36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0252 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0252  hypothetical protein  100 
 
 
216 aa  437  9.999999999999999e-123  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2188  protein of unknown function DUF178  49.07 
 
 
221 aa  205  4e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.745567  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0237  hypothetical protein  47.69 
 
 
227 aa  193  2e-48  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1477  hypothetical protein  47.71 
 
 
223 aa  185  4e-46  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0543  hypothetical protein  43.18 
 
 
232 aa  184  1.0000000000000001e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.040615  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1302  hypothetical protein  47.25 
 
 
223 aa  182  2.0000000000000003e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0440  hypothetical protein  46.79 
 
 
223 aa  182  3e-45  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0346  hypothetical protein  44.75 
 
 
230 aa  180  1e-44  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1291  conserved hypothetical protein (DUF178 domain protein)  47.64 
 
 
221 aa  176  3e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1558  hypothetical protein  44.5 
 
 
227 aa  174  8e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0858753  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2017  hypothetical protein  29.28 
 
 
273 aa  69.7  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.138811  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0757  protein of unknown function DUF752  33.15 
 
 
500 aa  63.5  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1828  hypothetical protein  26.74 
 
 
273 aa  62.8  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000107819  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2125  hypothetical protein  23.46 
 
 
275 aa  60.1  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4076  hypothetical protein  22.44 
 
 
304 aa  58.2  0.00000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0359636 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0524  hypothetical protein  26.53 
 
 
253 aa  58.2  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4475  hypothetical protein  22.05 
 
 
283 aa  57.4  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1276  hypothetical protein  25 
 
 
278 aa  57.8  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1090  hypothetical protein  31.16 
 
 
274 aa  56.2  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0796  hypothetical protein  23.64 
 
 
291 aa  56.2  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0141719  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0986  hypothetical protein  26.82 
 
 
278 aa  55.5  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167852  decreased coverage  0.00614129 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0261  hypothetical protein  21.4 
 
 
280 aa  53.5  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.611921  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1158  hypothetical protein  27.07 
 
 
275 aa  53.9  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.640507  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3086  hypothetical protein  25.1 
 
 
286 aa  53.5  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000103866 
 
 
-
 
NC_002620  TC0711  hypothetical protein  24.21 
 
 
266 aa  50.4  0.00002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2194  hypothetical protein  26.87 
 
 
284 aa  48.9  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0670  protein of unknown function DUF178  26.39 
 
 
285 aa  48.5  0.00007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1564  protein of unknown function DUF178  26.01 
 
 
273 aa  47.8  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000640469  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2019  hypothetical protein  26.44 
 
 
275 aa  47.8  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000126009  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2652  protein of unknown function DUF178  26.01 
 
 
273 aa  47  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000132342 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0522  hypothetical protein  20.53 
 
 
292 aa  46.6  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.783802 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1601  protein of unknown function DUF178  24.43 
 
 
275 aa  46.6  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.506959  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0737  hypothetical protein  25.69 
 
 
238 aa  45.8  0.0005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000184342 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3342  hypothetical protein  30.08 
 
 
278 aa  45.4  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1418  hypothetical protein  25.93 
 
 
245 aa  44.7  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0657187 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1524  protein of unknown function DUF178  24.14 
 
 
271 aa  42.7  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.410442  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>