64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_1278 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_1278  cell wall hydrolase/autolysin  100 
 
 		 247 aa  500  1e-141  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3885  cell wall hydrolase/autolysin  96.36 
 
 		 248 aa  484  1e-136  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1766  cell wall hydrolase/autolysin  62.18 
 
 		 199 aa  251  6e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000016158  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0878  cell wall hydrolase/autolysin  32.49 
 
 		 219 aa  97.8  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2816  cell wall hydrolase/autolysin  33.84 
 
 		 213 aa  94.4  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.812888  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1651  cell wall hydrolase/autolysin  33.92 
 
 		 1504 aa  74.3  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0071  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.17 
 
 		 238 aa  57  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000157753  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1578  cell wall hydrolase/autolysin  31.4 
 
 		 240 aa  56.2  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.36346  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1281  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.37 
 
 		 287 aa  56.2  0.0000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0776  cell wall hydrolase/autolysin  26.27 
 
 		 236 aa  55.5  0.0000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1702  cell wall hydrolase/autolysin  31.43 
 
 		 223 aa  54.3  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2446  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.77 
 
 		 245 aa  53.5  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.662097  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2277  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.77 
 
 		 245 aa  53.5  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.110175  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2237  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.77 
 
 		 245 aa  53.5  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0334199  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2461  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, family 3  30.77 
 
 		 245 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2195  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.77 
 
 		 245 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.2045  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0926  cell wall hydrolase/autolysin  27.27 
 
 		 219 aa  52.4  0.000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0477  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  24.15 
 
 		 377 aa  51.6  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2360  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  23.3 
 
 		 344 aa  50.8  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.26107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7088  cell wall hydrolase/autolysin  26.9 
 
 		 379 aa  51.2  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1064  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.01 
 
 		 190 aa  51.2  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000172144  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0368  cell wall hydrolase/autolysin  26.32 
 
 		 474 aa  49.7  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000387898  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1724  cell wall hydrolase/autolysin  31.54 
 
 		 257 aa  50.1  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0475505  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2834  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.31 
 
 		 244 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06721  cell wall hydrolase/autolysin  29.95 
 
 		 361 aa  49.7  0.00005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.347132  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0616  cell wall hydrolase/autolysin  29.95 
 
 		 361 aa  49.3  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2870  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.54 
 
 		 244 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00570311  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2849  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.54 
 
 		 244 aa  48.9  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000907792  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1804  cell wall hydrolase/autolysin  28.45 
 
 		 240 aa  48.9  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.052646  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0185  cell wall hydrolase/autolysin  26.14 
 
 		 948 aa  48.5  0.00009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00443483  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0796  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.4 
 
 		 540 aa  48.5  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.06495e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4581  cell wall hydrolase/autolysin  23.3 
 
 		 392 aa  47.8  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170729 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0587  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  23.35 
 
 		 352 aa  48.1  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2461  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.77 
 
 		 244 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1350  cell wall hydrolase/autolysin  26.94 
 
 		 529 aa  47  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000116689  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06421  cell wall hydrolase/autolysin  29.95 
 
 		 361 aa  47  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0851  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25.91 
 
 		 529 aa  46.6  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000657012  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0898  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25.91 
 
 		 529 aa  46.6  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000140449  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0986  surface-layer N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25.91 
 
 		 529 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.46837e-61 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0800  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.82 
 
 		 529 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000328713  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1628  S-layer protein and N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase fusion protein  27.8 
 
 		 413 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000159428  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0517  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25.2 
 
 		 657 aa  45.8  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000337238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3983  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.82 
 
 		 261 aa  45.4  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0529665  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1037  cell wall hydrolase/autolysin  30.95 
 
 		 282 aa  45.4  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000520561  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1079  surface-layer N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.82 
 
 		 529 aa  45.4  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000334554  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2909  cell wall hydrolase/autolysin  25 
 
 		 227 aa  45.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1016  cell wall hydrolase/autolysin  30.81 
 
 		 352 aa  45.4  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000634005  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39690  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  24.51 
 
 		 382 aa  45.4  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.587198 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06811  cell wall hydrolase/autolysin  30.89 
 
 		 364 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.197381  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2112  cell wall hydrolase/autolysin  23.78 
 
 		 373 aa  43.9  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0823125  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2183  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.34 
 
 		 431 aa  43.5  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000115725 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2258  cell wall hydrolase/autolysin  26.86 
 
 		 876 aa  43.1  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000147959  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9044  cell wall hydrolase/autolysin  24.79 
 
 		 381 aa  43.1  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2941  cell wall hydrolase/autolysin  27.5 
 
 		 250 aa  43.1  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000101461  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2324  cell wall hydrolase/autolysin  24.54 
 
 		 538 aa  43.1  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000122542  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0859  cell wall hydrolase/autolysin  29.41 
 
 		 231 aa  43.1  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.751216 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5099  cell wall hydrolase/autolysin  23.44 
 
 		 387 aa  43.1  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000380245 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1162  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.05 
 
 		 233 aa  42.7  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.820741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3626  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25 
 
 		 476 aa  42.7  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000133632  normal  0.124331 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3244  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  24.75 
 
 		 815 aa  42.7  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1272  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  23 
 
 		 242 aa  42.4  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000305091 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0984  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.82 
 
 		 529 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000810888  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0724  cell wall hydrolase/autolysin  27.91 
 
 		 527 aa  42.4  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000386208  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4727  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  23.97 
 
 		 619 aa  42  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0152355  normal  0.26499 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>