216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2963 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_2963  flagellar basal body P-ring protein  100 
 
 		 366 aa  719    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.863915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2005  flagellar basal body P-ring protein  88.09 
 
 		 369 aa  607  1e-173  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2317  flagellar basal body P-ring protein  88.09 
 
 		 369 aa  607  1e-173  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2418  flagellar basal body P-ring protein  88.09 
 
 		 369 aa  607  1e-173  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.097185  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2591  flagellar basal body P-ring protein  84 
 
 		 369 aa  566  1e-160  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1875  flagellar basal body P-ring protein  82.6 
 
 		 369 aa  567  1e-160  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.898271  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1293  flagellar basal body P-ring protein  80.44 
 
 		 365 aa  528  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.160652  hitchhiker  0.00453741 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2007  flagellar basal body P-ring protein  80.44 
 
 		 365 aa  528  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0317412  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2191  flagellar basal body P-ring protein  80.44 
 
 		 365 aa  528  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000395183 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1249  flagellar basal body P-ring protein  80.44 
 
 		 365 aa  528  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.392186 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1278  flagellar basal body P-ring protein  80.44 
 
 		 365 aa  528  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286836 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2520  flagellar basal body P-ring protein  80.17 
 
 		 365 aa  525  1e-148  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00323663 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1203  flagellar basal body P-ring protein  80.17 
 
 		 365 aa  525  1e-148  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0939901  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1560  flagellar basal body P-ring protein  78.02 
 
 		 369 aa  527  1e-148  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.750011  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01076  flagellar P-ring protein precursor I  80.17 
 
 		 365 aa  523  1e-147  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.874224  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2566  flagellar P-ring protein  80.17 
 
 		 365 aa  523  1e-147  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.128846  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1459  flagellar basal body P-ring protein  79.89 
 
 		 365 aa  523  1e-147  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.31008  hitchhiker  0.000149159 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1203  flagellar basal body P-ring protein  80.17 
 
 		 365 aa  523  1e-147  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01084  hypothetical protein  80.17 
 
 		 365 aa  523  1e-147  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.981614  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2048  flagellar basal body P-ring protein  79.89 
 
 		 365 aa  522  1e-147  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.159552  normal  0.112526 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1594  flagellar basal body P-ring protein  79.1 
 
 		 358 aa  506  9.999999999999999e-143  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1532  flagellar basal body P-ring protein  72.33 
 
 		 369 aa  474  1e-133  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.760833  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5632  flagellar basal body P-ring protein  63.81 
 
 		 392 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.347995  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3741  flagellar basal body P-ring protein  64.18 
 
 		 394 aa  441  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.713349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1971  flagellar basal body P-ring protein  61.58 
 
 		 369 aa  435  1e-121  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6364  flagellar basal body P-ring protein  61.99 
 
 		 392 aa  429  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2404  flagellar basal body P-ring protein  63.33 
 
 		 391 aa  430  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3018  flagellar basal body P-ring protein  63.33 
 
 		 391 aa  430  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0546214  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3037  flagellar basal body P-ring protein  63.33 
 
 		 391 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3332  flagellar basal body P-ring protein  63.87 
 
 		 397 aa  427  1e-118  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0469  flagellar basal body P-ring protein  63.87 
 
 		 397 aa  427  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0247  flagellar basal body P-ring protein  63.59 
 
 		 401 aa  426  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3063  flagellar basal body P-ring protein  63.23 
 
 		 392 aa  426  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3001  flagellar basal body P-ring protein  63.87 
 
 		 401 aa  427  1e-118  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2928  flagellar basal body P-ring protein  63.23 
 
 		 394 aa  426  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2092  flagellar basal body P-ring protein  63.87 
 
 		 400 aa  427  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0273  flagellar basal body P-ring protein  63.87 
 
 		 400 aa  427  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.573769  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0285  flagellar basal body P-ring protein  63.87 
 
 		 401 aa  427  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.394102  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3347  flagellar basal body P-ring protein  63.87 
 
 		 394 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4192  flagellar P-ring protein  64.02 
 
 		 377 aa  426  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3013  flagellar basal body P-ring protein  61.02 
 
 		 390 aa  422  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1328  flagellar basal body P-ring protein  59.23 
 
 		 377 aa  417  9.999999999999999e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0349  flagellar basal body P-ring protein  61.03 
 
 		 369 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.196884  normal  0.238944 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24070  flagellar basal body P-ring protein  59.71 
 
 		 385 aa  403  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2917  flagellar basal body P-ring protein  59.73 
 
 		 374 aa  399  9.999999999999999e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0476897  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2955  flagellar basal body P-ring protein  60.27 
 
 		 395 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.468199 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2727  flagellar basal body P-ring protein  57.1 
 
 		 392 aa  395  1e-109  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000228637 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0147  flagellar basal body P-ring protein  60.44 
 
 		 398 aa  392  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4784  flagellar basal body P-ring protein  59.67 
 
 		 372 aa  388  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.341084 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3707  flagellar basal body P-ring protein  59.67 
 
 		 372 aa  388  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0982974 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3787  flagellar basal body P-ring protein  61.06 
 
 		 395 aa  387  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1630  flagellar basal body P-ring protein  59.03 
 
 		 365 aa  384  1e-105  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.891214  normal  0.646517 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1961  flagellar basal body P-ring protein  57.93 
 
 		 368 aa  382  1e-105  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0756  flagellar basal body P-ring protein  59.24 
 
 		 364 aa  357  9.999999999999999e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3066  flagellar basal body P-ring protein  57.59 
 
 		 384 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.405902  normal  0.219474 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1224  flagellar P-ring protein  51.19 
 
 		 380 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.794178  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0562  flagellar basal body P-ring protein  54.55 
 
 		 385 aa  351  8.999999999999999e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3721  flagellar basal body P-ring protein  54.13 
 
 		 381 aa  350  2e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143633  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0626  flagellar basal body P-ring protein  51.34 
 
 		 382 aa  350  2e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0933  flagellar P-ring protein  52.74 
 
 		 401 aa  348  6e-95  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.382619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2843  flagellar basal body P-ring protein  51.27 
 
 		 386 aa  348  6e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.251575  normal  0.108847 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1769  flagellar P-ring protein  50.13 
 
 		 372 aa  348  9e-95  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4428  flagellar basal body P-ring protein  55.14 
 
 		 388 aa  347  2e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3835  flagellar basal body P-ring protein  54.31 
 
 		 374 aa  343  4e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.98017 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3108  flagellar basal body P-ring protein  54.02 
 
 		 374 aa  340  2e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.043594  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1899  flagellar basal body P-ring protein  48.62 
 
 		 376 aa  337  9.999999999999999e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.046577 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2206  flagellar basal body P-ring protein  50 
 
 		 379 aa  337  9.999999999999999e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.988864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0900  flagellar basal body P-ring protein  50.57 
 
 		 376 aa  337  1.9999999999999998e-91  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2371  flagellar basal body P-ring protein  48.76 
 
 		 367 aa  336  2.9999999999999997e-91  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1504  flagellar basal body P-ring protein  49.86 
 
 		 362 aa  334  2e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3724  flagellar basal body P-ring protein  48.08 
 
 		 369 aa  333  3e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01005  flagellar basal body P-ring protein  49.18 
 
 		 372 aa  331  1e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.185766  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06161  flagellar basal body P-ring protein  49.18 
 
 		 372 aa  331  1e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0591048  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4383  flagellar basal body P-ring protein  47.14 
 
 		 369 aa  331  2e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.849303 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1472  flagellar basal body P-ring protein  47.14 
 
 		 369 aa  331  2e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.01106  normal  0.415851 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4293  flagellar basal body P-ring protein  50.29 
 
 		 369 aa  330  3e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50410  flagellar basal body P-ring protein  50.29 
 
 		 369 aa  330  3e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000700308 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01294  flagellar basal body P-ring protein  48.77 
 
 		 363 aa  327  3e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1942  flagellar P-ring protein FlgI  47.41 
 
 		 369 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.152396  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3944  flagellar basal body P-ring protein  47.8 
 
 		 371 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1467  flagellar basal body P-ring protein  49.86 
 
 		 366 aa  325  8.000000000000001e-88  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3473  flagellar basal body P-ring protein  47.41 
 
 		 369 aa  325  1e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.813313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2331  flagellar basal body P-ring protein  47.7 
 
 		 373 aa  320  1.9999999999999998e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1785  flagellar basal body P-ring protein  49.14 
 
 		 361 aa  317  2e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1109  flagellar basal body P-ring protein  46.96 
 
 		 365 aa  313  1.9999999999999998e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0213  flagellar basal body P-ring protein  46.32 
 
 		 364 aa  309  4e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.613431  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1231  flagellar basal body P-ring protein  47.97 
 
 		 367 aa  305  1.0000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1231  flagellar basal body P-ring protein  48.24 
 
 		 367 aa  305  1.0000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3576  flagellar P-ring protein  43.87 
 
 		 362 aa  302  7.000000000000001e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.453837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1347  flagellar basal body P-ring protein  45.65 
 
 		 364 aa  299  6e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0220  flagellar basal body P-ring protein  46.01 
 
 		 391 aa  298  9e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0597  flagellar P-ring protein  44.44 
 
 		 369 aa  297  2e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0434  flagellar basal body P-ring protein  45.26 
 
 		 365 aa  295  9e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3047  flagellar basal body P-ring protein  46.57 
 
 		 368 aa  295  1e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.805391  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1352  flagellar basal body P-ring protein  45.9 
 
 		 363 aa  294  1e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1604  flagellar basal body P-ring protein  46.84 
 
 		 363 aa  293  2e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0616045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1153  flagellar basal body P-ring protein  43.59 
 
 		 367 aa  293  4e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0646  flagellar basal body P-ring protein  45.43 
 
 		 372 aa  293  4e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3242  flagellar basal body P-ring protein  44.69 
 
 		 363 aa  292  7e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1336  flagellar basal body P-ring protein  44.96 
 
 		 363 aa  291  1e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.525149  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>