35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1202 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1202  hypothetical protein  100 
 
 
326 aa  676    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.242848  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0405  ribonuclease HII (RNase HII)  58.72 
 
 
328 aa  414  1e-114  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0188  hypothetical protein  59.08 
 
 
330 aa  403  1e-111  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.118509  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0540  hypothetical protein  29.6 
 
 
298 aa  126  7e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0242  hypothetical protein  25.82 
 
 
299 aa  104  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00206072  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2276  hypothetical protein  28.21 
 
 
303 aa  102  6e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000101382  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2230  hypothetical protein  32.16 
 
 
301 aa  102  9e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0045539  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1841  hypothetical protein  32.11 
 
 
307 aa  102  1e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3304  hypothetical protein  25.81 
 
 
293 aa  100  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.179298  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1524  hypothetical protein  29.47 
 
 
297 aa  93.6  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0476876  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1046  hypothetical protein  25.88 
 
 
294 aa  92  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.899913  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2692  hypothetical protein  29.05 
 
 
297 aa  91.3  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.45501e-19 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2131  hypothetical protein  27.13 
 
 
304 aa  88.2  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.439233  normal  0.376692 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2382  hypothetical protein  32.97 
 
 
299 aa  87.4  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000543034  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3004  hypothetical protein  26.91 
 
 
297 aa  87  4e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.073246  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1396  hypothetical protein  27.41 
 
 
300 aa  85.9  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000166179  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1208  hypothetical protein  26.79 
 
 
300 aa  84.7  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000509296  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2650  hypothetical protein  27.71 
 
 
293 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0560  hypothetical protein  24.07 
 
 
312 aa  82.8  0.000000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.15423 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1574  hypothetical protein  24.85 
 
 
323 aa  82.8  0.000000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  1.95282e-16 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2675  hypothetical protein  29.89 
 
 
296 aa  80.9  0.00000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000384013  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0895  hypothetical protein  24.53 
 
 
297 aa  79  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.703306  normal  0.304644 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0694  hypothetical protein  24.76 
 
 
294 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.135494 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0998  hypothetical protein  28.11 
 
 
299 aa  75.5  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.930376 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2174  hypothetical protein  31.67 
 
 
303 aa  72.4  0.000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.78837 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0720  hypothetical protein  25.49 
 
 
296 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1597  hypothetical protein  27.96 
 
 
297 aa  70.5  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00721775  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0421  CopG family transcriptional regulator  22.64 
 
 
300 aa  68.9  0.0000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0923305 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2109  hypothetical protein  27.66 
 
 
298 aa  68.6  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1020  hypothetical protein  27.42 
 
 
304 aa  65.9  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0104697  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0117  hypothetical protein  28.34 
 
 
283 aa  64.3  0.000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.256011  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0712  hypothetical protein  23.12 
 
 
300 aa  60.8  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0067  Uncharacterized conserved protein UCP018688  28.23 
 
 
318 aa  57.8  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.324653  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2742  hypothetical protein  26.63 
 
 
295 aa  52  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00120775  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0675  hypothetical protein  23.37 
 
 
317 aa  42.7  0.009  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.924867  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>