More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1011 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1011  PP family ATPase  100 
 
 		 240 aa  491  9.999999999999999e-139  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0407194  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1321  PP-loop domain-containing protein  46.06 
 
 		 252 aa  229  3e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.32014  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2367  PP-loop domain protein  44.3 
 
 		 247 aa  226  2e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2259  PP-loop domain-containing protein  46.26 
 
 		 242 aa  222  3e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000140384  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2599  PP-loop domain protein  45.87 
 
 		 235 aa  208  5e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000526821  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2181  ATPase  48.31 
 
 		 237 aa  208  8e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000263465  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1247  ExsB family protein  41.63 
 
 		 244 aa  204  7e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.400272  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1059  PP-loop family protein  41.63 
 
 		 244 aa  204  7e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1810  PP-loop domain-containing protein  44.69 
 
 		 235 aa  203  2e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000657331  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0882  PP-loop domain-containing protein  44.02 
 
 		 307 aa  202  5e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.175206  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3405  PP-loop domain protein  46.38 
 
 		 239 aa  200  1.9999999999999998e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1709  PP-loop domain protein  39.57 
 
 		 244 aa  188  8e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20940  PP-loop domain protein  38.18 
 
 		 260 aa  159  3e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000433533  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0799  PP-loop domain protein  37.61 
 
 		 247 aa  158  6e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2223  PP-loop domain-containing protein  36.32 
 
 		 264 aa  154  9e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1777  C32 tRNA thiolase  37.34 
 
 		 311 aa  153  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.101816 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1573  C32 tRNA thiolase  35.62 
 
 		 307 aa  153  2e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.539766  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1499  C32 tRNA thiolase  37.34 
 
 		 311 aa  153  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3479  C32 tRNA thiolase  36.02 
 
 		 258 aa  154  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.101099  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0671  C32 tRNA thiolase  36.29 
 
 		 259 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.51504e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1837  C32 tRNA thiolase  36.91 
 
 		 311 aa  152  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.555568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1681  C32 tRNA thiolase  36.91 
 
 		 311 aa  152  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0199988  normal  0.0209698 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1774  C32 tRNA thiolase  36.91 
 
 		 311 aa  152  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.075518 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1043  C32 tRNA thiolase  36.05 
 
 		 310 aa  152  5e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00286005  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4231  PP-loop domain-containing protein  37.45 
 
 		 310 aa  151  7e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.92927  normal  0.191142 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2607  C32 tRNA thiolase  37.34 
 
 		 310 aa  150  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.560057 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2415  C32 tRNA thiolase  37.14 
 
 		 319 aa  150  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.170221  decreased coverage  0.000000170238 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0127  C32 tRNA thiolase  36.21 
 
 		 282 aa  149  5e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2221  C32 tRNA thiolase  36.07 
 
 		 316 aa  148  6e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2224  C32 tRNA thiolase  37.35 
 
 		 311 aa  148  9e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00242897  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1801  C32 tRNA thiolase  36.07 
 
 		 319 aa  148  9e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.313433 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1995  C32 tRNA thiolase  35.77 
 
 		 317 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0619881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1949  C32 tRNA thiolase  35.37 
 
 		 310 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1589  C32 tRNA thiolase  36.05 
 
 		 311 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01321  predicted C32 tRNA thiolase  36.05 
 
 		 311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2299  PP-loop domain protein  36.05 
 
 		 311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00162169  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1558  C32 tRNA thiolase  36.05 
 
 		 311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1993  C32 tRNA thiolase  36.05 
 
 		 311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.800343 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01331  hypothetical protein  36.05 
 
 		 311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0060  C32 tRNA thiolase  37.29 
 
 		 315 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.867348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1461  C32 tRNA thiolase  36.05 
 
 		 311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0068  C32 tRNA thiolase  36.86 
 
 		 315 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2316  C32 tRNA thiolase  35.62 
 
 		 311 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2281  C32 tRNA thiolase  36.05 
 
 		 311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.787518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1778  C32 tRNA thiolase  36.05 
 
 		 311 aa  146  3e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.446502  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2354  C32 tRNA thiolase  35.77 
 
 		 310 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2211  C32 tRNA thiolase  34.84 
 
 		 310 aa  145  5e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000587998  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2890  C32 tRNA thiolase  36.91 
 
 		 340 aa  145  5e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.735906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4497  C32 tRNA thiolase  34.84 
 
 		 310 aa  145  5e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3499  C32 tRNA thiolase  36.86 
 
 		 269 aa  145  5e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00810912  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2975  C32 tRNA thiolase  36.91 
 
 		 331 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1896  C32 tRNA thiolase  37.72 
 
 		 289 aa  145  8.000000000000001e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.318261 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3027  C32 tRNA thiolase  36.6 
 
 		 334 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2598  C32 tRNA thiolase  35.62 
 
 		 311 aa  144  9e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2210  C32 tRNA thiolase  34.43 
 
 		 322 aa  144  9e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000285606  normal  0.272334 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0175  C32 tRNA thiolase  35.71 
 
 		 312 aa  144  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.186206 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1773  C32 tRNA thiolase  35.34 
 
 		 313 aa  144  1e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2366  C32 tRNA thiolase  38.46 
 
 		 326 aa  143  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.53458  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2016  C32 tRNA thiolase  35.25 
 
 		 322 aa  143  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000499451 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1959  C32 tRNA thiolase  35.25 
 
 		 322 aa  143  2e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00791076 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2980  C32 tRNA thiolase  38.46 
 
 		 331 aa  143  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2117  C32 tRNA thiolase  35.25 
 
 		 322 aa  143  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0387293 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2160  C32 tRNA thiolase  34.02 
 
 		 322 aa  143  3e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00960533  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2974  PP-loop family protein  33.48 
 
 		 314 aa  143  3e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2224  C32 tRNA thiolase  34.02 
 
 		 322 aa  143  3e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000167986  normal  0.0826377 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3000  C32 tRNA thiolase  38.12 
 
 		 331 aa  143  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1841  C32 tRNA thiolase  35.22 
 
 		 323 aa  143  3e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000126519  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0184  C32 tRNA thiolase  36.91 
 
 		 314 aa  142  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2206  C32 tRNA thiolase  35.74 
 
 		 313 aa  143  3e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.840796 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1802  C32 tRNA thiolase  35.74 
 
 		 313 aa  143  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2142  C32 tRNA thiolase  35.62 
 
 		 311 aa  143  3e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.614557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1912  C32 tRNA thiolase  35.74 
 
 		 313 aa  143  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0711  C32 tRNA thiolase  36.17 
 
 		 252 aa  143  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0128348  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02065  C32 tRNA thiolase  35.19 
 
 		 317 aa  142  4e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00588797  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2020  C32 tRNA thiolase  34.84 
 
 		 312 aa  142  4e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1463  PP-loop domain-containing protein  36.6 
 
 		 316 aa  142  4e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1738  C32 tRNA thiolase  34.76 
 
 		 313 aa  142  5e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0516  C32 tRNA thiolase  35.19 
 
 		 314 aa  142  5e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.366068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3054  C32 tRNA thiolase  36.17 
 
 		 331 aa  141  7e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.31194  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3730  C32 tRNA thiolase  35.62 
 
 		 336 aa  141  7e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0526035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2039  C32 tRNA thiolase  36.17 
 
 		 331 aa  141  7e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.605016  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3381  C32 tRNA thiolase  36.17 
 
 		 331 aa  141  7e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000151455  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0519  C32 tRNA thiolase  36.17 
 
 		 331 aa  141  7e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.339453  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6329  C32 tRNA thiolase  38.01 
 
 		 331 aa  142  7e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.577363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0327  C32 tRNA thiolase  36.17 
 
 		 331 aa  141  7e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1391  hypothetical protein  32.93 
 
 		 260 aa  141  7e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.738362  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2245  C32 tRNA thiolase  36.17 
 
 		 331 aa  141  7e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.705781  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0340  C32 tRNA thiolase  36.17 
 
 		 331 aa  141  7e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.576069  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4143  C32 tRNA thiolase  34.32 
 
 		 287 aa  141  9.999999999999999e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0227  C32 tRNA thiolase  36.48 
 
 		 312 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.384347  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3336  C32 tRNA thiolase  35.71 
 
 		 264 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0290  C32 tRNA thiolase  36.17 
 
 		 331 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.583518  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1746  PP-loop family protein  35 
 
 		 345 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0604543  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1477  PP-loop family protein  35 
 
 		 345 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.170101  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0695  C32 tRNA thiolase  35.74 
 
 		 317 aa  139  3e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.283768  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0206  C32 tRNA thiolase  34.89 
 
 		 336 aa  139  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0875  PP-loop  35.19 
 
 		 284 aa  139  3e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00139883  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2544  PP-loop domain protein  32.91 
 
 		 292 aa  139  3.9999999999999997e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.203919  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0615  C32 tRNA thiolase  34.78 
 
 		 255 aa  137  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0687614  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2225  C32 tRNA thiolase  33.91 
 
 		 310 aa  137  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.28353 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>