25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1466 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1466  rod shape-determining protein MreC  100 
 
 
253 aa  510  1e-144  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1396  rod shape-determining protein MreC  39.83 
 
 
246 aa  184  9e-46  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0869  rod shape-determining protein MreC  35.63 
 
 
251 aa  173  2.9999999999999996e-42  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1351  rod shape-determining protein MreC  34.78 
 
 
248 aa  171  1e-41  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.457737  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0318  rod shape-determining protein MreC  36.48 
 
 
234 aa  168  7e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.462848  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2126  rod shape-determining protein MreC  36.25 
 
 
239 aa  162  5.0000000000000005e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.582677  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0326  rod shape-determining protein MreC  34.3 
 
 
249 aa  162  6e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0336673  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0304  rod shape-determining protein MreC  34.47 
 
 
236 aa  158  6e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0188  rod shape-determining protein MreC  36.25 
 
 
248 aa  158  9e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0250391  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1693  rod shape-determining protein MreC  33.88 
 
 
249 aa  157  2e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1380  rod shape-determining protein MreC  23.67 
 
 
276 aa  52.4  0.000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0471  rod shape-determining protein MreC  30.26 
 
 
285 aa  49.7  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2547  rod shape-determining protein MreC  31.01 
 
 
286 aa  49.3  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0163  rod shape-determining protein MreC  38.67 
 
 
296 aa  48.9  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2591  rod shape-determining protein MreC  28.28 
 
 
281 aa  48.5  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0671  rod shape-determining protein MreC  35.37 
 
 
357 aa  48.1  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.960312 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2133  rod shape-determining protein MreC  26.14 
 
 
277 aa  46.2  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00195363  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0184  rod shape-determining protein MreC  32.58 
 
 
286 aa  45.4  0.0008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00341566  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3357  rod shape-determining protein MreC  33.72 
 
 
338 aa  45.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.368226  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2494  rod shape-determining protein MreC  33.33 
 
 
274 aa  43.9  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0237  rod shape-determining protein MreC  34.72 
 
 
292 aa  43.9  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1938  rod shape-determining protein MreC  36.59 
 
 
267 aa  43.9  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000368183  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1258  rod shape-determining protein MreC  36.62 
 
 
292 aa  43.5  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0759528  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1302  rod shape-determining protein MreC  25.49 
 
 
283 aa  42.7  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.800161  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1048  rod shape-determining protein MreC  37.65 
 
 
272 aa  42.7  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00267532  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>