17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8791 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2444  hypothetical protein  70.48 
 
 
620 aa  905    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.132408 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8791  hypothetical protein  100 
 
 
621 aa  1256    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0496  TrkA-N domain protein  53.54 
 
 
623 aa  652    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0072  hypothetical protein  47.78 
 
 
629 aa  602  1.0000000000000001e-171  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.504192 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1461  TrkA domain-containing protein  43.86 
 
 
653 aa  450  1e-125  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7893  hypothetical protein  42.16 
 
 
634 aa  425  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26360  K+ transport system, NAD-binding component  32.37 
 
 
497 aa  257  5e-67  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.427591  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_94483  predicted protein  25.22 
 
 
571 aa  173  9e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.13386 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3469  hypothetical protein  26.38 
 
 
652 aa  168  2.9999999999999998e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0073  hypothetical protein  21.47 
 
 
586 aa  100  7e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0989  Ion transport 2 domain-containing protein  24.72 
 
 
344 aa  58.2  0.0000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.369667 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5275  Ion transport 2 domain protein  25.44 
 
 
344 aa  52  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300116  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01339  Kef-type K+ transport system, predicted NAD-binding component  21.45 
 
 
351 aa  49.3  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1223  Ion transport 2  22.4 
 
 
349 aa  47.8  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01615  hypothetical protein  21.32 
 
 
347 aa  44.7  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5547  Ion transport 2 domain protein  24.89 
 
 
351 aa  44.3  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.723458 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2854  TrkA-N domain protein  19.58 
 
 
331 aa  44.3  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>