15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2149 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_2149  enzyme  100 
 
 		 208 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3359  hypothetical protein  66.83 
 
 		 206 aa  288  3e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.17991 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3611  hypothetical protein  62.93 
 
 		 209 aa  274  6e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.492259  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0292  hypothetical protein  42.94 
 
 		 190 aa  134  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6884  hypothetical protein  38.62 
 
 		 192 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1296  hypothetical protein  29.09 
 
 		 165 aa  65.1  0.0000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0735417  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2029  hypothetical protein  31.61 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2525  hypothetical protein  32.59 
 
 		 159 aa  54.7  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.192284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1978  hypothetical protein  29.17 
 
 		 156 aa  50.4  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.335296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0536  hypothetical protein  27.34 
 
 		 181 aa  50.4  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3329  hypothetical protein  30.65 
 
 		 158 aa  45.8  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.254063  hitchhiker  0.00215501 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1465  hypothetical protein  28.46 
 
 		 149 aa  44.3  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.726298  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3293  hypothetical protein  26.98 
 
 		 156 aa  44.3  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.17015 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0361  hypothetical protein  30.43 
 
 		 163 aa  43.5  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.907929 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4109  hypothetical protein  40.91 
 
 		 138 aa  42  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>