20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0436 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_0436  hypothetical protein  100 
 
 
143 aa  279  8.000000000000001e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0523  hypothetical protein  87.41 
 
 
154 aa  236  6.999999999999999e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.680982  hitchhiker  0.005662 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5294  hypothetical protein  54.55 
 
 
155 aa  155  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0304  hypothetical protein  58.04 
 
 
148 aa  155  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5195  hypothetical protein  51.39 
 
 
154 aa  142  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0603598  normal  0.873958 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0085  hypothetical protein  43.36 
 
 
151 aa  110  7.000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.623619  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4086  hypothetical protein  35.25 
 
 
173 aa  70.9  0.000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3955  hypothetical protein  33.09 
 
 
170 aa  65.1  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0785273  normal  0.998705 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66450  hypothetical protein  32.2 
 
 
150 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5763  hypothetical protein  33.04 
 
 
150 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3475  hypothetical protein  34.53 
 
 
173 aa  62  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.21997  normal  0.540181 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0555  hypothetical protein  28.57 
 
 
147 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000129509 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2571  hypothetical protein  31.3 
 
 
171 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30030  hypothetical protein  32.17 
 
 
184 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0622  hypothetical protein  28.45 
 
 
162 aa  46.6  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0251  hypothetical protein  33.01 
 
 
238 aa  44.3  0.0006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.615513 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0225  hypothetical protein  31.07 
 
 
244 aa  43.5  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2935  hypothetical protein  31.86 
 
 
180 aa  41.6  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0628257 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0892  hypothetical protein  32.62 
 
 
157 aa  42  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.44213  normal  0.640114 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2032  hypothetical protein  29.71 
 
 
230 aa  40.4  0.009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.488451  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>