185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2202 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2202  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  100 
 
 		 118 aa  242  9.999999999999999e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.18705  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0174  ferredoxin  46.27 
 
 		 81 aa  53.5  0.0000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2121  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  36.49 
 
 		 335 aa  52  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.412453  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1047  ferredoxin  49.06 
 
 		 248 aa  50.8  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2240  electron transport complex protein RnfB  34.04 
 
 		 190 aa  50.4  0.000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000443884 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0244  ferredoxin  41.79 
 
 		 83 aa  48.9  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.232461  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0460  ferredoxin, 4Fe-4S  43.84 
 
 		 87 aa  48.5  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0781  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  30.99 
 
 		 623 aa  48.5  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1020  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.03 
 
 		 85 aa  48.5  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.17542  normal  0.0132682 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1929  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  45.59 
 
 		 84 aa  48.1  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0121325  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1895  electron transport complex protein RnfB  35 
 
 		 207 aa  47.4  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2007  electron transport complex protein RnfB  35 
 
 		 207 aa  47.4  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0747  ferredoxin  39.47 
 
 		 82 aa  47.4  0.00007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3513  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.19 
 
 		 85 aa  47  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2253  electron transport complex protein RnfB  35 
 
 		 188 aa  47  0.00008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0146582  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0403  ferredoxin, 4Fe-4S  40.3 
 
 		 81 aa  46.6  0.0001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3724  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  42.03 
 
 		 85 aa  46.2  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.170973 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1249  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  26.83 
 
 		 1073 aa  46.6  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0309731 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1604  ferredoxin, 4Fe-4S  40.3 
 
 		 81 aa  46.6  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0378  ferredoxin, 4Fe-4S  40.3 
 
 		 81 aa  46.6  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4509  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  42.86 
 
 		 404 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000389854 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19260  electron transport complex protein RnfB  42.65 
 
 		 187 aa  46.2  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.772376  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50970  Electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  36.23 
 
 		 174 aa  45.4  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0817561  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2936  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  44 
 
 		 82 aa  46.2  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1015  ferredoxin  43.4 
 
 		 279 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0219422  normal  0.72194 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0946  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  41.94 
 
 		 577 aa  46.2  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1820  electron transport complex protein RnfB  35 
 
 		 192 aa  46.2  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173992 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3887  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  41.27 
 
 		 291 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.367781 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0327  putative 4Fe-4S ferredoxin  42.03 
 
 		 82 aa  45.1  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18930  electron transport complex protein RnfB  38.46 
 
 		 188 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000143693  normal  0.123767 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2776  Indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  37.7 
 
 		 612 aa  44.7  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1096  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.62 
 
 		 100 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0360  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  42.03 
 
 		 82 aa  45.1  0.0004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.122203 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1167  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.62 
 
 		 100 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.363528  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0381  ferredoxin protein  41.03 
 
 		 83 aa  44.7  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.614433  hitchhiker  0.00782487 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1041  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  35.62 
 
 		 100 aa  44.3  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1887  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  40.38 
 
 		 212 aa  44.7  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0233  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.3 
 
 		 83 aa  44.7  0.0005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0249  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.86 
 
 		 85 aa  44.3  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000541345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1236  ferredoxin  39.34 
 
 		 279 aa  44.7  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.41049 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2064  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  40.38 
 
 		 217 aa  44.3  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.295108 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0720  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  36.92 
 
 		 681 aa  44.3  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.340491  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4148  iron-sulfur cluster-binding protein  44.23 
 
 		 291 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2557  electron transport complex protein RnfB  40 
 
 		 189 aa  44.3  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.229137  normal  0.143119 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1525  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.57 
 
 		 85 aa  43.9  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.803833  normal  0.0618642 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2170  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  40.38 
 
 		 221 aa  43.9  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.211409 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1176  ferredoxin  32.93 
 
 		 290 aa  43.9  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1552  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.3 
 
 		 93 aa  43.9  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.145695  normal  0.516279 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1386  hydrogenases, Fe-only  31.87 
 
 		 421 aa  43.9  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.999103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1539  electron transfer flavoprotein beta-subunit  35.82 
 
 		 439 aa  43.9  0.0008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.345257  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2940  hypothetical protein  44.23 
 
 		 204 aa  43.5  0.0009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1070  ferredoxin  42.37 
 
 		 417 aa  43.5  0.0009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000699309  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1277  Fe-hydrogenase large subunit family protein  44.9 
 
 		 493 aa  43.5  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000478337  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2794  hypothetical protein  44.23 
 
 		 204 aa  43.5  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2043  electron transport complex protein RnfB  41.27 
 
 		 189 aa  43.5  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0243874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1558  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  43.42 
 
 		 81 aa  43.5  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2324  electron transport complex protein RnfB  34.48 
 
 		 192 aa  43.1  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01788  ferredoxin  35.14 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0102822  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3310  ferredoxin  39.34 
 
 		 279 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2024  electron transport complex protein RnfB  34.48 
 
 		 192 aa  43.1  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1628  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.79 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1067  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36 
 
 		 83 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3343  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.49 
 
 		 85 aa  43.5  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2190  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.49 
 
 		 81 aa  43.1  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.377354  normal  0.457054 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2795  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase, delta subunit  37.5 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2067  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  40.32 
 
 		 189 aa  43.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0305749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2785  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.84 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.998826 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1917  electron transport complex protein RnfB  35.9 
 
 		 191 aa  43.1  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1403  electron transport complex protein RnfB  44.23 
 
 		 191 aa  43.5  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.466807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1217  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.86 
 
 		 398 aa  42.7  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1174  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.67 
 
 		 83 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1639  electron transport complex protein RnfB  40.62 
 
 		 188 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1930  ferredoxin  34.15 
 
 		 316 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3619  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  38.46 
 
 		 238 aa  42.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0111565  normal  0.0672308 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1337  ferredoxin  34.15 
 
 		 316 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0081  ferredoxin hydrogenase  40.32 
 
 		 421 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2096  ferredoxin  38.6 
 
 		 291 aa  42.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.12693 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2928  ferredoxin  35.71 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.314785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1283  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  42.65 
 
 		 86 aa  42.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3378  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.77 
 
 		 947 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.943439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0208  ferredoxin  36.49 
 
 		 86 aa  42.4  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2173  electron transport complex protein RnfB  38.96 
 
 		 193 aa  42.4  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0287954  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0115  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.62 
 
 		 372 aa  42.4  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.012041  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3193  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.67 
 
 		 83 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1754  ferredoxin  37.14 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1023  ferredoxin  34.15 
 
 		 290 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0299  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  44.12 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.364798  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0842  ferredoxin  34.15 
 
 		 290 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.736914  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3337  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.67 
 
 		 83 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3199  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.67 
 
 		 83 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1184  ferredoxin  34.15 
 
 		 290 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.403048  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0306  ferredoxin  34.15 
 
 		 290 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0392  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  43.75 
 
 		 286 aa  42.7  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.458285  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2354  electron transport complex protein RnfB  42.03 
 
 		 189 aa  42.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.720002  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0013  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.6 
 
 		 282 aa  42.7  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5668  ferredoxin  42.31 
 
 		 334 aa  41.6  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1035  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  33.77 
 
 		 190 aa  41.6  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1063  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.67 
 
 		 83 aa  41.6  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1135  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.67 
 
 		 83 aa  41.6  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2001  electron transport complex protein RnfB  32.94 
 
 		 192 aa  42  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000498524  normal  0.338717 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>