33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1879 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1879  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 388 aa  805    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00684701 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2760  TPR repeat-containing protein  60.94 
 
 		 392 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.258861  normal  0.160346 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1794  TPR repeat-containing protein  48.05 
 
 		 416 aa  368  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1815  TPR repeat-containing protein  44.19 
 
 		 380 aa  332  9e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1445  hypothetical protein  34.99 
 
 		 386 aa  261  1e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000257118  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4983  TPR domain-containing protein  35.82 
 
 		 278 aa  164  3e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3529  TPR repeat-containing protein  28.71 
 
 		 395 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.178581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3359  TPR repeat-containing protein  28.5 
 
 		 395 aa  140  3e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.811599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0594  TPR repeat-containing protein  28.24 
 
 		 395 aa  140  6e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.212365  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0757  TPR domain-containing protein  29.08 
 
 		 395 aa  139  6e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0800  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 397 aa  136  5e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.014788  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0626  TPR repeat-containing protein  28.24 
 
 		 406 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.13673  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3829  TPR repeat-containing protein  28.31 
 
 		 397 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0177121  normal  0.253608 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3647  Tetratricopeptide domain protein  28.31 
 
 		 397 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000857085  hitchhiker  0.00481631 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3705  TPR repeat-containing protein  28.5 
 
 		 397 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000033956  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0936  TPR repeat-containing protein  26.41 
 
 		 388 aa  125  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0836  TPR repeat-containing protein  25.41 
 
 		 403 aa  124  3e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0293971  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0653  TPR domain-containing protein  25.99 
 
 		 386 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2902  tetratricopeptide TPR_2  23.94 
 
 		 376 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.449948  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0983  TPR repeat-containing protein  25.43 
 
 		 402 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.145285 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0849  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 393 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00820886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0530  tetratricopeptide TPR_2  26.58 
 
 		 392 aa  100  5e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2703  TPR domain-containing protein  25 
 
 		 394 aa  94.7  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00726  TPR domain protein  23.38 
 
 		 385 aa  83.6  0.000000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2935  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.72 
 
 		 383 aa  70.9  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0474976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2168  hypothetical protein  21.66 
 
 		 399 aa  52.8  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4120  TPR repeat-containing protein  26.13 
 
 		 380 aa  49.7  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.132007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1622  tetratricopeptide TPR_2  25.44 
 
 		 247 aa  48.1  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00247403 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  26.12 
 
 		 615 aa  47.8  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0600  TPR repeat-containing protein  28.87 
 
 		 1112 aa  47  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.272318  normal  0.386774 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1745  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 402 aa  47  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  27.27 
 
 		 1764 aa  45.4  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2447  TPR repeat-containing protein  25.56 
 
 		 318 aa  43.5  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>