17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0769 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0769  transposase Tn3 family protein  100 
 
 		 94 aa  188  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4775  transposase Tn3 family protein  54.84 
 
 		 838 aa  102  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.855357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4667  transposase  52.69 
 
 		 123 aa  94.7  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0861324 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2347  transposase Tn3  54.02 
 
 		 916 aa  86.3  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.669911  normal  0.26387 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19600  transposase, TnpA family  56.32 
 
 		 1028 aa  83.6  9e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.546457  normal  0.0923144 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1704  transposase Tn3  48.91 
 
 		 1006 aa  79  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.019193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2941  transposase Tn3 family protein  46.15 
 
 		 991 aa  77  0.00000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.360292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2705  transposase Tn3 family protein  46.15 
 
 		 991 aa  77  0.00000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.347757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4723  transposase, Tn3 family  50 
 
 		 1075 aa  70.9  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4930  transposase Tn3 family protein  42.53 
 
 		 492 aa  67.8  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.142055  normal  0.882247 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0111  transposase  41.11 
 
 		 997 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0088  transposase  39.08 
 
 		 771 aa  60.5  0.000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.560561 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5398  transposase Tn3 family protein  37.78 
 
 		 1029 aa  58.9  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0815937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5458  hypothetical protein  40 
 
 		 992 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5425  transposase Tn3 family protein  40 
 
 		 992 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5075  transposase Tn3 family protein  34.18 
 
 		 972 aa  42  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6366  transposase  37.89 
 
 		 260 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.714765  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>