26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3607 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3607  hypothetical protein  100 
 
 
90 aa  180  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0214237  hitchhiker  0.00163709 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0155  hypothetical protein  54.69 
 
 
76 aa  79.3  0.00000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000493853  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3254  hypothetical protein  57.14 
 
 
93 aa  76.6  0.00000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.569308  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06000  hypothetical protein  39.19 
 
 
91 aa  64.3  0.0000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4567  hypothetical protein  39.06 
 
 
76 aa  58.5  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_41356  predicted protein  37.8 
 
 
107 aa  53.5  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43360  predicted protein  34.94 
 
 
248 aa  52.4  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1771  hypothetical protein  47.54 
 
 
93 aa  51.2  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.55323e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2104  hypothetical protein  42.37 
 
 
68 aa  45.4  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0170736  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0974  hypothetical protein  40 
 
 
69 aa  44.3  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.127017 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0309  membrane protein-like protein  35.19 
 
 
70 aa  43.5  0.0009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4031  membrane protein-like protein  32.14 
 
 
73 aa  42.4  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.300951  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2183  hypothetical protein  34.38 
 
 
68 aa  41.6  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.167922  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3921  hypothetical protein  35.19 
 
 
67 aa  41.6  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.393778  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4226  hypothetical protein  34.69 
 
 
65 aa  41.2  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3636  hypothetical protein  36.73 
 
 
65 aa  41.2  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000809005  normal  0.198807 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1555  membrane protein-like protein  36.07 
 
 
92 aa  40.8  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.508864  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4479  hypothetical protein  34.69 
 
 
68 aa  40.8  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000217224 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4124  hypothetical protein  35.29 
 
 
67 aa  40.8  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.21413  normal  0.564732 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4501  hypothetical protein  33.33 
 
 
67 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.365447  normal  0.103968 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3706  hypothetical protein  41.18 
 
 
66 aa  40.4  0.008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00936717  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4011  hypothetical protein  35.29 
 
 
67 aa  40.4  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.127403  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4304  hypothetical protein  33.33 
 
 
67 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.402818  hitchhiker  0.0000000000823347 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4341  hypothetical protein  33.33 
 
 
67 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.561901  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4359  hypothetical protein  33.33 
 
 
67 aa  40  0.009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.182654  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4740  hypothetical protein  33.33 
 
 
67 aa  40.4  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>