73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0240 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_0240  carboxylate/amino acid/amine transporter  100 
 
 		 287 aa  569  1e-161  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.214328 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3954  carboxylate/amino acid/amine transporter  86.57 
 
 		 299 aa  488  1e-137  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0263  carboxylate/amino acid/amine transporter  86.57 
 
 		 299 aa  488  1e-137  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3969  carboxylate/amino acid/amine transporter  81.27 
 
 		 299 aa  473  1e-132  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4152  carboxylate/amino acid/amine transporter  76.68 
 
 		 299 aa  451  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4181  carboxylate/amino acid/amine transporter  76.68 
 
 		 299 aa  451  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0864049 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4349  10 TMS drug/metabolite exporter (DME) family protein  76.68 
 
 		 299 aa  451  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4051  10 TMS drug/metabolite exporter (DME) family protein  76.68 
 
 		 299 aa  451  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4194  10 TMS drug/metabolite exporter (DME) family protein  76.68 
 
 		 299 aa  450  1e-125  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00209407 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4294  10 TMS Drug/Metabolite Exporter (DME) family  76.33 
 
 		 299 aa  449  1e-125  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03655  hypothetical protein  76.68 
 
 		 299 aa  450  1e-125  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03706  predicted inner membrane protein  76.68 
 
 		 299 aa  450  1e-125  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4358  carboxylate/amino acid/amine transporter  74.2 
 
 		 299 aa  433  1e-120  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4075  carboxylate/amino acid/amine transporter  73.85 
 
 		 299 aa  428  1e-119  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.126831  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3936  carboxylate/amino acid/amine transporter  73.02 
 
 		 318 aa  416  9.999999999999999e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0183  carboxylate/amino acid/amine transporter  73.14 
 
 		 299 aa  408  1e-113  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001947  putative acetate efflux pump MadN  56.29 
 
 		 292 aa  318  9e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2439  MadN protein  55.59 
 
 		 295 aa  315  4e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00531  permease  55.59 
 
 		 292 aa  316  4e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1235  carboxylate/amino acid/amine transporter  55.87 
 
 		 291 aa  311  5.999999999999999e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1920  inner membrane protein  55.35 
 
 		 284 aa  304  9.000000000000001e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0119644  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2726  hypothetical protein  52.5 
 
 		 286 aa  294  1e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.054013  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3134  hypothetical protein  51.48 
 
 		 292 aa  294  1e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01531  putative MadN protein  51.57 
 
 		 287 aa  290  2e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.997992  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1302  MadN protein  53.19 
 
 		 291 aa  281  1e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2175  protein of unknown function DUF6 transmembrane  49.46 
 
 		 289 aa  279  4e-74  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000121987  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0261  hypothetical protein  54.61 
 
 		 290 aa  274  2.0000000000000002e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1236  hypothetical protein  51.53 
 
 		 265 aa  273  2.0000000000000002e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.294327  normal  0.0827717 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1652  hypothetical protein  56.27 
 
 		 286 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19150  hypothetical protein  56.63 
 
 		 286 aa  273  3e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.475633 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0684  hypothetical protein  49.82 
 
 		 287 aa  272  5.000000000000001e-72  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1597  hypothetical protein  51.8 
 
 		 292 aa  269  4e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.483215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1433  carboxylate/amino acid/amine transporter  49.3 
 
 		 293 aa  264  1e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.720857  normal  0.464968 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1276  hypothetical protein  46.07 
 
 		 288 aa  264  1e-69  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00521241  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0339  hypothetical protein  52.52 
 
 		 292 aa  256  3e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.252118  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1354  carboxylate/amino acid/amine transporter  49.3 
 
 		 291 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.117278 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4537  carboxylate/amino acid/amine transporter  49.3 
 
 		 291 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.778946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3830  carboxylate/amino acid/amine transporter  47.18 
 
 		 291 aa  245  6.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.714996 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4083  hypothetical protein  47.46 
 
 		 292 aa  244  9e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.114876  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4043  carboxylate/amino acid/amine transporter  47.1 
 
 		 291 aa  242  6e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.791434 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1301  carboxylate/amino acid/amine transporter  53.09 
 
 		 290 aa  239  4e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.546965 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3822  hypothetical protein  47.1 
 
 		 292 aa  231  1e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0047105 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0974  conserved hypothetical protein, MadN family (DUF6 domain protein)  38.04 
 
 		 292 aa  192  4e-48  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.634271  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2636  hypothetical protein  37.15 
 
 		 286 aa  161  1e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1849  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.68 
 
 		 302 aa  122  8e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4486  DMT family permease  23.55 
 
 		 304 aa  62  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1702  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.67 
 
 		 302 aa  55.5  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.352845  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4998  hypothetical protein  27.01 
 
 		 300 aa  52.8  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.390809  normal  0.999953 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  23.99 
 
 		 315 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3468  hypothetical protein  25.52 
 
 		 297 aa  49.7  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.63 
 
 		 292 aa  49.3  0.00007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2202  membrane protein  25.88 
 
 		 296 aa  48.1  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00337301  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1614  hypothetical protein  29.51 
 
 		 270 aa  47.8  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.90138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3079  hypothetical protein  24.71 
 
 		 296 aa  47.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.334626  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1277  hypothetical protein  24.08 
 
 		 310 aa  45.8  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.507228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  25.11 
 
 		 274 aa  45.4  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1695  hypothetical protein  22.79 
 
 		 311 aa  44.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19920  predicted permease, DMT superfamily  23.5 
 
 		 331 aa  44.3  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.185467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3922  hypothetical protein  29.33 
 
 		 296 aa  45.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.939787 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1828  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.34 
 
 		 310 aa  44.7  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000133968  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2782  hypothetical protein  27.37 
 
 		 286 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0548906  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2288  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.09 
 
 		 302 aa  43.5  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000440436 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1646  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.98 
 
 		 315 aa  43.5  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0031  drug/metabolite transporter  25 
 
 		 294 aa  43.5  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6822  normal  0.556158 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0394  hypothetical protein  26.67 
 
 		 298 aa  43.5  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.236549  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0154  drug/metabolite transporter  25 
 
 		 294 aa  43.5  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.98831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0346  hypothetical protein  28.67 
 
 		 296 aa  43.1  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.548669  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0830  hypothetical protein  28.67 
 
 		 296 aa  43.1  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.100508  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.1 
 
 		 325 aa  43.1  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0799  hypothetical protein  28.67 
 
 		 296 aa  43.1  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.818356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3320  hypothetical protein  25 
 
 		 290 aa  42.7  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000781586  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0073  hypothetical protein  23.14 
 
 		 282 aa  42.7  0.007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4849  drug/metabolite transporter (DMT) superfamily permease  26.25 
 
 		 297 aa  42.4  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.551565  normal  0.306112 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>