225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_21810 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



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Alignment on homolog gene
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E-value
Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2381  lysine 2,3-aminomutase  77.38 
 
 		 467 aa  719    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.119662  hitchhiker  0.000263761 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3716  Lysine 2,3-aminomutase  81.3 
 
 		 459 aa  785    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.769472  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21810  L-lysine 2,3-aminomutase  100 
 
 		 459 aa  948    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.359691  normal  0.123054 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2661  L-lysine 2,3-aminomutase  71.08 
 
 		 468 aa  678    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0706515  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2339  Lysine 2,3-aminomutase  70.61 
 
 		 456 aa  673    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000106877  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3953  Lysine 2,3-aminomutase  75.06 
 
 		 475 aa  716    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2262  radical SAM domain-containing protein  75.51 
 
 		 491 aa  710    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000903747  normal  0.0317169 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0181  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  32.33 
 
 		 473 aa  213  3.9999999999999995e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1080  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  31.47 
 
 		 436 aa  172  1e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0207  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  31.2 
 
 		 422 aa  170  6e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1886  L-lysine 2,3-aminomutase  29.82 
 
 		 420 aa  166  1.0000000000000001e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.185712 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0192  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  30.75 
 
 		 423 aa  162  1e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.863108  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0988  hypothetical protein  30.87 
 
 		 483 aa  160  5e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.709939  normal  0.113697 
 
 
-
 
NC_002950  PG1070  L-lysine 2,3-aminomutase  30.83 
 
 		 416 aa  159  1e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.628059 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0711  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  30.81 
 
 		 460 aa  149  8e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.62516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0171  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  31.72 
 
 		 420 aa  147  4.0000000000000006e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2886  L-lysine 2,3-aminomutase  29.84 
 
 		 416 aa  146  6e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.623873 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0696  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  30.43 
 
 		 440 aa  146  9e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000415374  normal  0.0401463 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2281  L-lysine 2,3-aminomutase  27.67 
 
 		 473 aa  144  3e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3042  L-lysine 2,3-aminomutase  27.67 
 
 		 473 aa  144  4e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.137592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0240  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.26 
 
 		 437 aa  144  4e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2334  L-lysine 2,3-aminomutase  27.25 
 
 		 473 aa  143  5e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2145  L-lysine 2,3-aminomutase  27.25 
 
 		 473 aa  144  5e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2083  lysine 2,3-aminomutase  27.25 
 
 		 473 aa  144  5e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2079  lysine 2,3-aminomutase  27.25 
 
 		 473 aa  144  5e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.492987  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2300  L-lysine 2,3-aminomutase  27.25 
 
 		 473 aa  144  5e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2408  L-lysine 2,3-aminomutase  27.25 
 
 		 473 aa  144  5e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.481514  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2325  L-lysine 2,3-aminomutase  27.25 
 
 		 473 aa  144  5e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1079  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  29.95 
 
 		 440 aa  142  9e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1688  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  29.1 
 
 		 472 aa  142  9e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.157129  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3041  L-lysine 2,3-aminomutase  29.28 
 
 		 527 aa  140  6e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1315  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  30.96 
 
 		 413 aa  139  8.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.603808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2118  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.61 
 
 		 472 aa  139  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.284772  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1223  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  29.62 
 
 		 433 aa  139  1e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1576  hypothetical protein  29.81 
 
 		 438 aa  138  2e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0162039 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2548  L-lysine 2,3-aminomutase  30.91 
 
 		 375 aa  138  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0211  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.42 
 
 		 437 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0670  L-lysine 2,3-aminomutase  29.3 
 
 		 414 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.420719 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0802  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  27.32 
 
 		 437 aa  135  1.9999999999999998e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3223  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  32.62 
 
 		 356 aa  134  3e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1643  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.22 
 
 		 393 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1402  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  30.91 
 
 		 415 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.522319  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0099  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  27.78 
 
 		 365 aa  132  2.0000000000000002e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.521426  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1301  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  30.91 
 
 		 415 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.156548  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0345  L-lysine 2,3-aminomutase  27.22 
 
 		 453 aa  131  3e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000388257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0740  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.85 
 
 		 406 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013552  DhcVS_197  L-lysine 2,3-aminomutase/beta-lysine acetyltransferase, GNAT family  27.99 
 
 		 730 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007498  Pcar_1401  hypothetical protein  26.68 
 
 		 457 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.536513  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1893  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  32.06 
 
 		 454 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.836798  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0189  L-lysine 2,3-aminomutase  26.58 
 
 		 454 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_569  lysine 2,3-aminomutase  25.94 
 
 		 439 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0601  L-lysine 2,3-aminomutase  26.2 
 
 		 439 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0221  GNAT family L-lysine 2,3-aminomutase/acetyltransferase  27.72 
 
 		 708 aa  127  3e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.893806  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0600  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  31.84 
 
 		 427 aa  127  3e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2520  hypothetical protein  31.88 
 
 		 347 aa  127  5e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.707016  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1916  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  29.35 
 
 		 403 aa  127  5e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3939  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  30.16 
 
 		 419 aa  125  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0153502  normal  0.0100362 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0796  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  25 
 
 		 374 aa  125  1e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0274  L-lysine 2,3-aminomutase  26.32 
 
 		 435 aa  125  2e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1795  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.14 
 
 		 433 aa  125  2e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0666  L-lysine 2,3-aminomutase  27.05 
 
 		 433 aa  125  2e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0598217  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0133  L-lysine 2,3-aminomutase  27.32 
 
 		 730 aa  125  2e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0106  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  27.6 
 
 		 433 aa  124  2e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.928991  normal  0.154212 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1776  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.14 
 
 		 411 aa  124  3e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0350095  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2398  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  32.19 
 
 		 344 aa  123  6e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.723604  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0136  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.82 
 
 		 396 aa  123  6e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.192198  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0628  radical SAM domain-containing protein  25.69 
 
 		 439 aa  123  9e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00861881  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1316  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.95 
 
 		 385 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246389  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1821  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  30.94 
 
 		 344 aa  121  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00597572 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0215  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  27.42 
 
 		 437 aa  120  6e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1649  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  26.23 
 
 		 437 aa  119  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1765  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  32.05 
 
 		 346 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.930699  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4126  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.53 
 
 		 350 aa  114  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.100876  normal  0.401423 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1840  L-lysine 2,3-aminomutase  29.72 
 
 		 344 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000138489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6024  L-lysine 2,3-aminomutase  28.98 
 
 		 349 aa  112  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2149  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  31.47 
 
 		 347 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000218503  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1754  L-lysine 2,3-aminomutase  29.24 
 
 		 353 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.117521  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3476  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  27.83 
 
 		 350 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0453  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  29.61 
 
 		 363 aa  111  3e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.284633 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0947  L-lysine 2,3-aminomutase  30.24 
 
 		 305 aa  111  3e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00167419  hitchhiker  0.00202939 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1666  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  29.63 
 
 		 366 aa  110  7.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.792489 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1302  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  27.75 
 
 		 402 aa  110  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.188876  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2740  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  31.8 
 
 		 347 aa  108  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.525407 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3908  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  29.23 
 
 		 362 aa  108  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.935392 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0599  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  24.79 
 
 		 432 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1408  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  25.19 
 
 		 427 aa  108  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3797  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  29.06 
 
 		 350 aa  108  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0445503  normal  0.635435 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1403  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  27.5 
 
 		 402 aa  107  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0377  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  30.04 
 
 		 356 aa  107  5e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.284595 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2547  L-lysine 2,3-aminomutase  27.25 
 
 		 402 aa  107  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010814  Glov_2103  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  27.89 
 
 		 341 aa  107  5e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011894  Mnod_1886  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  31.06 
 
 		 356 aa  105  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010424  Daud_1068  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  29.67 
 
 		 419 aa  105  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000489798  n/a   
 
 
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NC_007644  Moth_0457  L-lysine 2,3-aminomutase  24.44 
 
 		 415 aa  104  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0632034  normal  1 
 
 
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NC_013093  Amir_4485  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.16 
 
 		 381 aa  104  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008740  Maqu_2783  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  29.29 
 
 		 355 aa  103  6e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010338  Caul_0763  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  29.05 
 
 		 347 aa  102  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.475279  normal  0.239148 
 
 
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NC_007406  Nwi_1641  hypothetical protein  27.66 
 
 		 366 aa  102  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.123258  normal  0.700598 
 
 
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NC_013173  Dbac_0035  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  26.15 
 
 		 520 aa  102  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007204  Psyc_1679  L-lysine 2,3-aminomutase  27.16 
 
 		 335 aa  101  3e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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