More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1460 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_1460  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 
288 aa  557  1e-158  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.058733  normal  0.145252 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1421  rhodanese domain-containing protein  90.62 
 
 
288 aa  491  9.999999999999999e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.692836  decreased coverage  0.00000340615 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27500  rhodanese-related sulfurtransferase  59.14 
 
 
280 aa  308  9e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1631  Rhodanese domain protein  61.73 
 
 
291 aa  297  2e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00167409  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1417  thiosulfate sulfurtransferase  53.79 
 
 
289 aa  283  3.0000000000000004e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2381  rhodanese domain-containing protein  58.58 
 
 
275 aa  281  1e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.305388 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1860  Rhodanese domain protein  60.07 
 
 
282 aa  280  2e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0293763  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1466  Rhodanese domain protein  55.32 
 
 
282 aa  276  2e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0394652  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7064  thiosulfate sulfurtransferase  59.38 
 
 
270 aa  275  5e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.508402  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2019  ketopantoate reductase ApbA/PanE  55.09 
 
 
627 aa  259  2e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.691708  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2918  thiosulfate sulfurtransferase  54.23 
 
 
276 aa  247  1e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5604  Rhodanese domain protein  49.65 
 
 
287 aa  246  3e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2415  ketopantoate reductase ApbA/PanE-like  53.06 
 
 
687 aa  239  5e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.427729  normal  0.379727 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4550  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  53.56 
 
 
419 aa  236  4e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.757162 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1776  Rhodanese domain protein  50.17 
 
 
301 aa  230  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07810  rhodanese-related sulfurtransferase  54.02 
 
 
375 aa  229  5e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2596  Rhodanese domain protein  54.04 
 
 
282 aa  226  3e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.126951  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0677  Rhodanese domain protein  53.29 
 
 
299 aa  222  6e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4306  Rhodanese domain protein  52.99 
 
 
272 aa  221  9.999999999999999e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.913868  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3789  Rhodanese domain protein  49.66 
 
 
301 aa  217  2e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0279123  normal  0.459796 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29210  rhodanese-related sulfurtransferase  53.43 
 
 
297 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2635  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  47.12 
 
 
278 aa  213  2.9999999999999995e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.273027  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3069  Rhodanese domain protein  53.1 
 
 
277 aa  211  9e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.597651 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4099  putative 3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  47.7 
 
 
284 aa  209  4e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1769  rhodanese domain-containing protein  45.32 
 
 
284 aa  209  5e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000405789  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06480  rhodanese-related sulfurtransferase  51.54 
 
 
310 aa  208  7e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0631  Rhodanese domain protein  42.91 
 
 
305 aa  208  7e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0797433  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32980  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase protein  50.96 
 
 
284 aa  206  3e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2370  Rhodanese domain protein  50.53 
 
 
298 aa  204  1e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000188451 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0726  rhodanese domain-containing protein  44.61 
 
 
291 aa  202  7e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.893447  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2620  rhodanese-like protein  46.4 
 
 
285 aa  201  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.632482 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4806  thiosulfate sulfurtransferase  50.35 
 
 
279 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.404932  normal  0.290903 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5343  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  44.87 
 
 
284 aa  199  3e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2489  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  43.62 
 
 
282 aa  199  5e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0321  rhodanese domain-containing protein  42.76 
 
 
288 aa  198  7e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.183819 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2831  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  45.83 
 
 
289 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0952  Rhodanese domain protein  43.51 
 
 
284 aa  197  2.0000000000000003e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.63885  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4149  Rhodanese domain protein  47.69 
 
 
283 aa  196  3e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4720  thiosulfate sulfurtransferase  50.9 
 
 
270 aa  196  3e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.190744  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6785  Rhodanese domain protein  44.49 
 
 
289 aa  196  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0412413  hitchhiker  0.0000256266 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0420  rhodanese-like domain protein  44.44 
 
 
285 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4756  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  44.24 
 
 
284 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0846963 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5322  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  44.68 
 
 
281 aa  195  6e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.710111 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3952  rhodanese domain-containing protein  45.66 
 
 
290 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5118  rhodanese domain protein  44.36 
 
 
284 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47500  putative 3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  44.41 
 
 
284 aa  194  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1452  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  48.43 
 
 
282 aa  194  2e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0188  Rhodanese domain protein  45.36 
 
 
285 aa  193  2e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12314  thiosulfate sulfurtransferase sseB  44.52 
 
 
284 aa  193  2e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0305  Rhodanese domain protein  40.78 
 
 
285 aa  192  7e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4992  rhodanese domain-containing protein  44 
 
 
284 aa  192  7e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5105  thiosulfate sulfurtransferase  51.26 
 
 
269 aa  191  8e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.384708  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5168  rhodanese domain-containing protein  43.97 
 
 
284 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0325  rhodanese domain-containing protein  40.64 
 
 
289 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2397  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  40.64 
 
 
289 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0847  rhodanese domain-containing protein  40.64 
 
 
289 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.641684  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1507  rhodanese domain-containing protein  40.64 
 
 
289 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1701  rhodanese domain-containing protein  40.64 
 
 
289 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0359  rhodanese domain-containing protein  40.64 
 
 
289 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2539  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  40.64 
 
 
289 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.920072  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4824  rhodanese domain-containing protein  43.73 
 
 
289 aa  189  4e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0196782  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0610  rhodanese domain-containing protein  41.4 
 
 
289 aa  189  4e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0347  rhodanese domain-containing protein  43.96 
 
 
284 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.772652  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7246  rhodanese-related sulfurtransferase  42.7 
 
 
279 aa  188  9e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0149117  normal  0.617373 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1776  Rhodanese domain protein  47.71 
 
 
335 aa  187  2e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.305984  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0177  Rhodanese domain-containing protein  46.35 
 
 
278 aa  186  3e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000691288  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2226  thiosulfate sulfurtransferase protein  41.11 
 
 
296 aa  186  4e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2038  Rhodanese domain protein  42.16 
 
 
295 aa  186  4e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2431  Rhodanese domain protein  42.56 
 
 
295 aa  185  7e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1239  Rhodanese domain protein  42.91 
 
 
284 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.954881  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0877  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  45 
 
 
287 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0159  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  44.22 
 
 
292 aa  184  2.0000000000000003e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3246  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  42.21 
 
 
289 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0068458 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1326  Rhodanese domain protein  43.57 
 
 
283 aa  183  3e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0377463  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3055  rhodanese-like protein  44.13 
 
 
279 aa  182  5.0000000000000004e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.403851  normal  0.0127336 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0764  Rhodanese domain protein  41.92 
 
 
281 aa  182  5.0000000000000004e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1892  Rhodanese domain protein  37.87 
 
 
278 aa  182  7e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.474796  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1496  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  39.06 
 
 
300 aa  180  2e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00777  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  45.1 
 
 
290 aa  180  2.9999999999999997e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0224116  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3367  rhodanese domain-containing protein  43.21 
 
 
312 aa  179  4.999999999999999e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2427  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  40.49 
 
 
280 aa  179  5.999999999999999e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.244086 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3652  rhodanese domain-containing protein  42.97 
 
 
289 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.865325  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4490  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  42.97 
 
 
289 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3875  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  42.97 
 
 
289 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.403807 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1048  Rhodanese domain protein  42.63 
 
 
281 aa  176  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.11236 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3212  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  42.75 
 
 
299 aa  176  3e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.389078  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0354  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  45.42 
 
 
285 aa  176  4e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3772  rhodanese domain-containing protein  40.68 
 
 
289 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0206148 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2237  rhodanese domain-containing protein  38.78 
 
 
304 aa  174  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.814145  normal  0.0284823 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1705  rhodanese-like domain-containing protein  36.46 
 
 
277 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0165982  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1745  rhodanese-like domain protein  36.46 
 
 
277 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000561696  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2215  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  42.59 
 
 
289 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.255157  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1310  rhodanese domain-containing protein  35.36 
 
 
276 aa  172  5e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.965267  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2636  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  41.55 
 
 
292 aa  172  7.999999999999999e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.488566  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1455  thiosulfate sulfurtransferase  36.1 
 
 
277 aa  171  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11880  rhodanese-related sulfurtransferase  43.17 
 
 
307 aa  171  1e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0631029  normal  0.808545 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1483  rhodanese-like domain-containing protein  36.1 
 
 
277 aa  170  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1599  rhodanese-like domain-containing protein  36.1 
 
 
277 aa  170  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.317702  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1742  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  37.41 
 
 
300 aa  171  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.782779 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1634  rhodanese-like domain protein  36.82 
 
 
277 aa  170  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0494002  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>