More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2692 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_2692  carbohydrate kinase FGGY  100 
 
 
480 aa  996    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0288488  hitchhiker  0.00183322 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45190  putative glycerol kinase  51.36 
 
 
471 aa  486  1e-136  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0889637  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1680  carbohydrate kinase, FGGY  49.56 
 
 
484 aa  424  1e-117  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.450343  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1429  glycerol kinase  36.98 
 
 
479 aa  329  7e-89  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0184137  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3376  glycerol kinase  38.6 
 
 
495 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0870  glycerol kinase  37.17 
 
 
495 aa  320  3.9999999999999996e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.758789 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2522  glycerol kinase  38.99 
 
 
505 aa  313  2.9999999999999996e-84  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0437  glycerol kinase  36.66 
 
 
520 aa  310  2.9999999999999997e-83  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000112542  decreased coverage  0.00471602 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1322  glycerol kinase  35.32 
 
 
496 aa  310  5e-83  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.537601  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3649  glycerol kinase  39.22 
 
 
499 aa  309  6.999999999999999e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0787  glycerol kinase  38.67 
 
 
500 aa  309  8e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.856633  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1364  glycerol kinase  35.11 
 
 
496 aa  309  8e-83  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1029  glycerol kinase  38.67 
 
 
496 aa  308  1.0000000000000001e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.21153 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08090  glycerol kinase  38.69 
 
 
499 aa  308  1.0000000000000001e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000058898  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0682  glycerol kinase  38.46 
 
 
505 aa  307  3e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0390  glycerol kinase  36.49 
 
 
494 aa  307  3e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3533  glycerol kinase  39.46 
 
 
499 aa  307  3e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.904687  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0391  glycerol kinase  36.49 
 
 
494 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1122  glycerol kinase  34.06 
 
 
513 aa  306  5.0000000000000004e-82  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0402  glycerol kinase  36.49 
 
 
494 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000703202 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0416  glycerol kinase  36.29 
 
 
494 aa  306  6e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000135699 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0476  glycerol kinase  36.29 
 
 
494 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2059  glycerol kinase  35.48 
 
 
507 aa  305  1.0000000000000001e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000191654  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0373  glycerol kinase  38.24 
 
 
494 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3583  glycerol kinase  38.24 
 
 
494 aa  304  3.0000000000000004e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3756  glycerol kinase  36 
 
 
494 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0928777 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1472  glycerol kinase  34.71 
 
 
510 aa  303  5.000000000000001e-81  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4230  glycerol kinase  36.22 
 
 
494 aa  302  9e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6006  glycerol kinase  38.24 
 
 
505 aa  301  1e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0794993  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1347  glycerol kinase  39.68 
 
 
498 aa  301  2e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0455293  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0807  glycerol kinase  37.14 
 
 
496 aa  301  2e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000315642  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0948  glycerol kinase  37.36 
 
 
496 aa  301  2e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000269449  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1916  glycerol kinase  37.14 
 
 
496 aa  301  3e-80  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0267705  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2963  glycerol kinase  37.5 
 
 
513 aa  301  3e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0619  glycerol kinase  37.8 
 
 
500 aa  300  4e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0617  glycerol kinase  38.24 
 
 
489 aa  300  4e-80  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0240  glycerol kinase  37.32 
 
 
503 aa  300  5e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.329761  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0906  glycerol kinase  37.32 
 
 
503 aa  300  5e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0409  glycerol kinase  35.86 
 
 
481 aa  299  6e-80  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0739  glycerol kinase  37.32 
 
 
518 aa  299  6e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2452  glycerol kinase  37.32 
 
 
518 aa  299  6e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0107802  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3815  glycerol kinase  38.19 
 
 
498 aa  299  6e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0725  glycerol kinase  37.32 
 
 
518 aa  299  6e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.315112  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2706  glycerol kinase  37.32 
 
 
518 aa  299  6e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2371  glycerol kinase  37.32 
 
 
518 aa  299  6e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137405  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4168  glycerol kinase  35.15 
 
 
501 aa  299  7e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3905  glycerol kinase  34.95 
 
 
501 aa  299  7e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.969738 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0419  glycerol kinase  37.28 
 
 
499 aa  299  8e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.33105 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0078  glycerol kinase  36.58 
 
 
507 aa  299  8e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.503423  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1075  glycerol kinase  36.4 
 
 
499 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3803  glycerol kinase  36.22 
 
 
503 aa  298  1e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0599  glycerol kinase  37.01 
 
 
500 aa  298  1e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2707  glycerol kinase  37.8 
 
 
500 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.160178  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06800  glycerol kinase  36.18 
 
 
505 aa  298  1e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.998961  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3683  glycerol kinase  38.16 
 
 
489 aa  298  1e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.625574  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3321  glycerol kinase  37.22 
 
 
499 aa  298  1e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.24675 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2067  glycerol kinase  37.8 
 
 
500 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.469281  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17960  glycerol kinase  38.22 
 
 
505 aa  298  1e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.155837  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2678  glycerol kinase  37.8 
 
 
500 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1065  glycerol kinase  35.78 
 
 
500 aa  298  1e-79  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000150653  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23050  glycerol kinase  38.12 
 
 
510 aa  298  2e-79  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1465  glycerol kinase  38.48 
 
 
505 aa  297  2e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1798  glycerol kinase  39.13 
 
 
502 aa  298  2e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.603788  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2675  glycerol kinase  36.92 
 
 
498 aa  297  2e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.732872  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1561  glycerol kinase  35.8 
 
 
505 aa  298  2e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3168  glycerol kinase  36.4 
 
 
507 aa  297  3e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.119094  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03811  glycerol kinase  36.04 
 
 
502 aa  296  5e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4059  glycerol kinase  36.04 
 
 
502 aa  296  5e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4092  glycerol kinase  36.04 
 
 
502 aa  296  5e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4460  glycerol kinase  36.04 
 
 
502 aa  296  5e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3345  glycerol kinase  36.16 
 
 
495 aa  296  5e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0284  glycerol kinase  34.28 
 
 
498 aa  296  5e-79  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4157  glycerol kinase  36.04 
 
 
502 aa  296  5e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4366  glycerol kinase  36.04 
 
 
502 aa  296  5e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.569877 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5381  glycerol kinase  36.04 
 
 
502 aa  296  5e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03760  hypothetical protein  36.04 
 
 
502 aa  296  5e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2731  glycerol kinase  37.36 
 
 
500 aa  296  7e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1268  glycerol kinase  36.91 
 
 
496 aa  295  8e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000199841  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0638  glycerol kinase  36.78 
 
 
499 aa  295  8e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4337  glycerol kinase  36.2 
 
 
499 aa  296  8e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0867  glycerol kinase  35.35 
 
 
499 aa  295  9e-79  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.111674  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4408  glycerol kinase  36.04 
 
 
502 aa  295  9e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1116  glycerol kinase  36.2 
 
 
499 aa  295  9e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.151406  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2603  glycerol kinase  37.36 
 
 
500 aa  295  9e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.817773  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0947  glycerol kinase  37.14 
 
 
496 aa  295  1e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000337015  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1106  glycerol kinase  37.14 
 
 
496 aa  295  1e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23662e-43 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0055  glycerol kinase  39.82 
 
 
501 aa  295  1e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1195  glycerol kinase  37.14 
 
 
496 aa  295  1e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000355688  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1063  glycerol kinase  37.11 
 
 
503 aa  295  1e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0902987  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0485  glycerol kinase  35.96 
 
 
505 aa  295  1e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.361575  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1803  glycerol kinase  36.18 
 
 
509 aa  295  1e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0938  glycerol kinase  37.14 
 
 
496 aa  294  2e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000262863  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1020  glycerol kinase  36.24 
 
 
497 aa  294  2e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0108  glycerol kinase  36.2 
 
 
503 aa  295  2e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.903611  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1395  glycerol kinase  38.43 
 
 
505 aa  294  2e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000530901  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4233  glycerol kinase  37.14 
 
 
496 aa  295  2e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000910223  decreased coverage  0.00000000961259 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4047  glycerol kinase  36.04 
 
 
502 aa  295  2e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1066  glycerol kinase  37.14 
 
 
496 aa  295  2e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000818027  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2559  glycerol kinase  34.14 
 
 
500 aa  294  2e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0934  glycerol kinase  36.4 
 
 
527 aa  294  2e-78  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.16649  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>