150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_1668 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_2619  hypothetical protein  69.15 
 
 		 470 aa  640    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1728  protein of unknown function DUF482  69.36 
 
 		 470 aa  643    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0347307  normal  0.0114903 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1668  hypothetical protein  100 
 
 		 427 aa  897    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2657  hypothetical protein  68.94 
 
 		 470 aa  639    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00609498  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2732  hypothetical protein  68.94 
 
 		 470 aa  634    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.96402  normal  0.438738 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2296  hypothetical protein  61.18 
 
 		 421 aa  548  1e-155  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.124232  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1953  hypothetical protein  62.56 
 
 		 432 aa  547  1e-154  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2486  hypothetical protein  61.65 
 
 		 421 aa  545  1e-154  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.954327  normal  0.812724 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2368  hypothetical protein  64.68 
 
 		 398 aa  536  1e-151  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0181768  normal  0.305905 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1656  hypothetical protein  46.58 
 
 		 433 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.135069  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2157  hypothetical protein  47.19 
 
 		 455 aa  396  1e-109  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.391826  normal  0.900175 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1865  hypothetical protein  47.86 
 
 		 406 aa  394  1e-108  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.164344  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2329  hypothetical protein  46.28 
 
 		 392 aa  380  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.653635  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1930  hypothetical protein  45.7 
 
 		 405 aa  379  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0856188 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3841  hypothetical protein  42.29 
 
 		 416 aa  325  1e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.614644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02848  hypothetical protein  39.24 
 
 		 445 aa  311  1e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.29586  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2871  hypothetical protein  41.78 
 
 		 388 aa  306  6e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0063  hypothetical protein  40.33 
 
 		 386 aa  301  1e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.405281  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0679  hypothetical protein  39.38 
 
 		 374 aa  294  2e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.323848  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2458  hypothetical protein  38.97 
 
 		 423 aa  292  7e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3017  hypothetical protein  37.56 
 
 		 384 aa  291  2e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2348  hypothetical protein  40.29 
 
 		 408 aa  286  4e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.291454  normal  0.220022 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1114  protein of unknown function DUF482  39.52 
 
 		 392 aa  286  4e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.333144 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2786  hypothetical protein  40.24 
 
 		 381 aa  281  2e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2007  protein of unknown function DUF482  37.05 
 
 		 392 aa  279  7e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.199374  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2534  hypothetical protein  38.52 
 
 		 384 aa  277  2e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22410  hypothetical protein  38.55 
 
 		 374 aa  278  2e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000252116 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2563  protein of unknown function DUF482  38.53 
 
 		 410 aa  276  5e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.871216  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19080  hypothetical protein  38.46 
 
 		 374 aa  276  6e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0877  hypothetical protein  36.82 
 
 		 392 aa  275  8e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4543  hypothetical protein  38.41 
 
 		 403 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3837  hypothetical protein  39.47 
 
 		 375 aa  273  3e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.29195  normal  0.855927 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1249  hypothetical protein  39.23 
 
 		 374 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.25813 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4050  hypothetical protein  37.44 
 
 		 375 aa  272  9e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1715  hypothetical protein  38.31 
 
 		 377 aa  272  1e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2159  protein of unknown function DUF482  37.95 
 
 		 410 aa  271  2e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.296465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1347  hypothetical protein  37.68 
 
 		 394 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.452511  normal  0.193359 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1116  protein of unknown function DUF482  36.3 
 
 		 389 aa  270  4e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.492606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3397  hypothetical protein  36.3 
 
 		 389 aa  270  4e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.6252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2323  hypothetical protein  36.6 
 
 		 392 aa  270  4e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.471895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1896  hypothetical protein  38.52 
 
 		 374 aa  270  4e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.376681  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1425  hypothetical protein  38.22 
 
 		 374 aa  268  1e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345024 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1801  hypothetical protein  36.36 
 
 		 392 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2413  hypothetical protein  36.36 
 
 		 392 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4092  hypothetical protein  38.07 
 
 		 375 aa  267  2e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5740  hypothetical protein  36.6 
 
 		 392 aa  268  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3828  hypothetical protein  38.31 
 
 		 375 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.210412  normal  0.0118616 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0679  hypothetical protein  38.3 
 
 		 400 aa  266  4e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.321665 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2417  hypothetical protein  36.36 
 
 		 392 aa  266  5e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.673667  normal  0.0190965 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2611  hypothetical protein  37.71 
 
 		 415 aa  265  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2458  hypothetical protein  37.01 
 
 		 374 aa  265  1e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3011  hypothetical protein  34.92 
 
 		 392 aa  265  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.350718  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1586  hypothetical protein  34.92 
 
 		 392 aa  265  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.215515  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0740  hypothetical protein  34.92 
 
 		 441 aa  264  2e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.391728  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1241  hypothetical protein  34.92 
 
 		 464 aa  265  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2273  hypothetical protein  34.92 
 
 		 392 aa  264  2e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1083  hypothetical protein  34.92 
 
 		 441 aa  264  2e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1088  hypothetical protein  34.92 
 
 		 441 aa  264  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.267189  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2170  hypothetical protein  34.94 
 
 		 390 aa  262  8e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.164145  hitchhiker  0.00000155889 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1377  hypothetical protein  36.24 
 
 		 397 aa  260  4e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0881  hypothetical protein  35.11 
 
 		 410 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.642732  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2359  protein of unknown function DUF482  35.86 
 
 		 393 aa  259  8e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.597494  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1793  hypothetical protein  38.82 
 
 		 382 aa  257  2e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.426104  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3103  hypothetical protein  38.61 
 
 		 376 aa  256  5e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.73421  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0657  hypothetical protein  37.53 
 
 		 373 aa  256  6e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2802  hypothetical protein  37.35 
 
 		 398 aa  255  8e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0294833  normal  0.670826 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1140  hypothetical protein  34.74 
 
 		 394 aa  255  9e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0804  hypothetical protein  36.43 
 
 		 402 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0943  hypothetical protein  35.97 
 
 		 380 aa  253  4.0000000000000004e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.118065  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3885  protein of unknown function DUF482  37.41 
 
 		 411 aa  253  4.0000000000000004e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.854025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1760  hypothetical protein  36.19 
 
 		 406 aa  253  4.0000000000000004e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4753  hypothetical protein  35.52 
 
 		 402 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.51971 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1736  hypothetical protein  35.93 
 
 		 414 aa  253  5.000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.327747 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1444  protein of unknown function DUF482  35.61 
 
 		 411 aa  252  7e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1962  protein of unknown function DUF482  35.96 
 
 		 456 aa  252  9.000000000000001e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.846465  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0316  hypothetical protein  34.53 
 
 		 445 aa  252  9.000000000000001e-66  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2025  hypothetical protein  34.42 
 
 		 405 aa  252  9.000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3315  hypothetical protein  36.34 
 
 		 406 aa  252  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.479503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2734  hypothetical protein  37.18 
 
 		 385 aa  251  1e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3121  hypothetical protein  36.83 
 
 		 438 aa  252  1e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2406  hypothetical protein  35.9 
 
 		 411 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.688762  normal  0.186145 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1708  hypothetical protein  34.92 
 
 		 418 aa  251  2e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4593  hypothetical protein  36.74 
 
 		 405 aa  250  4e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.218764 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3005  hypothetical protein  38.44 
 
 		 383 aa  249  8e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.275105 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0822  hypothetical protein  35.56 
 
 		 390 aa  249  8e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.295229  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2322  hypothetical protein  38 
 
 		 427 aa  248  2e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.483949 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2085  hypothetical protein  35.22 
 
 		 446 aa  248  2e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.817202  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1167  hypothetical protein  34.27 
 
 		 395 aa  247  3e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0877771  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4685  protein of unknown function DUF482  37.09 
 
 		 406 aa  246  4e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0288  hypothetical protein  35.03 
 
 		 450 aa  246  4.9999999999999997e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4316  hypothetical protein  37.09 
 
 		 406 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.371847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0166  protein of unknown function DUF482  35.5 
 
 		 405 aa  246  6e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0717665  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1124  hypothetical protein  33.8 
 
 		 395 aa  246  6.999999999999999e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.326303  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2533  hypothetical protein  34.27 
 
 		 402 aa  245  9.999999999999999e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.941945  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1294  hypothetical protein  36.53 
 
 		 393 aa  244  1.9999999999999999e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.724983  normal  0.811045 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4833  protein of unknown function DUF482  37.09 
 
 		 406 aa  244  3e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.261808  normal  0.379038 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1425  hypothetical protein  35.77 
 
 		 414 aa  243  3.9999999999999997e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.625932  normal  0.472174 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2105  hypothetical protein  35.61 
 
 		 438 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.261264  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2450  hypothetical protein  36.02 
 
 		 417 aa  243  6e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.456626  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3045  hypothetical protein  35.75 
 
 		 411 aa  242  7e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.452075 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>