41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3486 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_3486  membrane protein-like  100 
 
 
88 aa  181  3e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03638  hypothetical protein  74.51 
 
 
132 aa  88.6  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002425  membrane protein  72.55 
 
 
130 aa  87.8  4e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0749  membrane protein  68.33 
 
 
83 aa  87.8  5e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.90984  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4479  hypothetical protein  61.67 
 
 
68 aa  86.7  9e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000217224 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1156  membrane protein-like protein  56.45 
 
 
79 aa  84.3  5e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0130404  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4887  hypothetical protein  58.93 
 
 
64 aa  84  7e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2845  hypothetical protein  68.63 
 
 
127 aa  83.2  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4011  hypothetical protein  58.06 
 
 
67 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.127403  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2256  membrane protein-like protein  63.64 
 
 
86 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0186977  normal  0.1342 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0309  membrane protein-like protein  54.84 
 
 
70 aa  81.6  0.000000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4740  hypothetical protein  66.67 
 
 
67 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4124  hypothetical protein  62.26 
 
 
67 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.21413  normal  0.564732 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3116  hypothetical protein  51.43 
 
 
94 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3921  hypothetical protein  62.75 
 
 
67 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.393778  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4359  hypothetical protein  62.75 
 
 
67 aa  79.3  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.182654  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3919  hypothetical protein  64.71 
 
 
67 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.472062  normal  0.020645 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4501  hypothetical protein  62.75 
 
 
67 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.365447  normal  0.103968 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3636  hypothetical protein  61.54 
 
 
65 aa  78.6  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000809005  normal  0.198807 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4341  hypothetical protein  62.75 
 
 
67 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.561901  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4304  hypothetical protein  62.75 
 
 
67 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.402818  hitchhiker  0.0000000000823347 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3706  hypothetical protein  53.23 
 
 
66 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00936717  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4226  hypothetical protein  54.84 
 
 
65 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4031  membrane protein-like protein  50.72 
 
 
73 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.300951  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2063  phosphohistidine phosphatase SixA  60.78 
 
 
62 aa  77.8  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.874636  normal  0.707991 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1242  membrane protein-like protein  53.23 
 
 
73 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.582249 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1888  hypothetical protein  51.67 
 
 
74 aa  77.4  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22320  hypothetical protein  55.36 
 
 
73 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.479342  hitchhiker  7.49803e-16 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0490  hypothetical protein  64 
 
 
73 aa  75.1  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3815  hypothetical protein  53.57 
 
 
63 aa  74.3  0.0000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.595164  normal  0.0528702 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1555  membrane protein-like protein  52.73 
 
 
92 aa  72.4  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.508864  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02392  membrane protein-like protein  62.3 
 
 
83 aa  68.9  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.505323  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35050  hypothetical protein  49.09 
 
 
74 aa  67.8  0.00000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.120265  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0720  membrane protein-like protein  49.09 
 
 
76 aa  64.7  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.443615  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2571  hypothetical protein  45.45 
 
 
73 aa  61.2  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.106682  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3789  hypothetical protein  46.94 
 
 
74 aa  55.1  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000180132 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3450  hypothetical protein  36.07 
 
 
86 aa  52.4  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.205804  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4100  hypothetical protein  40.35 
 
 
88 aa  52  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.66536 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4741  hypothetical protein  40 
 
 
70 aa  48.5  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4856  hypothetical protein  43.86 
 
 
116 aa  48.5  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.522078  normal  0.0705436 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2290  hypothetical protein  27.54 
 
 
73 aa  45.4  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>