19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4955 on replicon NC_009829
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009829  Spro_4955  hypothetical protein  100 
 
 		 616 aa  1251    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0194752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0865  tail fiber repeat 2-containing protein  36.07 
 
 		 554 aa  189  9e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0127303 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1333  phage-related tail fiber protein  42.18 
 
 		 790 aa  164  7e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4853  hypothetical protein  45.98 
 
 		 536 aa  160  7e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0190  hypothetical protein  46.51 
 
 		 569 aa  156  9e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.872884 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0889  hypothetical protein  47.13 
 
 		 656 aa  154  2.9999999999999998e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1159  hypothetical protein  42.86 
 
 		 530 aa  144  3e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0356  hypothetical protein  42.86 
 
 		 323 aa  144  5e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1137  hypothetical protein  42.29 
 
 		 530 aa  142  1.9999999999999998e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.757032  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01348  hypothetical protein  42.39 
 
 		 501 aa  142  1.9999999999999998e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106689  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0398  hypothetical protein  42.29 
 
 		 530 aa  142  1.9999999999999998e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.738816  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1209  putative pyocin R2_PP, tail fiber protein  31.75 
 
 		 228 aa  75.1  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00391701 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5519  hypothetical protein  51.69 
 
 		 399 aa  71.6  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3056  pyocin R2_PP, tail fiber protein, putative  34.07 
 
 		 292 aa  64.7  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.172022 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4381  gp19  28.23 
 
 		 580 aa  54.7  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0427744  hitchhiker  0.000225609 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3328  hypothetical protein  37.5 
 
 		 568 aa  53.9  0.000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.607345  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1305  tail fiber protein, putative  28.18 
 
 		 505 aa  49.7  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000211042 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0710  side tail fiber protein  37.88 
 
 		 892 aa  44.3  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.116846  normal  0.0178865 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1178  side tail fiber protein  39.68 
 
 		 510 aa  43.9  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.205878  normal  0.102671 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>