32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2290 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_2290  hypothetical protein  100 
 
 
73 aa  151  2.9999999999999998e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0490  hypothetical protein  44.23 
 
 
73 aa  50.1  0.000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2063  phosphohistidine phosphatase SixA  44.9 
 
 
62 aa  49.7  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.874636  normal  0.707991 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0309  membrane protein-like protein  35.85 
 
 
70 aa  48.1  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4304  hypothetical protein  33.33 
 
 
67 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.402818  hitchhiker  0.0000000000823347 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4501  hypothetical protein  33.33 
 
 
67 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.365447  normal  0.103968 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4359  hypothetical protein  33.33 
 
 
67 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.182654  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2845  hypothetical protein  36.73 
 
 
127 aa  47.8  0.00005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4341  hypothetical protein  33.33 
 
 
67 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.561901  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4740  hypothetical protein  32.79 
 
 
67 aa  47.8  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3921  hypothetical protein  35 
 
 
67 aa  47.4  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.393778  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4887  hypothetical protein  34.43 
 
 
64 aa  47.4  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3919  hypothetical protein  31.15 
 
 
67 aa  46.2  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.472062  normal  0.020645 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03638  hypothetical protein  29.69 
 
 
132 aa  46.6  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4031  membrane protein-like protein  32.08 
 
 
73 aa  46.6  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.300951  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3486  membrane protein-like  27.54 
 
 
88 aa  45.4  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002425  membrane protein  30.91 
 
 
130 aa  46.2  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0749  membrane protein  37.5 
 
 
83 aa  45.8  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.90984  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3815  hypothetical protein  31.67 
 
 
63 aa  45.4  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.595164  normal  0.0528702 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4124  hypothetical protein  31.15 
 
 
67 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.21413  normal  0.564732 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4479  hypothetical protein  28.33 
 
 
68 aa  44.7  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000217224 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2256  membrane protein-like protein  38 
 
 
86 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0186977  normal  0.1342 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3116  hypothetical protein  36.36 
 
 
94 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22320  hypothetical protein  30.77 
 
 
73 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.479342  hitchhiker  7.49803e-16 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4011  hypothetical protein  30.77 
 
 
67 aa  43.9  0.0008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.127403  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4226  hypothetical protein  32.2 
 
 
65 aa  43.5  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3706  hypothetical protein  32.08 
 
 
66 aa  43.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00936717  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1156  membrane protein-like protein  31.91 
 
 
79 aa  42.4  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0130404  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3636  hypothetical protein  29.51 
 
 
65 aa  42  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000809005  normal  0.198807 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1888  hypothetical protein  29.69 
 
 
74 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3789  hypothetical protein  33.93 
 
 
74 aa  40.8  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000180132 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35050  hypothetical protein  28.77 
 
 
74 aa  40.4  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.120265  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>