41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_4100 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_4100  hypothetical protein  100 
 
 		 88 aa  175  2e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.66536 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3450  hypothetical protein  91.36 
 
 		 86 aa  147  6e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.205804  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4741  hypothetical protein  96 
 
 		 70 aa  102  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4856  hypothetical protein  69.86 
 
 		 116 aa  88.2  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.522078  normal  0.0705436 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6018  hypothetical protein  67.86 
 
 		 98 aa  79.3  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4031  membrane protein-like protein  35.29 
 
 		 73 aa  60.1  0.000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.300951  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3116  hypothetical protein  41.94 
 
 		 94 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0309  membrane protein-like protein  41.38 
 
 		 70 aa  57.8  0.00000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3636  hypothetical protein  37.29 
 
 		 65 aa  56.2  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000809005  normal  0.198807 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2845  hypothetical protein  47.46 
 
 		 127 aa  56.6  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4501  hypothetical protein  34.38 
 
 		 67 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.365447  normal  0.103968 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4011  hypothetical protein  32.81 
 
 		 67 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.127403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3486  membrane protein-like  33.8 
 
 		 88 aa  54.7  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4304  hypothetical protein  34.38 
 
 		 67 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.402818  hitchhiker  0.0000000000823347 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4341  hypothetical protein  34.38 
 
 		 67 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.561901  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1156  membrane protein-like protein  39.29 
 
 		 79 aa  54.7  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0130404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4479  hypothetical protein  35.48 
 
 		 68 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000217224 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4359  hypothetical protein  35.59 
 
 		 67 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.182654  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1242  membrane protein-like protein  35.48 
 
 		 73 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.582249 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2571  hypothetical protein  36.23 
 
 		 73 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.106682  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4887  hypothetical protein  33.9 
 
 		 64 aa  53.9  0.0000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2063  phosphohistidine phosphatase SixA  40.35 
 
 		 62 aa  53.5  0.0000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.874636  normal  0.707991 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3921  hypothetical protein  35.59 
 
 		 67 aa  53.5  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.393778  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03638  hypothetical protein  36.99 
 
 		 132 aa  53.5  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3789  hypothetical protein  40.35 
 
 		 74 aa  53.1  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000180132 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4124  hypothetical protein  33.9 
 
 		 67 aa  52.8  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.21413  normal  0.564732 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3706  hypothetical protein  32.79 
 
 		 66 aa  53.5  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00936717  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3919  hypothetical protein  33.9 
 
 		 67 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.472062  normal  0.020645 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002425  membrane protein  36.07 
 
 		 130 aa  52.8  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4740  hypothetical protein  33.9 
 
 		 67 aa  52.8  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3815  hypothetical protein  33.9 
 
 		 63 aa  52.4  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.595164  normal  0.0528702 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2256  membrane protein-like protein  35.09 
 
 		 86 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0186977  normal  0.1342 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0490  hypothetical protein  44.23 
 
 		 73 aa  52  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35050  hypothetical protein  34.78 
 
 		 74 aa  51.6  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.120265  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0720  membrane protein-like protein  41.94 
 
 		 76 aa  51.2  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.443615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22320  hypothetical protein  37.31 
 
 		 73 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.479342  hitchhiker  7.49803e-16 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0749  membrane protein  40.35 
 
 		 83 aa  50.8  0.000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.90984  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1888  hypothetical protein  35.21 
 
 		 74 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02392  membrane protein-like protein  38.33 
 
 		 83 aa  50.4  0.000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.505323  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4226  hypothetical protein  32.76 
 
 		 65 aa  49.7  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1555  membrane protein-like protein  38.81 
 
 		 92 aa  50.1  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.508864  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>