16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5000 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5000  hypothetical protein  100 
 
 		 406 aa  808    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728211  normal  0.505446 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1185  hypothetical protein  70.56 
 
 		 410 aa  561  1.0000000000000001e-159  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1078  hypothetical protein  72.04 
 
 		 425 aa  557  1e-157  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000321073 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2011  hypothetical protein  66.92 
 
 		 405 aa  538  9.999999999999999e-153  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0491359 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2257  hypothetical protein  48.77 
 
 		 447 aa  376  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0508551 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4607  hypothetical protein  44.15 
 
 		 415 aa  338  9.999999999999999e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0195  hypothetical protein  39.45 
 
 		 429 aa  293  4e-78  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14820  hypothetical protein  42.41 
 
 		 443 aa  290  3e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00902064 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10930  hypothetical protein  43.47 
 
 		 419 aa  287  2.9999999999999996e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.129027  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1899  beta-galactosidase  26.18 
 
 		 404 aa  87  6e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1790  glycoside hydrolase family protein  22.63 
 
 		 627 aa  74.7  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0936  hypothetical protein  22.42 
 
 		 600 aa  53.5  0.000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1672  glycoside hydrolase family 42 protein  24.45 
 
 		 640 aa  51.2  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.590042  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4131  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  25.07 
 
 		 635 aa  47.4  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0331155  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0035  hypothetical protein  30.39 
 
 		 421 aa  43.5  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0771  hypothetical protein  29 
 
 		 422 aa  43.1  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.486324 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>