36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3715 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3715  hypothetical protein  100 
 
 		 125 aa  254  3e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3102  hypothetical protein  66.13 
 
 		 125 aa  178  2e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.593174 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3356  hypothetical protein  62.9 
 
 		 126 aa  171  1.9999999999999998e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.630899  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3250  hypothetical protein  57.38 
 
 		 132 aa  155  1e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0873  hypothetical protein  57.38 
 
 		 132 aa  155  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3149  hypothetical protein  57.38 
 
 		 132 aa  155  2e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3331  hypothetical protein  57.94 
 
 		 127 aa  154  3e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1008  hypothetical protein  57.94 
 
 		 127 aa  154  3e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1029  hypothetical protein  57.94 
 
 		 127 aa  154  4e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.674916 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1041  hypothetical protein  57.94 
 
 		 127 aa  154  4e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.756046 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2981  hypothetical protein  57.38 
 
 		 127 aa  154  4e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2854  hypothetical protein  55.37 
 
 		 127 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.148058  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3682  hypothetical protein  53.28 
 
 		 132 aa  144  5e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1548  hypothetical protein  51.24 
 
 		 126 aa  130  5e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.466583  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1336  hypothetical protein  47.58 
 
 		 130 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0576  hypothetical protein  45.6 
 
 		 126 aa  122  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0256  hypothetical protein  29.84 
 
 		 127 aa  78.2  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3480  UspA domain protein  31.03 
 
 		 119 aa  59.3  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1781  UspA domain-containing protein  33.65 
 
 		 285 aa  58.9  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1240  hypothetical protein  25.66 
 
 		 125 aa  54.3  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.370362  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2602  hypothetical protein  31.19 
 
 		 127 aa  52.8  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0738008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0232  hypothetical protein  27.36 
 
 		 114 aa  52.4  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.190765  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2220  hypothetical protein  30.56 
 
 		 124 aa  50.8  0.000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00202987  normal  0.0726864 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5736  hypothetical protein  29.73 
 
 		 130 aa  48.5  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.853657  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0045  hypothetical protein  28.04 
 
 		 124 aa  48.5  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000429273 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2063  hypothetical protein  29.36 
 
 		 121 aa  48.1  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3627  hypothetical protein  30.21 
 
 		 103 aa  47  0.00008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3965  hypothetical protein  30.21 
 
 		 103 aa  47  0.00008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0238816  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3056  hypothetical protein  25.37 
 
 		 113 aa  46.2  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.3077  normal  0.011343 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1957  hypothetical protein  31.25 
 
 		 122 aa  45.1  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0991042  normal  0.534316 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2511  hypothetical protein  28.7 
 
 		 120 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1811  hypothetical protein  27.83 
 
 		 120 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.937461 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1767  hypothetical protein  26.96 
 
 		 120 aa  44.3  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.144768  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1774  hypothetical protein  27.83 
 
 		 120 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0884  hypothetical protein  26.89 
 
 		 122 aa  43.5  0.0008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.927889 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1109  hypothetical protein  28.81 
 
 		 122 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.705839 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>