42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_4479 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_4479  hypothetical protein  100 
 
 		 68 aa  137  6e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000217224 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4887  hypothetical protein  81.36 
 
 		 64 aa  107  5e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4304  hypothetical protein  80.36 
 
 		 67 aa  103  6e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.402818  hitchhiker  0.0000000000823347 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4341  hypothetical protein  80.36 
 
 		 67 aa  103  6e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.561901  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4501  hypothetical protein  80.36 
 
 		 67 aa  103  6e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.365447  normal  0.103968 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4359  hypothetical protein  80.36 
 
 		 67 aa  103  7e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.182654  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3921  hypothetical protein  75.41 
 
 		 67 aa  103  7e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.393778  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4740  hypothetical protein  80.36 
 
 		 67 aa  103  8e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4226  hypothetical protein  81.36 
 
 		 65 aa  102  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4124  hypothetical protein  74.58 
 
 		 67 aa  102  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.21413  normal  0.564732 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3815  hypothetical protein  75 
 
 		 63 aa  102  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.595164  normal  0.0528702 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3919  hypothetical protein  78.57 
 
 		 67 aa  101  3e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.472062  normal  0.020645 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4011  hypothetical protein  74.58 
 
 		 67 aa  100  5e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.127403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0309  membrane protein-like protein  74.14 
 
 		 70 aa  99.8  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4031  membrane protein-like protein  80 
 
 		 73 aa  99  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.300951  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3636  hypothetical protein  71.19 
 
 		 65 aa  97.8  4e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000809005  normal  0.198807 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3706  hypothetical protein  64.71 
 
 		 66 aa  92.8  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00936717  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1156  membrane protein-like protein  60 
 
 		 79 aa  87  8e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0130404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3486  membrane protein-like  61.67 
 
 		 88 aa  86.7  9e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3116  hypothetical protein  57.14 
 
 		 94 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2256  membrane protein-like protein  60.71 
 
 		 86 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0186977  normal  0.1342 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002425  membrane protein  64.81 
 
 		 130 aa  81.3  0.000000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03638  hypothetical protein  62.96 
 
 		 132 aa  80.9  0.000000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0749  membrane protein  58.46 
 
 		 83 aa  81.3  0.000000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.90984  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0490  hypothetical protein  69.23 
 
 		 73 aa  79  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22320  hypothetical protein  51.67 
 
 		 73 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.479342  hitchhiker  7.49803e-16 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1555  membrane protein-like protein  64.29 
 
 		 92 aa  79  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.508864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02392  membrane protein-like protein  69.49 
 
 		 83 aa  77.8  0.00000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.505323  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1888  hypothetical protein  55.36 
 
 		 74 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2845  hypothetical protein  62.26 
 
 		 127 aa  77  0.00000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1242  membrane protein-like protein  53.57 
 
 		 73 aa  77  0.00000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.582249 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0720  membrane protein-like protein  55.93 
 
 		 76 aa  74.7  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.443615  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35050  hypothetical protein  53.57 
 
 		 74 aa  73.9  0.0000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.120265  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2063  phosphohistidine phosphatase SixA  47.46 
 
 		 62 aa  73.6  0.0000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.874636  normal  0.707991 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2571  hypothetical protein  55.36 
 
 		 73 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.106682  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3789  hypothetical protein  51.92 
 
 		 74 aa  63.5  0.0000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000180132 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3450  hypothetical protein  38.1 
 
 		 86 aa  52.8  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.205804  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4100  hypothetical protein  35.59 
 
 		 88 aa  52.8  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.66536 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4741  hypothetical protein  40 
 
 		 70 aa  48.1  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4856  hypothetical protein  39.62 
 
 		 116 aa  46.2  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.522078  normal  0.0705436 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2290  hypothetical protein  28.33 
 
 		 73 aa  44.7  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3607  hypothetical protein  34.69 
 
 		 90 aa  40.8  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0214237  hitchhiker  0.00163709 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>