41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A2845 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A2845  hypothetical protein  100 
 
 		 127 aa  260  3e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002425  membrane protein  70.87 
 
 		 130 aa  184  5e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03638  hypothetical protein  74.58 
 
 		 132 aa  181  3e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3486  membrane protein-like  68.63 
 
 		 88 aa  83.2  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0309  membrane protein-like protein  62.07 
 
 		 70 aa  82.4  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4031  membrane protein-like protein  61.02 
 
 		 73 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.300951  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3116  hypothetical protein  55.22 
 
 		 94 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0749  membrane protein  62.26 
 
 		 83 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.90984  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2063  phosphohistidine phosphatase SixA  60.71 
 
 		 62 aa  79  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.874636  normal  0.707991 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3636  hypothetical protein  61.82 
 
 		 65 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000809005  normal  0.198807 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4740  hypothetical protein  53.97 
 
 		 67 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1156  membrane protein-like protein  64 
 
 		 79 aa  77.4  0.00000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0130404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0490  hypothetical protein  64.71 
 
 		 73 aa  77.4  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4479  hypothetical protein  62.26 
 
 		 68 aa  77  0.00000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000217224 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4124  hypothetical protein  52.38 
 
 		 67 aa  77  0.00000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.21413  normal  0.564732 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4887  hypothetical protein  58.49 
 
 		 64 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4359  hypothetical protein  52.38 
 
 		 67 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.182654  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2256  membrane protein-like protein  64.15 
 
 		 86 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0186977  normal  0.1342 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4341  hypothetical protein  52.38 
 
 		 67 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.561901  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3706  hypothetical protein  59.62 
 
 		 66 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00936717  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4501  hypothetical protein  52.38 
 
 		 67 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.365447  normal  0.103968 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4304  hypothetical protein  52.38 
 
 		 67 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.402818  hitchhiker  0.0000000000823347 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3921  hypothetical protein  59.26 
 
 		 67 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.393778  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1242  membrane protein-like protein  50.77 
 
 		 73 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.582249 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4011  hypothetical protein  64 
 
 		 67 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.127403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3919  hypothetical protein  61.11 
 
 		 67 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.472062  normal  0.020645 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4226  hypothetical protein  60.78 
 
 		 65 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3815  hypothetical protein  62 
 
 		 63 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.595164  normal  0.0528702 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1888  hypothetical protein  50 
 
 		 74 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22320  hypothetical protein  50 
 
 		 73 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.479342  hitchhiker  7.49803e-16 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1555  membrane protein-like protein  53.7 
 
 		 92 aa  70.5  0.000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.508864  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35050  hypothetical protein  50 
 
 		 74 aa  69.3  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.120265  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02392  membrane protein-like protein  57.63 
 
 		 83 aa  66.6  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.505323  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3789  hypothetical protein  56.86 
 
 		 74 aa  61.2  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000180132 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3450  hypothetical protein  43.08 
 
 		 86 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.205804  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0720  membrane protein-like protein  45.28 
 
 		 76 aa  58.5  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.443615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2571  hypothetical protein  48.08 
 
 		 73 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.106682  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4100  hypothetical protein  47.46 
 
 		 88 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.66536 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4741  hypothetical protein  51.02 
 
 		 70 aa  53.1  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4856  hypothetical protein  45.28 
 
 		 116 aa  50.1  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.522078  normal  0.0705436 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2290  hypothetical protein  36.73 
 
 		 73 aa  47.8  0.00005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>