26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2330 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_2330  putative lipoprotein  100 
 
 
244 aa  499  1e-140  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0461141  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1273  putative lipoprotein  47.33 
 
 
282 aa  190  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.958512 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1194  putative lipoprotein  47.33 
 
 
280 aa  189  5e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1101  putative lipoprotein  47.33 
 
 
280 aa  188  5.999999999999999e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6128  putative lipoprotein  41.2 
 
 
305 aa  159  5e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.413679  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2076  putative lipoprotein  41.04 
 
 
276 aa  146  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.128092  normal  0.436736 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3752  putative lipoprotein  42.49 
 
 
250 aa  143  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1964  putative lipoprotein  42.99 
 
 
247 aa  142  6e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0700691  hitchhiker  0.0000413704 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2411  hypothetical protein  36.55 
 
 
246 aa  135  5e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3486  putative lipoprotein  38.75 
 
 
271 aa  130  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1144  putative lipoprotein  34.6 
 
 
258 aa  118  9e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4640  putative lipoprotein  36.51 
 
 
277 aa  112  7.000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0160  putative lipoprotein  39.02 
 
 
251 aa  108  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0247  hypothetical protein  48.15 
 
 
241 aa  57  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1552  2-phosphosulfolactate phosphatase  27.86 
 
 
231 aa  55.1  0.0000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0473  2-phosphosulfolactate phosphatase  25.59 
 
 
261 aa  51.2  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1805  2-phosphosulfolactate phosphatase  26.79 
 
 
249 aa  50.8  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.191126  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0129  2-phosphosulfolactate phosphatase  25.45 
 
 
227 aa  50.4  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.774772  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0131  2-phosphosulfolactate phosphatase  23.96 
 
 
227 aa  49.7  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0750  2-phosphosulfolactate phosphatase  28.51 
 
 
282 aa  48.5  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.158423  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0539  2-phosphosulfolactate phosphatase  24.41 
 
 
240 aa  48.5  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0377  2-phosphosulfolactate phosphatase  25.38 
 
 
219 aa  47.8  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.622217  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1051  2-phosphosulfolactate phosphatase  22.33 
 
 
241 aa  47.8  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00427368  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2178  hypothetical protein  29.31 
 
 
246 aa  45.8  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06701  2-phosphosulfolactate phosphatase  23.38 
 
 
249 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.284053  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0013  hypothetical protein  29.93 
 
 
256 aa  43.9  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.374843 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>