More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_4230 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_4230  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  100 
 
 
283 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4290  phosphate ABC transporter, permease protein  86.64 
 
 
278 aa  483  1e-135  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2590  ABC phosphate transporter inner membrane protein PstA  82.08 
 
 
281 aa  452  1.0000000000000001e-126  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00589787  normal  0.413693 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2120  phosphate ABC transporter, permease protein  71.53 
 
 
284 aa  408  1e-113  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001264  phosphate transport system permease protein PstA  69.75 
 
 
287 aa  405  1.0000000000000001e-112  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0067  phosphate ABC transporter, permease protein  70.14 
 
 
289 aa  402  1e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.191661  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05139  molybdate ABC transporter permease protein  69.4 
 
 
287 aa  403  1e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0606  phosphate ABC transporter, permease protein  49.82 
 
 
274 aa  262  4.999999999999999e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.32336  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2104  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  50.55 
 
 
282 aa  262  6e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0620  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  49.46 
 
 
274 aa  260  2e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.363148  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1163  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  51.75 
 
 
280 aa  252  4.0000000000000004e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2832  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  44.79 
 
 
294 aa  236  4e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1669  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  46.93 
 
 
278 aa  224  1e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000331352  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1095  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  48.43 
 
 
282 aa  223  2e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1964  phosphate ABC transporter, permease protein  45.42 
 
 
292 aa  223  3e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1603  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  43.93 
 
 
291 aa  223  3e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0162233  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0140  phosphate ABC transporter, permease protein  45.55 
 
 
283 aa  215  5e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2839  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  45.31 
 
 
596 aa  212  5.999999999999999e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0230  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  47.9 
 
 
283 aa  207  2e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_148  phosphate ABC transporter, permease protein  44.13 
 
 
283 aa  206  3e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2277  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  46.46 
 
 
646 aa  199  6e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1958  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  46.52 
 
 
287 aa  198  1.0000000000000001e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2565  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  44.21 
 
 
322 aa  197  2.0000000000000003e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0481  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  48.09 
 
 
645 aa  195  5.000000000000001e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1927  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  42.05 
 
 
294 aa  194  1e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0747671  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0582  phosphate ABC transporter permease  40.59 
 
 
277 aa  194  1e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1918  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  39.93 
 
 
604 aa  193  2e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.396887  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2982  phosphate ABC transporter permease  42.25 
 
 
649 aa  194  2e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1377  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  44.27 
 
 
270 aa  192  4e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000176933  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0454  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  38.65 
 
 
294 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1060  phosphate ABC transporter permease  44.44 
 
 
297 aa  186  4e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1117  hypothetical protein  40.5 
 
 
627 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0763  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  40.86 
 
 
309 aa  181  2e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.763641  normal  0.179278 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0750  ABC phosphate transporter, inner membrane subunit  40.28 
 
 
286 aa  176  3e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000021979  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2102  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  37.28 
 
 
284 aa  176  4e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21560  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  40.29 
 
 
284 aa  176  4e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0093  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  40.93 
 
 
284 aa  175  7e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2888  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  41.28 
 
 
288 aa  175  9e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.107723 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4585  putative phosphate ABC transporter, permease protein  35.69 
 
 
306 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.206846 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0564  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  42.86 
 
 
306 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000405763  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1008  ABC-type phosphate transport system, permease component  34.39 
 
 
294 aa  173  2.9999999999999996e-42  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl234  phosphate ABC transporter permease component  37.94 
 
 
715 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0177  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  36.75 
 
 
307 aa  171  1e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0222  phosphate ABC transporter, permease protein  41.52 
 
 
478 aa  171  2e-41  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.017754  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2935  phosphate ABC transporter inner membrane subunit PstA  37.96 
 
 
297 aa  170  3e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0484  phosphate ABC transporter, permease, putative  36.88 
 
 
696 aa  169  6e-41  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0317247  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28120  phosphate ABC transporter membrane protein  39.01 
 
 
285 aa  168  7e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2394  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  33.92 
 
 
304 aa  168  8e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1953  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  37.3 
 
 
294 aa  168  9e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.22501  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1879  ABC-type phosphate transport system, permease component  35.49 
 
 
297 aa  168  9e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1570  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  37.05 
 
 
288 aa  167  2e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1680  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  39.52 
 
 
448 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.158794  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0349  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  37.05 
 
 
288 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.000182732 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4408  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  41.18 
 
 
280 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0197285  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0571  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  35.97 
 
 
289 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0990  phosphate ABC transporter, permease protein PstA, putative  33.91 
 
 
295 aa  165  5.9999999999999996e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.164904  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8333  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  36.82 
 
 
291 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.44466  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0558  ABC-type phosphate transport system, permease component  34.9 
 
 
298 aa  164  1.0000000000000001e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1993  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  36.54 
 
 
295 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0752  putative phosphate ABC transporter, permease protein  36.29 
 
 
306 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1566  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  38.08 
 
 
293 aa  162  5.0000000000000005e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0019112  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0633  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  35.36 
 
 
306 aa  162  6e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.454449  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0786  phosphate ABC transporter, permease protein, putative  35.52 
 
 
306 aa  161  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0683  phosphate ABC transporter permease  35.52 
 
 
306 aa  160  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0627  phosphate ABC transporter, permease  35.52 
 
 
306 aa  160  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0627  phosphate ABC transporter, permease  35.52 
 
 
306 aa  160  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0717  phosphate ABC transporter permease  35.52 
 
 
306 aa  160  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0772  putative phosphate ABC transporter, permease protein  35.52 
 
 
306 aa  160  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000179508 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0846  putative phosphate ABC transporter, permease protein  35.52 
 
 
306 aa  160  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.252754  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3424  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  38.02 
 
 
309 aa  161  1e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1930  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  42.47 
 
 
282 aa  160  2e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.19172  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0591  ABC-type phosphate transport system, permease component  33.33 
 
 
294 aa  160  2e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1040  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  38.91 
 
 
448 aa  160  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0221125  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0945  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  39.43 
 
 
449 aa  160  3e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.526436 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0981  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  40.79 
 
 
305 aa  159  7e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0889131 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1780  phosphate ABC transporter, permease protein  41.91 
 
 
307 aa  158  9e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1827  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  36.67 
 
 
297 aa  158  1e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.944674  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0549  ABC-type phosphate transport system, permease component  32.65 
 
 
296 aa  158  1e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00903188  hitchhiker  2.03288e-22 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0704  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  38.52 
 
 
290 aa  157  1e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0154936  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4261  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  35 
 
 
358 aa  158  1e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0487  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  35.97 
 
 
288 aa  157  1e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4004  ABC phosphate transporter, inner membrane subunit  38.52 
 
 
304 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.757198  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0605  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  35.77 
 
 
305 aa  157  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4120  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  38.91 
 
 
304 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1827  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  38.46 
 
 
270 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4146  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  38.52 
 
 
304 aa  155  6e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37640  phosphate ABC transporter membrane protein  35.52 
 
 
364 aa  155  6e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.124306 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2741  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  36.43 
 
 
281 aa  155  1e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1243  phosphate ABC transporter permease  39.84 
 
 
448 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.352421  normal  0.824545 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3505  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  38.2 
 
 
298 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0113  phosphate ABC transporter permease  34.71 
 
 
310 aa  153  2.9999999999999998e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21610  phosphate ABC transporter, permease protein PstC  47.37 
 
 
200 aa  152  4e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1618  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  46.02 
 
 
448 aa  152  5e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4263  phosphate ABC transporter permease  35.94 
 
 
354 aa  152  5e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4580  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  35.34 
 
 
294 aa  152  7e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.810093  normal  0.447387 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4078  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  33.1 
 
 
293 aa  152  8e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1251  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  34.27 
 
 
295 aa  151  8.999999999999999e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.181488  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1162  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  36.23 
 
 
284 aa  151  1e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2811  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  36.36 
 
 
293 aa  151  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.108044 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1235  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  39.43 
 
 
448 aa  151  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.229637 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>