More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7137 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7137  small GTP-binding protein  100 
 
 		 657 aa  1302    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.43752 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8220  small GTP-binding protein  56.69 
 
 		 647 aa  659    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3033  GTP-binding elongation factor protein, TetM/TetO family  44.21 
 
 		 647 aa  568  1e-160  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3072  GTP-binding elongation factor protein, TetM/TetO family  44.58 
 
 		 647 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2763  tetracycline resistance protein  43.75 
 
 		 647 aa  561  1e-158  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2069  small GTP-binding protein  51.14 
 
 		 656 aa  561  1e-158  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.532976  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3077  tetracycline resistance protein  44.26 
 
 		 647 aa  556  1e-157  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.306394  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2828  tetracycline resistance protein  43.9 
 
 		 647 aa  557  1e-157  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2204  GTP-binding elongation factor protein, TetM/TetO family  43.66 
 
 		 647 aa  556  1e-157  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.335897  hitchhiker  0.000000000000106418 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1755  small GTP-binding protein  49.56 
 
 		 662 aa  555  1e-157  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.20982  normal  0.732753 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3042  tetracycline resistance protein  43.9 
 
 		 647 aa  557  1e-157  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2800  tetracycline resistance protein  44.12 
 
 		 647 aa  555  1e-156  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2829  small GTP-binding protein  42.97 
 
 		 647 aa  549  1e-155  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.328333  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3046  GTP-binding elongation factor protein, TetM/TetO family  42.6 
 
 		 647 aa  548  1e-154  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.845886  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2757  small GTP-binding protein  46.49 
 
 		 651 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.532594 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8889  small GTP-binding protein  47.99 
 
 		 632 aa  490  1e-137  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2501  small GTP-binding protein  46.76 
 
 		 652 aa  486  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.381746  normal  0.750444 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3805  small GTP-binding protein  43.45 
 
 		 661 aa  421  1e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0048  tetO  35.59 
 
 		 639 aa  363  4e-99  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.333118  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0923  tetracycline resistance protein  33.33 
 
 		 639 aa  353  5.9999999999999994e-96  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0189  translation elongation factor G  29.79 
 
 		 691 aa  244  3.9999999999999997e-63  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3998  translation elongation factor G  28.09 
 
 		 691 aa  235  2.0000000000000002e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0770762  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1053  small GTP-binding protein  29.61 
 
 		 880 aa  234  4.0000000000000004e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.902008  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0712  translation elongation factor G  28.57 
 
 		 697 aa  232  2e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1424  translation elongation factor G  27.5 
 
 		 700 aa  231  3e-59  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.477133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2220  small GTP-binding protein  29.06 
 
 		 882 aa  231  4e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1141  elongation factor G  28.98 
 
 		 691 aa  230  8e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000161111  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0033  small GTP-binding protein  28.08 
 
 		 888 aa  228  3e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.991842  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0222  translation elongation factor G  29.26 
 
 		 689 aa  228  3e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0488172  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2063  elongation factor G  31 
 
 		 680 aa  227  5.0000000000000005e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0459  translation elongation factor G  28.57 
 
 		 690 aa  227  5.0000000000000005e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000614779  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2336  translation elongation and release factor (GTPase)  29.29 
 
 		 694 aa  227  6e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0109511  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1823  small GTP-binding protein  27.55 
 
 		 885 aa  226  8e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.624036  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1288  elongation factor G  28.46 
 
 		 692 aa  226  9e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000556702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0030  translation elongation factor (GTPase)  27.44 
 
 		 640 aa  226  9e-58  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1223  elongation factor G  28.8 
 
 		 697 aa  226  1e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000218328  hitchhiker  0.000228753 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0661  translation elongation factor G  28.36 
 
 		 692 aa  226  1e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0156588  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1486  elongation factor G  29.15 
 
 		 695 aa  223  7e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000303107  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1562  elongation factor G  28.38 
 
 		 691 aa  223  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00909597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0189  elongation factor G  27.79 
 
 		 692 aa  222  9.999999999999999e-57  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000566595  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0839  translation elongation factor G  28.87 
 
 		 706 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1537  elongation factor G  28.38 
 
 		 691 aa  223  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1182  translation elongation factor G  28.48 
 
 		 699 aa  221  1.9999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.566824  normal  0.0924393 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4324  translation elongation factor G  29.05 
 
 		 703 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2021  elongation factor G  27.79 
 
 		 691 aa  221  1.9999999999999999e-56  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0579  elongation factor G  29.7 
 
 		 698 aa  222  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.179959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1905  elongation factor G  28.07 
 
 		 691 aa  221  3e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.224995  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1314  elongation factor G  27.79 
 
 		 702 aa  221  3e-56  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00915512  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0453  elongation factor G  28.04 
 
 		 691 aa  221  3.9999999999999997e-56  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0472  elongation factor G  28.36 
 
 		 693 aa  219  1e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00749701  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1940  elongation factor G  28.62 
 
 		 707 aa  219  1e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0864  elongation factor G  28.08 
 
 		 689 aa  219  1e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000306199  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1442  elongation factor G  28.18 
 
 		 691 aa  219  1e-55  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_415  translation elongation factor G  28.97 
 
 		 693 aa  219  1e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000373207  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1233  putative tetracycline resistance protein  27.07 
 
 		 646 aa  219  1e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.139219  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0449  elongation factor G  28.82 
 
 		 693 aa  219  1e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000513034  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0212  elongation factor G  28.08 
 
 		 692 aa  219  1e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00232583  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0542  elongation factor G  28.18 
 
 		 691 aa  219  2e-55  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1361  elongation factor G  31.86 
 
 		 682 aa  219  2e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1075  elongation factor G  28.23 
 
 		 691 aa  219  2e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0402  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  29.44 
 
 		 696 aa  218  2e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000137892  normal  0.103929 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0513  elongation factor G  28.18 
 
 		 691 aa  219  2e-55  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0730313  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0262  elongation factor G  26.38 
 
 		 692 aa  219  2e-55  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000815728  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0311  elongation factor G  27.26 
 
 		 700 aa  219  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000859438  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6052  elongation factor G  28.99 
 
 		 698 aa  218  2.9999999999999998e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.274772 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19501  elongation factor G  28.23 
 
 		 691 aa  218  2.9999999999999998e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17001  elongation factor G  27.03 
 
 		 691 aa  218  2.9999999999999998e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1311  elongation factor G  28.64 
 
 		 691 aa  218  2.9999999999999998e-55  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000260019  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0793  translation elongation factor G  27.82 
 
 		 695 aa  218  4e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.339933  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3647  elongation factor G  27.11 
 
 		 700 aa  217  4e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000646434  hitchhiker  0.000000000415866 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0475  elongation factor G  27.69 
 
 		 691 aa  218  4e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1042  translation elongation factor G, putative  26.42 
 
 		 646 aa  217  5e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000207187  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3341  elongation factor G  28 
 
 		 699 aa  217  5.9999999999999996e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.0000527224  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0276  elongation factor G  28.21 
 
 		 697 aa  217  7e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000125345  unclonable  0.000000175981 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0357  translation elongation factor G  27.18 
 
 		 692 aa  216  9e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000142734  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4318  elongation factor G  29.84 
 
 		 698 aa  216  9.999999999999999e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00640423 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1337  translation elongation factor G  28.41 
 
 		 700 aa  216  9.999999999999999e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2068  translation elongation factor G  28.96 
 
 		 689 aa  216  9.999999999999999e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000450896  normal  0.835571 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2860  elongation factor G  27.82 
 
 		 692 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0281835  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1833  translation elongation factor G  26.87 
 
 		 693 aa  215  1.9999999999999998e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000103063  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3183  elongation factor G  27.43 
 
 		 702 aa  215  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0250795  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1601  elongation factor G  27.19 
 
 		 691 aa  215  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2714  translation elongation factor G  27.25 
 
 		 691 aa  215  1.9999999999999998e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00080335  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1214  translation elongation and release factor (GTPase)  27.38 
 
 		 673 aa  215  1.9999999999999998e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000546094  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10040  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  28.93 
 
 		 700 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0000170843  decreased coverage  0.0000000000839395 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5121  translation elongation factor G  28.11 
 
 		 704 aa  215  2.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.63953 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3446  elongation factor G  28.05 
 
 		 700 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.607272  normal  0.483871 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0356  elongation factor G  27.77 
 
 		 691 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0303  elongation factor G  29.39 
 
 		 700 aa  214  3.9999999999999995e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383958 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2843  elongation factor G  26.67 
 
 		 700 aa  214  4.9999999999999996e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.52933  normal  0.221266 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17121  elongation factor G  26.88 
 
 		 691 aa  214  5.999999999999999e-54  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.668762  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4484  elongation factor G  27.71 
 
 		 700 aa  213  5.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.707132  normal  0.129741 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4618  elongation factor G  27.71 
 
 		 700 aa  213  5.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.566824  normal  0.722275 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2729  elongation factor G  27.29 
 
 		 697 aa  213  7e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.255792  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1857  elongation factor G  28.16 
 
 		 699 aa  213  7e-54  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00459949  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2185  elongation factor G  26.4 
 
 		 708 aa  213  7e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00027976  normal  0.0114318 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1895  elongation factor G  26.4 
 
 		 708 aa  213  9e-54  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365208  normal  0.667418 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0334  elongation factor G  28.16 
 
 		 699 aa  213  9e-54  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  0.0000000000000603691  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0923  elongation factor G  29.11 
 
 		 705 aa  212  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.345609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2463  elongation factor G  28.55 
 
 		 692 aa  213  1e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.691904  normal  0.0191825 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>