56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4875 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4875  methyltransferase type 12  100 
 
 		 297 aa  603  1.0000000000000001e-171  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2350  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  27.72 
 
 		 321 aa  101  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0627  hypothetical protein  28 
 
 		 325 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.127947  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0416  hypothetical protein  29.63 
 
 		 326 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00421416  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2381  hypothetical protein  29.63 
 
 		 326 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2520  hypothetical protein  29.63 
 
 		 326 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1205  methyltransferase type 11  22.87 
 
 		 356 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1336  O-methyltransferase family protein  27.33 
 
 		 339 aa  52.4  0.000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0282935  normal  0.0183052 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  32.71 
 
 		 271 aa  52  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2332  methyltransferase type 11  28.78 
 
 		 279 aa  51.6  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  31.19 
 
 		 274 aa  51.2  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3249  Methyltransferase type 11  29.21 
 
 		 382 aa  50.8  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0108  Methyltransferase type 11  29.11 
 
 		 363 aa  50.4  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.082076  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4848  Methyltransferase type 11  37.86 
 
 		 241 aa  50.1  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33530  predicted protein  29.92 
 
 		 392 aa  48.9  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0757  Methyltransferase type 11  28.83 
 
 		 209 aa  48.5  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000851252  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2836  methyltransferase type 11  28.86 
 
 		 362 aa  48.5  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.251768  normal  0.501241 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3772  methyltransferase type 11  31.09 
 
 		 254 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1888  Methyltransferase type 12  28.21 
 
 		 314 aa  47.4  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664024  normal  0.814069 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1550  methyltransferase type 11  31.36 
 
 		 254 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.326399 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1825  methyltransferase type 11  29.25 
 
 		 254 aa  46.6  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.627869  normal  0.366066 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1168  Methyltransferase type 11  30.36 
 
 		 267 aa  46.6  0.0005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4655  Methyltransferase type 11  33.65 
 
 		 310 aa  46.2  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0904903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1733  O-methyltransferase family protein  30 
 
 		 334 aa  45.8  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.561962  normal  0.248691 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1457  O-methyltransferase family protein  32 
 
 		 337 aa  45.8  0.0008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.527749  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1987  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32.71 
 
 		 254 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.199411  hitchhiker  0.00854034 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6064  Methyltransferase type 11  31.19 
 
 		 331 aa  45.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20470  tocopherol o-methyltransferase  32.67 
 
 		 318 aa  45.1  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1891  UbiE/COQ5 methyltransferase  26.87 
 
 		 255 aa  44.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1172  6-deoxyerythronolide-B synthase  28.57 
 
 		 1372 aa  44.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1664  polyketide synthase, putative  27.42 
 
 		 2082 aa  44.3  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.685154  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0328  hypothetical protein  31.13 
 
 		 351 aa  44.3  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.621774 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1518  methyltransferase type 11  31.78 
 
 		 254 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.349113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0758  methyltransferase type 11  28.24 
 
 		 261 aa  43.5  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00805232  hitchhiker  0.00000000000141502 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1988  methyltransferase  29.37 
 
 		 204 aa  43.5  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2333  O-methyltransferase family protein  29.36 
 
 		 328 aa  43.5  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000436315  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1125  Methyltransferase type 11  29.73 
 
 		 270 aa  43.5  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.321869  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1457  methyltransferase type 11  25 
 
 		 344 aa  43.5  0.005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2732  hypothetical protein  26 
 
 		 265 aa  43.1  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0656  methyltransferase type 12  45.28 
 
 		 351 aa  43.5  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2989  Methyltransferase type 11  27.48 
 
 		 270 aa  43.5  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000120063  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0772  Methyltransferase type 11  28.83 
 
 		 209 aa  43.1  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3711  methyltransferase type 12  31.73 
 
 		 360 aa  42.7  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1502  methyltransferase type 11  27.52 
 
 		 360 aa  42.7  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576413  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0298  methyltransferase type 11  29.41 
 
 		 263 aa  42.7  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0428  Methyltransferase type 12  28.69 
 
 		 361 aa  42.4  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1392  putative S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  27.59 
 
 		 208 aa  42.7  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0586874  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1840  methyltransferase type 11  27.62 
 
 		 328 aa  42.7  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1859  methyltransferase type 11  27.62 
 
 		 328 aa  42.7  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.48002  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1906  methyltransferase type 11  27.62 
 
 		 328 aa  42.7  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2470  methyltransferase type 11  31.86 
 
 		 250 aa  42.7  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.28485  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5219  Methyltransferase type 11  30.1 
 
 		 259 aa  42.4  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0306756 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2402  methyltransferase type 12  27.89 
 
 		 350 aa  42.4  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13054  hypothetical protein  27.62 
 
 		 327 aa  42.4  0.009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.100828 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4624  methyltransferase type 12  31.18 
 
 		 208 aa  42.4  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.343736 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0920  O-methyltransferase family protein  27.19 
 
 		 343 aa  42.4  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>