151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6004 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6004  4-hydroxyproline epimerase  100 
 
 		 333 aa  675    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.122381  normal  0.0460941 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5915  proline racemase  78.08 
 
 		 333 aa  541  1e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.314959  normal  0.070905 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3503  Proline racemase  76.28 
 
 		 333 aa  523  1e-147  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4722  proline racemase  76.13 
 
 		 333 aa  511  1e-144  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4111  Proline racemase  71.17 
 
 		 333 aa  501  1e-141  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.650339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31580  proline racemase  74.47 
 
 		 333 aa  498  1e-140  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2259  proline racemase  54.03 
 
 		 337 aa  351  1e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0755409  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2559  proline racemase  48.2 
 
 		 345 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.659192  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2840  putative proline racemase  48.5 
 
 		 345 aa  326  3e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000647776 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2643  proline racemase  48.5 
 
 		 345 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2834  proline racemase  48.5 
 
 		 345 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0589292  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2594  proline racemase  48.2 
 
 		 345 aa  324  2e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2637  proline racemase  47.6 
 
 		 345 aa  323  3e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.204601  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2885  putative proline racemase  47.6 
 
 		 345 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2846  putative proline racemase  47.31 
 
 		 345 aa  319  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0203289  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2447  putative proline racemase  47.77 
 
 		 345 aa  319  5e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2065  hydroxyproline-2-epimerase  48.64 
 
 		 333 aa  300  2e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.012514  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1419  hydroxyproline-2-epimerase  48.64 
 
 		 332 aa  296  3e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0468879  normal  0.0760602 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2863  proline racemase, putative  48.5 
 
 		 312 aa  294  1e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0431348  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3863  hydroxyproline-2-epimerase  46.04 
 
 		 333 aa  283  3.0000000000000004e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.365358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4273  hydroxyproline-2-epimerase  45.45 
 
 		 333 aa  279  6e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1792  hydroxyproline-2-epimerase  46.2 
 
 		 333 aa  278  1e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1726  hydroxyproline-2-epimerase  46.2 
 
 		 333 aa  278  1e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.716077  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1478  4-hydroxyproline epimerase  45.57 
 
 		 334 aa  278  1e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.857006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0498  proline racemase  46.22 
 
 		 333 aa  276  5e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.745438  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5572  hydroxyproline-2-epimerase  43.33 
 
 		 333 aa  275  6e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000335762  normal  0.0993584 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1111  hydroxyproline-2-epimerase  45.95 
 
 		 337 aa  275  6e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.920734  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0642  proline racemase  45.57 
 
 		 351 aa  273  4.0000000000000004e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180837 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4859  hydroxyproline-2-epimerase  45.65 
 
 		 334 aa  272  6e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1045  proline racemase  41.37 
 
 		 340 aa  262  6e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0234  proline racemase  43.31 
 
 		 350 aa  262  6e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5265  hydroxyproline-2-epimerase  42.55 
 
 		 338 aa  258  9e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.994352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3228  hydroxyproline-2-epimerase  43.03 
 
 		 338 aa  258  1e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.771447 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3463  hydroxyproline-2-epimerase  46.1 
 
 		 308 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0291 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0298  hydroxyproline-2-epimerase  42.55 
 
 		 332 aa  253  3e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.123258 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5285  hydroxyproline-2-epimerase  42.3 
 
 		 332 aa  251  9.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.103378  normal  0.295156 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1690  proline racemase  41.49 
 
 		 335 aa  249  3e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.420526  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3467  hydroxyproline-2-epimerase  44.07 
 
 		 333 aa  248  8e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0800  proline racemase  41.19 
 
 		 334 aa  248  1e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1082  putative proline racemase  40.72 
 
 		 334 aa  246  3e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2363  hydroxyproline-2-epimerase  40.12 
 
 		 333 aa  246  3e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00996894  normal  0.484255 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0989  putative proline racemase  40.12 
 
 		 331 aa  246  4e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.0492400000000001e-61 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1761  hydroxyproline-2-epimerase  39.82 
 
 		 333 aa  246  4e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000415144  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4841  hydroxyproline-2-epimerase  41.39 
 
 		 332 aa  245  8e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.122801 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0994  proline racemase, putative  41.19 
 
 		 334 aa  245  9e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4388  putative proline racemase  40.12 
 
 		 334 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.208598  hitchhiker  1.6490700000000002e-24 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0802  proline racemase  39.82 
 
 		 331 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1703  hydroxyproline-2-epimerase  39.51 
 
 		 333 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.129643  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0799  proline racemase  40.12 
 
 		 334 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1530  hydroxyproline-2-epimerase  40.43 
 
 		 333 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2823  hydroxyproline-2-epimerase  39.21 
 
 		 333 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.252045  normal  0.582579 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0853  proline racemase  39.82 
 
 		 331 aa  241  1e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0901  proline racemase  39.82 
 
 		 331 aa  241  1e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.699009  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2361  proline racemase  38.91 
 
 		 346 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000418015  normal  0.500055 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7251  hydroxyproline-2-epimerase  42.17 
 
 		 332 aa  239  5e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367243  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0943  putative proline racemase  39.52 
 
 		 334 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0120446  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0460  Proline racemase  40.12 
 
 		 336 aa  238  8e-62  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003673  4-hydroxyproline epimerase  42.81 
 
 		 301 aa  238  1e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.778363  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1763  proline racemase  37.39 
 
 		 346 aa  238  1e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000615926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1529  proline racemase  38.39 
 
 		 346 aa  237  2e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0477377  normal  0.266865 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2641  proline racemase  39.7 
 
 		 342 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.104062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1705  proline racemase  37.27 
 
 		 346 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.360365  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5268  proline racemase  40.84 
 
 		 348 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2821  proline racemase  35.44 
 
 		 346 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000426991  normal  0.606385 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4845  proline racemase  38.14 
 
 		 344 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67276  hitchhiker  0.00976207 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0439  proline racemase  38.51 
 
 		 343 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.116124  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2251  proline racemase  39.39 
 
 		 335 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3225  proline racemase  40.24 
 
 		 348 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.821364 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1532  putative proline racemase  37.43 
 
 		 346 aa  231  1e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000263181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2117  proline racemase  37.17 
 
 		 348 aa  231  2e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.231531 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47970  hypothetical protein  38.1 
 
 		 344 aa  230  3e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.301488  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0337  proline racemase, putative  38.39 
 
 		 342 aa  229  6e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4137  hypothetical protein  38.1 
 
 		 344 aa  229  6e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.583896  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3861  proline racemase  38.99 
 
 		 342 aa  228  8e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.438551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0353  putative proline racemase  38.1 
 
 		 342 aa  228  9e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.928096  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1450  hydroxyproline-2-epimerase  42.43 
 
 		 305 aa  227  2e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.273254  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1184  proline racemase  39.94 
 
 		 342 aa  225  7e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3201  proline racemase  37.5 
 
 		 341 aa  225  8e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0659896  normal  0.833754 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5694  proline racemase  38.28 
 
 		 335 aa  222  9e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.348726 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3344  proline racemase  38.28 
 
 		 335 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0227164 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0107  proline racemase  40.18 
 
 		 345 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0118  Proline racemase  39.58 
 
 		 345 aa  220  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4243  proline racemase  37.69 
 
 		 335 aa  219  7e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000241278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1660  proline racemase  37.39 
 
 		 335 aa  219  7e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000137069  normal  0.0715412 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5994  proline racemase  37.69 
 
 		 335 aa  219  7e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.745893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4007  proline racemase  37.69 
 
 		 335 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4360  proline racemase  37.69 
 
 		 335 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.242399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1587  proline racemase  38.74 
 
 		 338 aa  217  2e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0972711  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1024  putative proline racemase  37.69 
 
 		 335 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0744753 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3837  proline racemase  39.04 
 
 		 323 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7022  hypothetical protein  35.71 
 
 		 342 aa  216  4e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.283298  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3769  proline racemase  37.39 
 
 		 335 aa  216  5e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00125754  normal  0.197113 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1453  putative proline racemase  35.67 
 
 		 355 aa  212  9e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.67245  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0518  hypothetical protein  38.39 
 
 		 347 aa  210  2e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3966  proline racemase  38.62 
 
 		 323 aa  210  3e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4260  proline racemase  36.23 
 
 		 335 aa  210  3e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3164  proline racemase  37.09 
 
 		 337 aa  203  3e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.371842  normal  0.051576 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3519  putative proline racemase  36.8 
 
 		 337 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.235332  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3975  proline racemase  37.24 
 
 		 322 aa  193  3e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.834957  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5997  Proline racemase  38.15 
 
 		 336 aa  193  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.720935  normal  0.0614805 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>