.01 
 
 		 331 aa  72  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.313929 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0881  nucleotidyl transferase  24.54 
 
 		 331 aa  71.6  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104099 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1304  Nucleotidyl transferase  26.8 
 
 		 330 aa  69.7  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0729  Nucleotidyl transferase  24.6 
 
 		 332 aa  69.3  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0305  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative nucleotidyltransferase  23.68 
 
 		 246 aa  67.4  0.0000000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.297803  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0423  hypothetical protein  25.57 
 
 		 254 aa  64.3  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0276  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  22.4 
 
 		 331 aa  64.3  0.000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00854948  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1221  nucleotidyl transferase  25.33 
 
 		 329 aa  61.2  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1806  putative nucleotidyltransferase  24.53 
 
 		 241 aa  61.2  0.00000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.716393  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03545  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, putative  23.87 
 
 		 336 aa  61.2  0.00000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0020  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  23.64 
 
 		 333 aa  60.1  0.00000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.583446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1064  nucleotidyl transferase  23.94 
 
 		 338 aa  59.7  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1475  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  26.38 
 
 		 353 aa  57.8  0.0000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000811226  normal  0.134994 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0106  hypothetical protein  24.19 
 
 		 240 aa  56.2  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105806 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0615  hypothetical protein  23.18 
 
 		 240 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.651829 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1800  capsular polysaccharide biosynthesis protein  21.29 
 
 		 243 aa  55.5  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.6322  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0077  nucleotidyl transferase  23.24 
 
 		 336 aa  54.3  0.000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.760983 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0732  hypothetical protein  24.1 
 
 		 251 aa  53.5  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2775  Nucleotidyl transferase  22.26 
 
 		 324 aa  53.1  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03020  mannose-1-phosphate guanylyltransferase, putative  24.02 
 
 		 364 aa  53.1  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0302  capsular polysaccharide biosynthesis protein  23.05 
 
 		 243 aa  52.4  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.04779  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0923  nucleotidyl transferase  23.05 
 
 		 325 aa  52.8  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000758587  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0673  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  23.75 
 
 		 325 aa  52.4  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.004796  hitchhiker  0.00242114 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1639  Nucleotidyl transferase  23.33 
 
 		 325 aa  52.4  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0069  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  23.28 
 
 		 455 aa  52  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.881986 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1640  Nucleotidyl transferase  22.5 
 
 		 325 aa  50.8  0.00007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0220979  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2065  Nucleotidyl transferase  22.12 
 
 		 393 aa  50.4  0.00008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1663  hypothetical protein  20.63 
 
 		 246 aa  50.4  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0809  Nucleotidyl transferase  22.92 
 
 		 326 aa  50.1  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0061  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  22.81 
 
 		 455 aa  50.1  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2610  hypothetical protein  20.62 
 
 		 247 aa  48.5  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3244  nucleotidyl transferase  45.83 
 
 		 243 aa  47.4  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0709  hypothetical protein  21.3 
 
 		 240 aa  47  0.0009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0207  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase / glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase  29.09 
 
 		 467 aa  46.6  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0385  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  39.02 
 
 		 257 aa  46.2  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.107114  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74665  Mannose-1-phosphate guanyltransferase (ATP-mannose-1-phosphate guanylyltransferase) (GDP-mannose pyrophosphorylase) (CASRB1)  26.5 
 
 		 362 aa  46.6  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0126253 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0177  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase protein  27.93 
 
 		 455 aa  47  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.221118 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3892  hypothetical protein  22.61 
 
 		 242 aa  47  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0229  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase / glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase  24.54 
 
 		 454 aa  46.6  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.976567  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0665  nucleotidyl transferase  42.86 
 
 		 241 aa  46.2  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.51351 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3729  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  29.09 
 
 		 453 aa  46.2  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.625881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4096  hypothetical protein  23.16 
 
 		 242 aa  45.8  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.541182 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2093  Nucleotidyl transferase  46.15 
 
 		 325 aa  45.1  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.165042  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1546  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  46.15 
 
 		 349 aa  45.1  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000479594  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0186  glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase / UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  28.83 
 
 		 454 aa  45.1  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.329478 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3694  glucose-1-phosphate cytidylyl-transferase  36 
 
 		 263 aa  45.1  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1984  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase (O-antigen-related)  40 
 
 		 258 aa  45.4  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0568  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  40 
 
 		 258 aa  45.4  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3175  Nucleotidyl transferase  39.02 
 
 		 272 aa  45.1  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4970  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  39.02 
 
 		 279 aa  45.1  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2891  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  27.93 
 
 		 453 aa  44.7  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000405845 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3048  Nucleotidyl transferase  23.78 
 
 		 393 aa  44.7  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.916197  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0337  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  27.93 
 
 		 453 aa  44.3  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.116008  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0204  nucleotidyl transferase  21.56 
 
 		 311 aa  44.3  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3380  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  27.93 
 
 		 453 aa  44.3  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00368605  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3051  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  27.93 
 
 		 453 aa  44.3  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.313438  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0324  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  27.93 
 
 		 453 aa  44.3  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01681  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  24.51 
 
 		 392 aa  44.3  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2243  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  27.93 
 
 		 453 aa  44.3  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.164463  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0627  nucleotidyl transferase  22.33 
 
 		 240 aa  43.9  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.065942  normal  0.378103 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1202  Nucleotidyl transferase  26.46 
 
 		 393 aa  43.9  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0518  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  27.93 
 
 		 561 aa  43.9  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.815966  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05586  Mannose-1-phosphate guanyltransferase (EC 2.7.7.13)(GTP-mannose-1-phosphate guanylyltransferase)(GDP-mannose pyrophosphorylase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B1J4]  22.83 
 
 		 364 aa  43.9  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2041  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  27.93 
 
 		 561 aa  43.9  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0340  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  47.37 
 
 		 355 aa  43.9  0.008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.830656  normal  0.0393179 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4288  Nucleotidyl transferase  50 
 
 		 243 aa  43.5  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.237933  normal  0.419035 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2643  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  47.37 
 
 		 354 aa  43.5  0.01  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1961  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  38 
 
 		 268 aa  43.5  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0662  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  38 
 
 		 268 aa  43.5  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2341  nucleotidyl transferase  21.48 
 
 		 396 aa  43.5  0.01  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00221584  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>