22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5203 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5203  hypothetical protein  100 
 
 		 113 aa  226  1e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0516537  normal  0.258786 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1406  YCII-related protein  36.67 
 
 		 120 aa  62  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.48237  normal  0.318259 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0198  YCII-related protein  35.09 
 
 		 116 aa  56.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.569189  normal  0.0536776 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3323  YCII-related protein  34.43 
 
 		 120 aa  55.5  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0170058  normal  0.190231 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2719  DGPFAETKE family protein  32.5 
 
 		 119 aa  50.8  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.945599  normal  0.675282 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2715  DGPFAETKE family protein  30.77 
 
 		 126 aa  50.4  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.651883  normal  0.451277 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2235  YCII-related protein  35.19 
 
 		 117 aa  50.1  0.000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.346545  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3319  hypothetical protein  25.86 
 
 		 122 aa  48.1  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.419553  hitchhiker  0.0000411841 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0824  DGPFAETKE family protein  28.21 
 
 		 115 aa  47.8  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5460  hypothetical protein  26.67 
 
 		 120 aa  47.4  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.382977  normal  0.0527528 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3461  hypothetical protein  31.97 
 
 		 122 aa  46.2  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102255  hitchhiker  0.00155442 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5221  hypothetical protein  31.25 
 
 		 118 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4343  YCII-related protein  27.83 
 
 		 121 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.467101 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3855  hypothetical protein  31.03 
 
 		 119 aa  45.8  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.936414 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3192  YCII-related protein  32.14 
 
 		 115 aa  45.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.43848  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4454  DGPFAETKE domain-containing protein  27.83 
 
 		 122 aa  44.7  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4763  YCII-related protein  28.71 
 
 		 131 aa  44.3  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5546  DGPFAETKE family protein  31.2 
 
 		 132 aa  44.3  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112549  normal  0.266141 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4760  YCII-related protein  32.31 
 
 		 130 aa  43.5  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000445708  hitchhiker  0.000508919 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4492  hypothetical protein  30.43 
 
 		 122 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.891813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5220  hypothetical protein  30.43 
 
 		 122 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2256  YCII-related protein  33.33 
 
 		 115 aa  41.6  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>