57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0874 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0874  hypothetical protein  100 
 
 		 314 aa  565  1e-160  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0819  hypothetical protein  89.07 
 
 		 316 aa  434  1e-121  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0374787 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6497  protein of unknown function DUF606  57 
 
 		 330 aa  262  6e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1329  hypothetical protein  46.84 
 
 		 315 aa  212  5.999999999999999e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04990  hypothetical protein  50.52 
 
 		 318 aa  206  6e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1366  protein of unknown function DUF606  45.16 
 
 		 333 aa  198  7.999999999999999e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000130527 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1082  hypothetical protein  35.59 
 
 		 321 aa  160  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3818  hypothetical protein  37.84 
 
 		 323 aa  159  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3740  hypothetical protein  37.84 
 
 		 323 aa  159  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3920  putative inner membrane protein  37.84 
 
 		 323 aa  159  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.324261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3751  putative inner membrane protein  37.84 
 
 		 323 aa  159  8e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3861  hypothetical protein  37.84 
 
 		 322 aa  159  9e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1512  protein of unknown function DUF606  42.59 
 
 		 365 aa  143  4e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.777644  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2602  hypothetical protein  40.55 
 
 		 333 aa  126  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189409  normal  0.971283 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12580  hypothetical protein  33.92 
 
 		 335 aa  86.3  6e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.616981 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0276  hypothetical protein  24.91 
 
 		 297 aa  62  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0196948  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0835  hypothetical protein  32.35 
 
 		 317 aa  59.7  0.00000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1919  hypothetical protein  25.98 
 
 		 307 aa  58.2  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2106  protein of unknown function DUF606  40.32 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0923123 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0641  hypothetical protein  25.12 
 
 		 309 aa  55.1  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0656  hypothetical protein  25.12 
 
 		 309 aa  55.1  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.473315  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2001  hypothetical protein  24.51 
 
 		 318 aa  54.7  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1092  hypothetical protein  32.61 
 
 		 163 aa  55.1  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0736  hypothetical protein  38.69 
 
 		 149 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.300113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2829  hypothetical protein  35.48 
 
 		 149 aa  54.3  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2954  hypothetical protein  35.48 
 
 		 149 aa  53.9  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0533653 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2509  protein of unknown function DUF606  36.03 
 
 		 144 aa  53.5  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2811  hypothetical protein  35.48 
 
 		 149 aa  53.9  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.989638  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2577  protein of unknown function DUF606  33.58 
 
 		 183 aa  53.1  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2916  hypothetical protein  30 
 
 		 151 aa  52.8  0.000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1547  protein of unknown function DUF606  35.54 
 
 		 149 aa  52.4  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0036  hypothetical protein  31.97 
 
 		 145 aa  51.2  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1299  hypothetical protein  21.7 
 
 		 386 aa  50.4  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0378  protein of unknown function DUF606  28.29 
 
 		 147 aa  49.3  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.918224 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0048  hypothetical protein  34.17 
 
 		 154 aa  49.3  0.00009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0915956  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3639  hypothetical protein  37.17 
 
 		 174 aa  49.3  0.00009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1329  hypothetical protein  34.45 
 
 		 154 aa  48.1  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.886868 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3699  hypothetical protein  30.71 
 
 		 146 aa  48.1  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4070  hypothetical protein  34.51 
 
 		 145 aa  47.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000215234  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3013  protein of unknown function DUF606  35.51 
 
 		 146 aa  47.8  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.442084  normal  0.195062 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0012  protein of unknown function DUF606  32.32 
 
 		 151 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0252  hypothetical protein  37.17 
 
 		 147 aa  46.2  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0822  hypothetical protein  32.54 
 
 		 160 aa  46.2  0.0007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2952  protein of unknown function DUF606  32 
 
 		 146 aa  45.8  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_7394  hypothetical protein  34.59 
 
 		 156 aa  45.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0620055  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4141  hypothetical protein  34.59 
 
 		 156 aa  45.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4040  protein of unknown function DUF606  27.63 
 
 		 148 aa  45.4  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000995458 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0485  hypothetical protein  37.17 
 
 		 178 aa  45.4  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.482808  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1865  protein of unknown function DUF606  34.29 
 
 		 144 aa  44.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.522195 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3798  hypothetical protein  29.29 
 
 		 153 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000122889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4323  hypothetical protein  35.94 
 
 		 163 aa  45.1  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.313057  normal  0.0982229 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2679  hypothetical protein  32.45 
 
 		 145 aa  44.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0814  protein of unknown function DUF606  26.62 
 
 		 148 aa  43.1  0.005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6653  protein of unknown function DUF606  33.9 
 
 		 144 aa  43.1  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.508565  normal  0.0277102 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5701  hypothetical protein  36.9 
 
 		 145 aa  43.1  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2825  hypothetical protein  31.45 
 
 		 172 aa  42.4  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0371  hypothetical protein  28.57 
 
 		 153 aa  42.4  0.01  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>