12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1771 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1771  hypothetical protein  100 
 
 		 93 aa  190  5e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.55323e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4567  hypothetical protein  52.31 
 
 		 76 aa  77.8  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0155  hypothetical protein  46.77 
 
 		 76 aa  57  0.00000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000493853  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0974  hypothetical protein  43.66 
 
 		 69 aa  56.6  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.127017 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06000  hypothetical protein  40.91 
 
 		 91 aa  55.5  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2104  hypothetical protein  43.28 
 
 		 68 aa  52.4  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0170736  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3607  hypothetical protein  47.54 
 
 		 90 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0214237  hitchhiker  0.00163709 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2325  hypothetical protein  37.5 
 
 		 90 aa  48.1  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_41356  predicted protein  44.26 
 
 		 107 aa  46.6  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3254  hypothetical protein  38.98 
 
 		 93 aa  44.7  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.569308  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43360  predicted protein  32.81 
 
 		 248 aa  41.6  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1555  membrane protein-like protein  35.85 
 
 		 92 aa  40.8  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.508864  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>