298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0037 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_2027  polyphosphate kinase  60.03 
 
 		 788 aa  838    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.632434  normal  0.646529 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0740  polyphosphate kinase  55.65 
 
 		 724 aa  741    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.686057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3849  polyphosphate kinase  58.96 
 
 		 731 aa  844    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.589086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2654  polyphosphate kinase  56.75 
 
 		 736 aa  768    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.566066 
 
 
-
 
NC_004310  BR0748  polyphosphate kinase  59.91 
 
 		 746 aa  830    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3458  polyphosphate kinase  58.61 
 
 		 736 aa  838    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.606284  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1568  polyphosphate kinase  59.52 
 
 		 813 aa  838    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.246522  normal  0.10605 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2341  polyphosphate kinase  59.74 
 
 		 788 aa  838    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.550577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5160  polyphosphate kinase  61.82 
 
 		 749 aa  853    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.536085  normal  0.0548817 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1594  polyphosphate kinase  57.32 
 
 		 733 aa  832    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.338059  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1580  polyphosphate kinase  58.71 
 
 		 753 aa  823    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.126677  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0781  polyphosphate kinase  57.2 
 
 		 728 aa  771    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0233  polyphosphate kinase  56.49 
 
 		 764 aa  778    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.61377 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2067  polyphosphate kinase  59.74 
 
 		 788 aa  838    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.177441  normal  0.0413655 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2544  polyphosphate kinase  60.34 
 
 		 764 aa  833    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.106279  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2161  polyphosphate kinase  59.05 
 
 		 754 aa  821    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.468394  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5543  polyphosphate kinase  61.68 
 
 		 750 aa  847    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2492  polyphosphate kinase  58.12 
 
 		 733 aa  836    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1058  polyphosphate kinase  55.6 
 
 		 724 aa  749    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3326  polyphosphate kinase  62.04 
 
 		 735 aa  868    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354966 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2329  polyphosphate kinase  57.92 
 
 		 736 aa  830    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.52981  normal  0.393956 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0037  polyphosphate kinase  100 
 
 		 721 aa  1468    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.859837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2952  polyphosphate kinase  58.77 
 
 		 759 aa  842    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2115  polyphosphate kinase  58.18 
 
 		 741 aa  823    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.311137  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1754  polyphosphate kinase  68.69 
 
 		 722 aa  969    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.048645  normal  0.328286 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1244  polyphosphate kinase  57.93 
 
 		 734 aa  825    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.828547  hitchhiker  0.00511453 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1119  polyphosphate kinase  60.17 
 
 		 754 aa  832    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.439872  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0206  polyphosphate kinase  61.06 
 
 		 801 aa  850    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.199737 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1098  polyphosphate kinase  59.2 
 
 		 734 aa  821    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.938233  normal  0.038418 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2437  polyphosphate kinase  57.35 
 
 		 728 aa  775    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0297937  normal  0.018085 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3127  polyphosphate kinase  62.32 
 
 		 726 aa  872    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1250  polyphosphate kinase  58.5 
 
 		 724 aa  847    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000749119 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2551  polyphosphate kinase  57.1 
 
 		 742 aa  813    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.183316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1302  polyphosphate kinase  57.83 
 
 		 721 aa  767    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0795  polyphosphate kinase  59.05 
 
 		 736 aa  817    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.411084  normal  0.829527 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0494  polyphosphate kinase  60.31 
 
 		 790 aa  841    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.502952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0742  polyphosphate kinase  59.77 
 
 		 746 aa  827    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2534  polyphosphate kinase  56.57 
 
 		 727 aa  777    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0398  polyphosphate kinase  57.43 
 
 		 729 aa  759    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1280  polyphosphate kinase  44.26 
 
 		 721 aa  559  1e-158  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3540  polyphosphate kinase  44.6 
 
 		 708 aa  562  1e-158  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.209178  normal  0.145043 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0889  polyphosphate kinase  45.36 
 
 		 720 aa  558  1e-157  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.106725  normal  0.22922 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3092  polyphosphate kinase  45.04 
 
 		 727 aa  557  1e-157  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.17222  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1566  polyphosphate kinase  45.39 
 
 		 731 aa  555  1e-156  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0569549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1652  polyphosphate kinase  43.31 
 
 		 722 aa  548  1e-154  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.169511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1625  polyphosphate kinase  43.31 
 
 		 722 aa  548  1e-154  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4050  Polyphosphate kinase  44.99 
 
 		 691 aa  542  1e-153  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0218639  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3165  polyphosphate kinase  43.3 
 
 		 736 aa  545  1e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.615154  normal  0.0295418 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1454  polyphosphate kinase  44.68 
 
 		 700 aa  539  9.999999999999999e-153  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.642345  normal  0.0713847 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2815  Polyphosphate kinase  43.78 
 
 		 744 aa  539  9.999999999999999e-153  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.630295  normal  0.0696089 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1431  polyphosphate kinase  43.09 
 
 		 715 aa  541  9.999999999999999e-153  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.235509 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3717  polyphosphate kinase  44.07 
 
 		 708 aa  540  9.999999999999999e-153  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.262385  normal  0.013804 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0877  polyphosphate kinase  43.78 
 
 		 721 aa  538  1e-151  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.252676  hitchhiker  0.00257913 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0302  Polyphosphate kinase  44.87 
 
 		 762 aa  537  1e-151  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1977  Polyphosphate kinase  43.55 
 
 		 714 aa  536  1e-151  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142545  normal  0.39772 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2681  polyphosphate kinase  43.15 
 
 		 695 aa  537  1e-151  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1114  polyphosphate kinase  42.01 
 
 		 720 aa  536  1e-151  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0757242 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33500  polyphosphate kinase  43.63 
 
 		 765 aa  536  1e-151  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.418416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3471  Polyphosphate kinase  44.09 
 
 		 700 aa  535  1e-151  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.448785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1259  polyphosphate kinase  41.53 
 
 		 713 aa  532  1e-150  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00202694  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4578  polyphosphate kinase  43.16 
 
 		 731 aa  534  1e-150  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.763447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4223  polyphosphate kinase  44.13 
 
 		 729 aa  532  1e-150  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.562815 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1593  polyphosphate kinase  44.74 
 
 		 745 aa  530  1e-149  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1959  polyphosphate kinase  43.23 
 
 		 743 aa  530  1e-149  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0981699 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0573  polyphosphate kinase  43.09 
 
 		 743 aa  527  1e-148  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1085  polyphosphate kinase  45.17 
 
 		 688 aa  527  1e-148  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.412303 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2466  polyphosphate kinase  43.56 
 
 		 693 aa  527  1e-148  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2316  Polyphosphate kinase  43.11 
 
 		 710 aa  525  1e-147  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1321  polyphosphate kinase  41.98 
 
 		 709 aa  525  1e-147  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1016  polyphosphate kinase  41.79 
 
 		 707 aa  523  1e-147  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.054944 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2935  polyphosphate kinase  43.58 
 
 		 702 aa  525  1e-147  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1041  polyphosphate kinase  42.41 
 
 		 713 aa  524  1e-147  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000177929  hitchhiker  0.0000312849 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0616  polyphosphate kinase  42.5 
 
 		 721 aa  520  1e-146  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0900  polyphosphate kinase  42.17 
 
 		 707 aa  519  1e-146  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1262  polyphosphate kinase  44.13 
 
 		 760 aa  515  1.0000000000000001e-145  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.53727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2235  Polyphosphate kinase  43 
 
 		 766 aa  517  1.0000000000000001e-145  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.640324  normal  0.28933 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3014  polyphosphate kinase  42.92 
 
 		 749 aa  516  1.0000000000000001e-145  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2726  polyphosphate kinase  42.98 
 
 		 749 aa  517  1.0000000000000001e-145  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00899985 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1954  polyphosphate kinase  43.68 
 
 		 714 aa  513  1e-144  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0944  Polyphosphate kinase  43.2 
 
 		 690 aa  512  1e-144  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.135403  normal  0.090034 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1153  polyphosphate kinase  43.79 
 
 		 769 aa  514  1e-144  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.862565  unclonable  0.0000000856651 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0084  polyphosphate kinase 1  42.55 
 
 		 745 aa  512  1e-144  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000685763 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8611  Polyphosphate kinase  43.87 
 
 		 687 aa  513  1e-144  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1333  polyphosphate kinase  41.9 
 
 		 709 aa  513  1e-144  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0259  Polyphosphate kinase  45.4 
 
 		 705 aa  514  1e-144  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1905  polyphosphate kinase  43.43 
 
 		 742 aa  509  1e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.775939 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6002  polyphosphate kinase  43.46 
 
 		 712 aa  510  1e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1576  Polyphosphate kinase  42.13 
 
 		 701 aa  509  1e-143  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2851  polyphosphate kinase  42.67 
 
 		 687 aa  510  1e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.911362 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0323  polyphosphate kinase  43.35 
 
 		 702 aa  511  1e-143  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1304  polyphosphate kinase  39.94 
 
 		 709 aa  509  1e-143  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0431  polyphosphate kinase  41.84 
 
 		 696 aa  512  1e-143  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21771  polyphosphate kinase  39.94 
 
 		 709 aa  510  1e-143  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.487235 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1925  polyphosphate kinase  43.43 
 
 		 742 aa  509  1e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2844  Polyphosphate kinase  42.59 
 
 		 728 aa  510  1e-143  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1105  Polyphosphate kinase  41.34 
 
 		 681 aa  509  1e-143  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.608169  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1971  polyphosphate kinase  43.43 
 
 		 742 aa  509  1e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.48971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3000  Polyphosphate kinase  43.2 
 
 		 693 aa  511  1e-143  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0028074 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2663  polyphosphate kinase  41.41 
 
 		 712 aa  506  9.999999999999999e-143  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.100975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1273  polyphosphate kinase  42.23 
 
 		 687 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.822681  normal  0.156597 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>