14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1698 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2947  hypothetical protein  81.33 
 
 		 469 aa  766    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.390818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1698  hypothetical protein  100 
 
 		 468 aa  952    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.625375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1428  hypothetical protein  63.46 
 
 		 468 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2009  hypothetical protein  62.45 
 
 		 470 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0952635 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2677  hypothetical protein  37.1 
 
 		 465 aa  269  8.999999999999999e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3794  hypothetical protein  30.91 
 
 		 465 aa  211  2e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3250  hypothetical protein  29.36 
 
 		 470 aa  207  3e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.158912  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4595  hypothetical protein  30.38 
 
 		 467 aa  207  4e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5174  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.4 
 
 		 686 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4846  lipopolysaccharide biosynthesis  21.69 
 
 		 742 aa  50.8  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0566173  normal  0.0374732 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4938  capsular exopolysaccharide family  23.25 
 
 		 750 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.831467 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2584  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.12 
 
 		 575 aa  47  0.0008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1376  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.71 
 
 		 465 aa  45.4  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  23.12 
 
 		 736 aa  43.9  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>