41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3815 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3815  hypothetical protein  100 
 
 		 63 aa  128  3e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.595164  normal  0.0528702 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4304  hypothetical protein  77.97 
 
 		 67 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.402818  hitchhiker  0.0000000000823347 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4887  hypothetical protein  79.66 
 
 		 64 aa  102  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4341  hypothetical protein  77.97 
 
 		 67 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.561901  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4501  hypothetical protein  77.97 
 
 		 67 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.365447  normal  0.103968 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4359  hypothetical protein  77.97 
 
 		 67 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.182654  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4479  hypothetical protein  75 
 
 		 68 aa  102  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000217224 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4740  hypothetical protein  75.81 
 
 		 67 aa  101  3e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3636  hypothetical protein  79.66 
 
 		 65 aa  101  3e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000809005  normal  0.198807 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4124  hypothetical protein  74.19 
 
 		 67 aa  101  4e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.21413  normal  0.564732 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3921  hypothetical protein  76.27 
 
 		 67 aa  101  4e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.393778  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4011  hypothetical protein  72.58 
 
 		 67 aa  100  6e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.127403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4226  hypothetical protein  74.6 
 
 		 65 aa  100  8e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3919  hypothetical protein  72.58 
 
 		 67 aa  99.8  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.472062  normal  0.020645 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0309  membrane protein-like protein  75.86 
 
 		 70 aa  97.4  6e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4031  membrane protein-like protein  73.33 
 
 		 73 aa  97.1  7e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.300951  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3706  hypothetical protein  69.23 
 
 		 66 aa  94.7  4e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00936717  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1156  membrane protein-like protein  58.93 
 
 		 79 aa  84.3  6e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0130404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3116  hypothetical protein  59.65 
 
 		 94 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0720  membrane protein-like protein  55.74 
 
 		 76 aa  81.3  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.443615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2256  membrane protein-like protein  57.89 
 
 		 86 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0186977  normal  0.1342 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2571  hypothetical protein  59.32 
 
 		 73 aa  80.9  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.106682  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22320  hypothetical protein  56.67 
 
 		 73 aa  77.4  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.479342  hitchhiker  7.49803e-16 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0749  membrane protein  54.39 
 
 		 83 aa  77  0.00000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.90984  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03638  hypothetical protein  59.26 
 
 		 132 aa  77  0.00000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002425  membrane protein  57.41 
 
 		 130 aa  75.9  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02392  membrane protein-like protein  69.49 
 
 		 83 aa  75.9  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.505323  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1888  hypothetical protein  57.14 
 
 		 74 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3486  membrane protein-like  53.57 
 
 		 88 aa  74.3  0.0000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2845  hypothetical protein  62 
 
 		 127 aa  74.3  0.0000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35050  hypothetical protein  50.82 
 
 		 74 aa  74.3  0.0000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.120265  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1242  membrane protein-like protein  50.85 
 
 		 73 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.582249 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1555  membrane protein-like protein  55.36 
 
 		 92 aa  73.6  0.0000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.508864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0490  hypothetical protein  59.62 
 
 		 73 aa  73.6  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2063  phosphohistidine phosphatase SixA  45.61 
 
 		 62 aa  71.6  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.874636  normal  0.707991 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3789  hypothetical protein  53.85 
 
 		 74 aa  69.7  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000180132 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4100  hypothetical protein  33.9 
 
 		 88 aa  52.8  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.66536 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3450  hypothetical protein  33.9 
 
 		 86 aa  50.8  0.000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.205804  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2290  hypothetical protein  31.67 
 
 		 73 aa  45.4  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4741  hypothetical protein  34 
 
 		 70 aa  44.7  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4856  hypothetical protein  33.96 
 
 		 116 aa  40.8  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.522078  normal  0.0705436 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>