52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2819 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0232  outer membrane protein  55.95 
 
 		 668 aa  765    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2229  outer membrane protein  52.08 
 
 		 667 aa  679    Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00516967  hitchhiker  0.0011455 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2819  outer membrane protein  100 
 
 		 674 aa  1383    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.216315  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1428  outer membrane protein  53.35 
 
 		 662 aa  710    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1403  outer membrane protein  56.7 
 
 		 668 aa  788    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0351  outer membrane protein  55.6 
 
 		 668 aa  769    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.132929 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3676  outer membrane protein  52.53 
 
 		 667 aa  689    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0267  outer membrane protein  52.31 
 
 		 667 aa  685    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0228  outer membrane protein  55.87 
 
 		 669 aa  782    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0626  outer membrane protein  53.06 
 
 		 662 aa  703    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3685  outer membrane protein  52.68 
 
 		 669 aa  749    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3129  outer membrane protein  54.72 
 
 		 668 aa  746    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2924  outer membrane protein  48.67 
 
 		 672 aa  624  1e-177  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2527  outer membrane protein precursor MtrB  40.54 
 
 		 699 aa  479  1e-134  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2150  outer membrane protein  39.21 
 
 		 669 aa  465  1e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0260254  normal  0.662224 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2700  outer membrane protein precursor MtrB  40.11 
 
 		 699 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.140373  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1523  outer membrane protein precursor MtrB  39.69 
 
 		 703 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.415633  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1776  outer membrane protein precursor MtrB  40.37 
 
 		 697 aa  450  1e-125  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3127  outer membrane protein precursor MtrB  40.11 
 
 		 698 aa  449  1e-125  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000335103 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1610  outer membrane protein precursor MtrB  39.09 
 
 		 695 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.170793 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2767  outer membrane protein precursor MtrB  38.95 
 
 		 695 aa  445  1e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.38459  decreased coverage  0.0000000195366 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1587  outer membrane protein precursor MtrB  39.09 
 
 		 695 aa  445  1e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.14869  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1576  outer membrane protein precursor MtrB  38.95 
 
 		 695 aa  444  1e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0247408  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2512  outer membrane protein precursor MtrB  40.65 
 
 		 695 aa  435  1e-120  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.481344  hitchhiker  0.00380912 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2678  outer membrane protein precursor MtrB  40.51 
 
 		 695 aa  432  1e-120  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0120666 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2580  outer membrane protein precursor MtrB  40.79 
 
 		 695 aa  435  1e-120  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0892811  normal  0.0284758 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1206  outer membrane protein precursor MtrB  38.46 
 
 		 693 aa  428  1e-118  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00712734  normal  0.823248 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1476  outer membrane protein precursor MtrB  39.61 
 
 		 704 aa  419  9.999999999999999e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0583388  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2639  outer membrane protein precursor MtrB  36.51 
 
 		 695 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.381518  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1306  outer membrane protein  36.35 
 
 		 672 aa  397  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179151 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1529  outer membrane protein, putative  31.28 
 
 		 711 aa  290  5.0000000000000004e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2693  outer membrane protein, putative  30.59 
 
 		 706 aa  287  4e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2575  outer membrane protein, putative  29.44 
 
 		 712 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.382223  normal  0.0100753 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2507  outer membrane protein, putative  29.58 
 
 		 712 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0767045  decreased coverage  0.000584641 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2673  outer membrane protein, putative  29.19 
 
 		 712 aa  282  1e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.335311  normal  0.0727867 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2762  outer membrane protein, putative  29.29 
 
 		 716 aa  278  3e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00885909  hitchhiker  0.000163865 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1592  outer membrane protein, putative  29.01 
 
 		 716 aa  275  3e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000338536  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2520  outer membrane protein, putative  30.49 
 
 		 703 aa  274  5.000000000000001e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.383126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1581  outer membrane protein, putative  28.73 
 
 		 716 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0408477  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1615  outer membrane protein, putative  28.59 
 
 		 716 aa  267  5.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.208848  normal  0.197166 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1781  outer membrane protein, putative  27.97 
 
 		 712 aa  261  3e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4359  outer membrane protein, putative  28.17 
 
 		 656 aa  247  4.9999999999999997e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1212  outer membrane protein, putative  28.73 
 
 		 698 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0360  hypothetical protein  28.23 
 
 		 565 aa  201  3.9999999999999996e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0310928  hitchhiker  0.00101277 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3860  hypothetical protein  28.66 
 
 		 573 aa  187  6e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00093801  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003778  outer membrane protein  25.53 
 
 		 660 aa  155  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2380  hypothetical protein  24.96 
 
 		 681 aa  152  3e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.573716  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1403  hypothetical protein  23.2 
 
 		 772 aa  79.3  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.142579  normal  0.0825928 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3627  hypothetical protein  21.47 
 
 		 835 aa  70.5  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0398  hypothetical protein  20.34 
 
 		 807 aa  69.3  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.513046 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4081  hypothetical protein  22.64 
 
 		 706 aa  64.3  0.000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0596135  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0816  hypothetical protein  24.59 
 
 		 810 aa  48.5  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>